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都柳江鲇形目主要经济鱼类种质的遗传学评价

发布时间:2022-12-05 02:14
  鲇(Silurus asotus)、粗唇鮠(Leiocassis crassilabris)和斑鱯(Hemibagrus guttatus)均隶属鲇形目(Siluriformes),且均为我国重要淡水经济鱼类。近年来,该3种鱼类在贵州都柳江受到了高强度的捕捞,加之水环境污染和水利工程等造成的鱼类栖息环境破坏,其野生资源量日趋减少,而物种的遗传多样性与其适应能力、生存能力密切相关。目前,尚无有关都柳江鲇、粗唇鮠和斑鳠野生种群遗传多样性研究的报道,因此,本研究以都柳江该3种鱼类种群为研究对象,采用PCR和DNA测序技术研究了该3种鱼类线粒体DNA Cyt b基因和D-loop序列组成及遗传多样性,进行其种质的遗传学评价,以期为开展都柳江该3种经济鱼类种质资源的利用及保护提供科学依据。主要结果如下:1、以采自都柳江39尾鲇个体为样品,采用PCR和DNA测序技术对都柳江鲇种群Cyt b基因和D-loop序列进行了分析。获取了长度为1122 bp和D-loop 5′端长度为544~545 bp的鲇Cyt b基因、D-loop序列。在Cyt b基因中,检测到46个多态位点,变异多发生在密码子第3位... 

【文章页数】:61 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要 Summary 第一章 文献综述
1、鱼类种质资源研究概述
    1.1 种质资源的概念
    1.2 国内外鱼类种质资源研究的概况
2 鱼类种质资源的遗传学评价
    2.1 鱼类种质资源的遗传学评价
    2.2 鱼类种质资源遗传学评价研究的现状
    2.3 鱼类种质资源遗传学评价的方法
    2.4 鱼类线粒体DNA概述
    
2.4.1 鱼类线粒体的组成与特征
    
2.4.2 鱼类mtDNA D-loop的研究
    
2.4.3 鱼类线粒体Cytb基因的研究
3、都柳江鲇形目主要经济鱼类
    3.1 鲇的研究概况
    3.2 粗唇鮠的研究概况
    3.3 斑鱯的研究概况
4、本研究的目的及意义 第二章 都柳江鲇种群的遗传多样性及评价
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验试剂
    1.3 试验器材
    1.4 试验方法
    
1.4.1 DNA模板制备
    
1.4.2 DNA检测
    
1.4.3 PCR扩增
    
1.4.4 测序
    
1.4.5 数据处理
2 结果
    2.1 都柳江鲇种群mtDNA Cyt b基因序列多态性
    
2.1.1 都柳江鲇种群mtDNA Cyt b基因序列组成与变异
    
2.1.2 都柳江鲇种群Cyt b基因编码的氨基酸序列变异
    2.2 都柳江鲇种群mtDNA D-loop序列多态性
    
2.2.1 都柳江鲇种群mt DNA D-loop序列的组成和变异
    
2.2.2 都柳江鲇mtDNA D-loop的结构
    2.3 都柳江鲇种群的遗传多样性及NJ系统树
3 讨论
    3.1 都柳江鲇种群mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的组成和变异
    
3.1.1 都柳江鲇种群mt DNA Cyt b基因和D-loop序列的碱基组成特征
    
3.1.2 都柳江鲇种群mtDNA Cyt b基因密码子变异
    
3.1.3 都柳江鲇种群线粒体DNA D-loop序列的结构
    3.2 都柳江鲇种群遗传多样性现状 第三章 都柳江粗唇鮠种群的遗传多样性及评价
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验试剂
    1.3 试验器材
    1.4 试验方法
    
1.4.1 DNA模板制备
    
1.4.2 DNA检测
    
1.4.3 PCR扩增
    
1.4.4 测序
    
1.4.5 数据处理
2 结果
    2.1 都柳江粗唇鮠种群mtDNA Cyt b基因序列多态性
    
2.1.1 都柳江粗唇鮠种群mtDNA Cyt b基因序列组成与变异
    
2.1.2 都柳江粗唇鮠种群Cyt b基因编码的氨基酸序列变异
    2.2 都柳江粗唇鮠种群mtDNA D-loop序列的多态性
    
2.2.1 都柳江粗唇鮠种群mt DNA D-loop序列的组成和变异
    
2.2.2 都柳江粗唇鮠mtDNA D-loop的结构
    2.3 都柳江粗唇鮠种群的遗传多样性及NJ系统树
3 讨论
    3.1 都柳江粗唇鮠种群mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的组成和序列变异
    
3.1.1 都柳江粗唇鮠种群mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的碱基组成特征
    
3.1.2 都柳江粗唇鮠种群mtDNA Cyt b基因密码子变异
    
3.1.3 都柳江粗唇鮠种群线粒体DNA D-loop序列的结构与变异
    3.2 都柳江粗唇鮠种群遗传多样性现状 第四章 都柳江斑鱯种群的遗传多样性及评价
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验试剂
    1.3 试验器材
    1.4 试验方法
    
1.4.1 DNA模板制备
    
1.4.2 DNA检测
    
1.4.3 PCR扩增
    
1.4.4 测序
    
1.4.5 数据处理
2 结果
    2.1 都柳江斑鱯种群mtDNA Cyt b基因序列多态性
    
2.1.1 都柳江斑鱯种群mtDNA Cyt b基因序列组成与变异
    
2.1.2 都柳江斑鱯种群Cyt b基因编码的氨基酸序列变异
    2.2 都柳江斑鱯种群mtDNA D-loop序列多态性
    
2.2.1 都柳江斑鱯种群mt DNA D-loop序列的组成和变异
    
2.2.2 都柳江斑鱯mtDNA D-loop的结构
    2.3 都柳江斑鱯种群的遗传多样性及NJ系统树
3 讨论
    3.1 都柳江斑鱯种群mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的组成和序列变异
    
3.1.1 都柳江斑鱯种群mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的碱基组成特征
    
3.1.2 都柳江斑鱯种群mtDNA Cyt b基因密码子变异
    
3.1.3 都柳江斑鱯种群线粒体 DNA D-loop 序列的结构
    3.2 都柳江斑鱯种群遗传多样性现状 第五章 结论 致谢 参考文献 附录


【参考文献】:
期刊论文
[1]翘嘴鳜F2家系选育及微卫星亲子鉴定[J]. 杨凯,成为为,高银爱,王青云,罗峰,夏儒龙,朱思华,程颖红,邓国乔.  水生生物学报. 2015(06)
[2]野生斑鱯幼鱼与成鱼的肌肉营养成分测定[J]. 陈涛,于丹.  贵州农业科学. 2015(11)
[3]鳜属5种鱼类微卫星遗传多样性分析[J]. 赵程,梁旭方,田昌绪,杨敏,窦亚琪,郭稳杰,宋易.  华中农业大学学报. 2015(05)
[4]5个湖泊河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)种群线粒体细胞色素b基因的遗传变异分析[J]. 徐宇,钟立强,李潇轩,朱锡和,王崇华,史杨白.  湖泊科学. 2015(04)
[5]滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析[J]. 胡玉婷,胡王,凌俊,江河,段国庆,潘庭双.  南方水产科学. 2015(02)
[6]我国草鱼野生群体D-Loop序列遗传变异分析[J]. 傅建军,王荣泉,沈玉帮,宣云峰,徐晓雁,刘承初,李家乐.  水生生物学报. 2015(02)
[7]基于mtDNA序列分析青鱼群体遗传结构[J]. 杨宗英,汪登强,陈大庆,段辛斌,刘绍平.  淡水渔业. 2015(02)
[8]大鰭鳠线粒体控制区结构及其比较分析[J]. 魏刚,周丽,曾令江,肖训焰,黄林,张运明.  西南大学学报(自然科学版). 2015(01)
[9]不同地理群体乌鳢线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性[J]. 董新培,穆淑梅,周楠,康现江,罗青,白俊杰.  水产学报. 2014(09)
[10]西北太平洋大弹涂鱼群体遗传结构的AFLP分析[J]. 陈维,洪万树,陈仕玺,王琼,张其永.  中国水产科学. 2014(05)

硕士论文
[1]基于微卫星标记和线粒体cytb基因序列的鲇遗传多样性研究[D]. 徐丹丹.西南大学 2013
[2]中国鮨科鱼类系统发育的线粒体细胞色素b基因全序列分析[D]. 底晓丹.暨南大学 2009
[3]大鳍鳠(Mystus macropterus Bleeker)遗传多样性及其线粒体控制区结构的研究[D]. 周丽.西南大学 2008
[4]鳜(Siniperca chuatsi)种质指标研究[D]. 陈军.华南师范大学 2003



本文编号:3709460

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