长牡蛎性腺中调控型非编码RNA的生物信息学

发布时间：2022-09-30 10:14

　　本研究以日照海域同一家系的2龄长牡蛎性腺为研究对象,通过small RNA-seq和RNA-seq技术筛选和鉴定出大量的非编码微小RNA（mi RNA）、长链非编码RNA（lnc RNA）和环状RNA（circRNA）,并对其进行了生物学特征分析。结果显示,以斑马鱼为参考序列,获得25～30个已知miRNA成熟体和51～63个已知miRNA前体,预测到53～71个新miRNA成熟体和53～77个新miRNA前体;长牡蛎miRNA长度分布为18～26个核苷酸（nt）,其中分布在20～22 nt长度的miRNA数量最多,且miRNA首位碱基多为U。测序分析获得2 302～2 349个注释lncRNA转录本,预测到20 083～24 114个新lncRNA转录本,其中基因间型lncRNA（lincRNA）、内含子lncRNA（intronic lncRNA）、反义lncRNA（anti-sense lncRNA）分别占29.0%、62.1%和8.9%;长牡蛎lncRNA的基因组特征与其他真核生物的lncRNA基因组特征相似,与mRNA相比,外显子（exon）个数少,转录本长度较短,表达水平低... 

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【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3683367