脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析

发布时间：2022-12-11 00:07

　　转录组测序可在各种环境条件下对物种进行高通量测序,通过基因结构分析和功能注释,探讨特定条件下相关基因的功能和表达情况。该研究分别获取低盐胁迫组（盐度0.2）和自然海水组（盐度31）脊尾白虾（Exopalaemon carinicauda）样品,通过Illumina平台进行转录组测序,获得13.92 Gb高质量测序数据,组装得到111 618条转录本和72 734条Unigenes,其中有22 879条Unigenes得到注释,比对到Nr数据库的Unigenes为21 931条;筛选出1 492条脊尾白虾低盐胁迫差异显著表达基因,包括829条上调基因和663条下调基因,其中有810条差异表达基因得到注释。通过差异表达基因GO功能注释和富集分析及KEGG通路富集分析,锁定大量脊尾白虾在自然海水和淡水环境下的差异表达基因,为深入探讨脊尾白虾在低盐胁迫条件下的生理保护机制提供了技术支撑。 

【文章页数】：14 页

【参考文献】：
期刊论文
[1]养殖盐度对凡纳滨对虾抗氧化酶及免疫相关酶活力的影响[J]. 鲁耀鹏,钱坤,汪蕾,张秀霞,王冬梅,李军涛,冼健安,王安利.  河北渔业. 2019(12)
[2]镉暴露对BRL 3A细胞溶酶体的影响[J]. 邹辉,孙建,于凡,原俊朝,卞建春,刘宗平.  中国兽医科学. 2019(12)
[3]肝纤维化中TGF-β/Smad信号通路研究进展[J]. 于洋,史嘉翊,黄珍,刘增瑞,吴丹.  牡丹江医学院学报. 2019(05)
[4]角鳖RNA-seq转录组分析及生长相关基因筛选[J]. 罗志嘉,李潇,曾丹,王佩,彭娜,王晓清.  基因组学与应用生物学. 2019(04)
[5]罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii）卵巢发育不同时期转录组分析[J]. 陈雪峰,王春琳,顾志敏,徐宾朋,张宇飞,慎佩晶,程海华,彭菲,李喜莲,黄振远.  海洋与湖沼. 2019(02)
[6]盐度和漂白粉对东方新糠虾的急性胁迫影响[J]. 张涛,史会来,平洪领,余方平,卢斌.  水产养殖. 2019(01)
[7]基于转录组分析筛选凡纳滨对虾低温胁迫下的差异表达基因[J]. 董丽君,孟宪红,孔杰,罗坤,栾生,史晓丽.  中国水产科学. 2019(01)
[8]罗氏沼虾转录组SSR标记信息分析[J]. 王传聪,唐修阳,项杰,欧江涛.  江苏农业科学. 2018(22)
[9]Ets转录因子的生理作用研究进展[J]. 曾红,杨洋,安输,郭晓汐,郝倩,徐天瑞,刘莹.  中国药理学通报. 2017(12)
[10]动物Trypsin基因结构、表达及应用研究进展[J]. 李小鹏,王卿惠,王世伟,唐海平,曹玉凯.  高师理科学刊. 2017(10)

博士论文
[1]低盐度下凡纳滨对虾脂肪营养生理研究[D]. 陈科.华东师范大学 2017

硕士论文
[1]低盐度胁迫对罗氏沼虾生长和肉质的影响[D]. 何竺柳.浙江海洋大学 2018
[2]膳食多酚抑制α-葡糖苷酶活性的构效关系研究[D]. 陈天晴.上海师范大学 2018
[3]脊尾白虾回交家系的遗传特性及免疫功能研究[D]. 刘九美.大连海洋大学 2017
[4]饲料中添加抗生素对半滑舌鳎肠道酶组织化学、肠道转录组及菌群结构的影响[D]. 王一泽.天津农学院 2017
[5]日本沼虾抗氨氮胁迫转录组与代谢组分析[D]. 孙健.山东农业大学 2017
[6]胰蛋白酶对刺参体壁胶原超分子结构的降解作用研究[D]. 妥丰艳.大连工业大学 2016
[7]脊尾白虾近交系遗传多样性的微卫星分析[D]. 王日芳.上海海洋大学 2016
[8]黄姑鱼微卫星标记的开发与应用[D]. 龚诗琦.集美大学 2016
[9]干露胁迫对脊尾白虾呼吸代谢相关酶和低氧诱导因子的影响[D]. 连春盎.上海海洋大学 2016
[10]脊尾白虾几丁质酶的分离、特征及功能分析[D]. 王婧.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2015



本文编号：3717770