大菱鲆早期性别分化及性别相关SNP位点筛选研究
发布时间：2022-12-04 01:10
本研究利用石蜡组织切片法结合性腺外形差异判别，实现了大菱鲆（Scophthalmus maximus L.）4月龄幼鱼的早期性别鉴别。利用此方法，对2013年构建的大菱鲆37个良种选育家系，共计4022尾4月龄的幼鱼进行了家系水平及群体水平的性别比例研究。随机挑选其中的20个家系，共计2254尾幼鱼进行了体重数据采集，利用SPSS17.0软件对大菱鲆4月龄幼鱼雌雄个体体重差异进行了统计分析。 从前期完成的大菱鲆性别特异性差异454转录组测序结果中，挑选524个预测SNP（Single Nucleotide Polymorphysim，单核苷酸多态性）位点，利用MassArray（MALDI-TOF MS Array，飞行质谱芯片）高通量SNP基因分型技术，以20个8月龄大菱鲆雌雄样本为材料，完成了398个454高通量转录组候选性别相关SNPs位点的筛选及分析验证。利用直接测序法对分布于6个contigs上的7组共35个SNPs位点进行了多态性验证及单倍型研究。结果如下： 1.解剖观察发现，4月龄大菱鲆幼鱼性腺位于后部膀胱与外侧体壁之间，雌性性腺呈短棒状，雄性性腺呈细长线状，...
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1. 大菱鲆养殖现状
2. 鱼类性别决定相关分子标记及基因的研究进展
2.1 RAPD 技术在鱼类性别研究中的应用
2.2 AFLP 技术在鱼类性别鉴定中的应用
2.3 SSR 技术在鱼类性别决定研究中的应用
3. 单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP）分子标记的检测方法
3.1 SNP 简介
3.2 SNP 的检测方法
4. SNP 在水产动物遗传育种中的应用
4.1 构建高密度遗传连锁图谱
4.2 性状关联分析
4.3 种群进化和亲缘关系的研究
5. 研究目的
第二章 大菱鲆 4 月龄幼鱼性别鉴定研究
1 材料与方法
1.1 实验鱼来源及培育
1.2 实验仪器
1.3 实验药品
1.4 方法
2 结果与分析
2.1 4 月龄大菱鲆幼鱼性别鉴别
2.2 大菱鲆幼鱼性腺外部形态变化
3 讨论
第三章 大菱四月龄幼鱼性比及雌雄体重差异分析
1 材料与方法
1.1 实验鱼及其培育方法
1.2 数据采集及分析
2 结果
2.1 4 月龄雌雄幼鱼的性别比例及χ_。~2测验
2.2 雌雄个体体重值差异分析
2.3 家系内雌雄个体平均体重差异分析
3 讨论
第四章 大菱鲆性别相关 SNP 位点的初步筛选
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.2 实验方法
2 结果与分析
2.1 基因组 DNA 质量检测及浓度测定
2.2 引物设计及 SNP 基因分型
2.3 SNP 位点多态性分析
2.4 SNP 筛选结果
3 讨论
3.1 多态性 SNP 位点的开发
3.2 SNP 位点筛选及分析
第五章 大菱鲆转录组 454 测序部分预测 SNP 位点验证分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果
2.1 基因组 DNA 的质量及浓度测定
2.2 SNP 位点筛选
2.3 PCR 扩增产物测序检测单倍型
2.4 单倍型与性别的关联分析
3 讨论
参考文献
附录
硕士在读期间发表文章
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国大菱鲆养殖20年成就和展望——庆祝大菱鲆引进中国20周年[J]. 雷霁霖,刘新富,关长涛. 渔业科学进展. 2012(04)
[2]醋酸洋红染色技术在大菱鲆幼鱼生理性别鉴定中的应用[J]. 韩伟国,刘新富,孟振,温海深,雷霁霖. 渔业科学进展. 2011(06)
[3]鳜脂蛋白脂酶基因SNP及其与食性驯化相关性分析[J]. 杨宇晖,梁旭方,方荣,彭敏燕,黄志东. 遗传. 2011(09)
[4]后基因组时代下作物的SNP分型方法[J]. 赵琼一,李信,周德贵,何飞,周少川,罗达. 分子植物育种. 2010(01)
[5]雌核发育与正常二倍体条斑星鲽胚胎发育比较研究[J]. 李忠红,刘海金,张世奎,姜秀凤,王玉芬. 水产科学. 2009(12)
[6]变性梯度凝胶电泳检测鲍曼不动杆菌中SHV基因单核苷酸多态性[J]. 张哲,许德义,蒋晓飞. 现代实用医学. 2009(08)
[7]运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073A/G单核苷酸多态性[J]. 王默进,周总光,王玲,李园,张鹏,张益,崔长富,周斌. 四川大学学报(医学版). 2009(02)
[8]大口黑鲈MyoD基因结构和单核苷酸多态性位点的筛选[J]. 于凌云,白俊杰,叶星,李胜杰,李小慧. 水产学报. 2009(01)
[9]大菱鲆（Scophthalmus maximus）幼鱼生长性状的遗传力及其相关性分析[J]. 马爱军,王新安,杨志,曲江波,雷霁霖. 海洋与湖沼. 2008(05)
[10]尼罗罗非鱼Sox基因PCR-SSCP分析[J]. 杨东,刘红艳,张繁荣,余来宁. 江西农业学报. 2008(09)
博士论文
[1]栉孔扇贝（Chlamys farreri）EST-SNP的开发及其应用[D]. 李纪勤.中国海洋大学 2012
硕士论文
[1]“黄海2号”中国对虾高通量SNP筛选及其与抗WSSV性状的关联分析[D]. 逄锦菲.上海海洋大学 2013
[2]大菱鲆幼鱼生长和耐高温性状的遗传参数估计与家系筛选[D]. 刘宝锁.上海海洋大学 2012
[3]大菱鲆性腺分化组织学和早期性别快速鉴定技术的研究[D]. 韩伟国.中国海洋大学 2011
[4]长牡蛎SNP标记的开发及多态性检测[D]. 王绍宗.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2009
[5]英国和西班牙进口大菱鲆杂交子一代的杂种优势分析[D]. 季士治.中国海洋大学 2006
本文编号：3707323
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1. 大菱鲆养殖现状
2. 鱼类性别决定相关分子标记及基因的研究进展
2.1 RAPD 技术在鱼类性别研究中的应用
2.2 AFLP 技术在鱼类性别鉴定中的应用
2.3 SSR 技术在鱼类性别决定研究中的应用
3. 单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP）分子标记的检测方法
3.1 SNP 简介
3.2 SNP 的检测方法
4. SNP 在水产动物遗传育种中的应用
4.1 构建高密度遗传连锁图谱
4.2 性状关联分析
4.3 种群进化和亲缘关系的研究
5. 研究目的
第二章 大菱鲆 4 月龄幼鱼性别鉴定研究
1 材料与方法
1.1 实验鱼来源及培育
1.2 实验仪器
1.3 实验药品
1.4 方法
2 结果与分析
2.1 4 月龄大菱鲆幼鱼性别鉴别
2.2 大菱鲆幼鱼性腺外部形态变化
3 讨论
第三章 大菱四月龄幼鱼性比及雌雄体重差异分析
1 材料与方法
1.1 实验鱼及其培育方法
1.2 数据采集及分析
2 结果
2.1 4 月龄雌雄幼鱼的性别比例及χ_。~2测验
2.2 雌雄个体体重值差异分析
2.3 家系内雌雄个体平均体重差异分析
3 讨论
第四章 大菱鲆性别相关 SNP 位点的初步筛选
1 材料与方法
1.1 实验材料
1.2 实验方法
2 结果与分析
2.1 基因组 DNA 质量检测及浓度测定
2.2 引物设计及 SNP 基因分型
2.3 SNP 位点多态性分析
2.4 SNP 筛选结果
3 讨论
3.1 多态性 SNP 位点的开发
3.2 SNP 位点筛选及分析
第五章 大菱鲆转录组 454 测序部分预测 SNP 位点验证分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果
2.1 基因组 DNA 的质量及浓度测定
2.2 SNP 位点筛选
2.3 PCR 扩增产物测序检测单倍型
2.4 单倍型与性别的关联分析
3 讨论
参考文献
附录
硕士在读期间发表文章
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国大菱鲆养殖20年成就和展望——庆祝大菱鲆引进中国20周年[J]. 雷霁霖,刘新富,关长涛. 渔业科学进展. 2012(04)
[2]醋酸洋红染色技术在大菱鲆幼鱼生理性别鉴定中的应用[J]. 韩伟国,刘新富,孟振,温海深,雷霁霖. 渔业科学进展. 2011(06)
[3]鳜脂蛋白脂酶基因SNP及其与食性驯化相关性分析[J]. 杨宇晖,梁旭方,方荣,彭敏燕,黄志东. 遗传. 2011(09)
[4]后基因组时代下作物的SNP分型方法[J]. 赵琼一,李信,周德贵,何飞,周少川,罗达. 分子植物育种. 2010(01)
[5]雌核发育与正常二倍体条斑星鲽胚胎发育比较研究[J]. 李忠红,刘海金,张世奎,姜秀凤,王玉芬. 水产科学. 2009(12)
[6]变性梯度凝胶电泳检测鲍曼不动杆菌中SHV基因单核苷酸多态性[J]. 张哲,许德义,蒋晓飞. 现代实用医学. 2009(08)
[7]运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073A/G单核苷酸多态性[J]. 王默进,周总光,王玲,李园,张鹏,张益,崔长富,周斌. 四川大学学报(医学版). 2009(02)
[8]大口黑鲈MyoD基因结构和单核苷酸多态性位点的筛选[J]. 于凌云,白俊杰,叶星,李胜杰,李小慧. 水产学报. 2009(01)
[9]大菱鲆（Scophthalmus maximus）幼鱼生长性状的遗传力及其相关性分析[J]. 马爱军,王新安,杨志,曲江波,雷霁霖. 海洋与湖沼. 2008(05)
[10]尼罗罗非鱼Sox基因PCR-SSCP分析[J]. 杨东,刘红艳,张繁荣,余来宁. 江西农业学报. 2008(09)
博士论文
[1]栉孔扇贝（Chlamys farreri）EST-SNP的开发及其应用[D]. 李纪勤.中国海洋大学 2012
硕士论文
[1]“黄海2号”中国对虾高通量SNP筛选及其与抗WSSV性状的关联分析[D]. 逄锦菲.上海海洋大学 2013
[2]大菱鲆幼鱼生长和耐高温性状的遗传参数估计与家系筛选[D]. 刘宝锁.上海海洋大学 2012
[3]大菱鲆性腺分化组织学和早期性别快速鉴定技术的研究[D]. 韩伟国.中国海洋大学 2011
[4]长牡蛎SNP标记的开发及多态性检测[D]. 王绍宗.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2009
[5]英国和西班牙进口大菱鲆杂交子一代的杂种优势分析[D]. 季士治.中国海洋大学 2006
本文编号：3707323
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3707323.html
