养殖达氏鳇和西伯利亚鲟种群微卫星验证及遗传多样性分析

发布时间：2023-04-05 20:42

　　鲟鱼是一类古老的大型多倍体经济鱼类,由于人类过度捕捞和对其生存生态环境的破坏,世界范围内的鲟鱼自然资源日趋枯竭。本试验通过小体鲟微卫星数据处理方法研究,利用13个微卫星DNA标记位点对人工养殖的四倍体小体鲟种群进行扩增,得知“比例法”、“补齐法”、“1、0法”等多倍体样品的微卫星数据分析方法差异不显著,由于在实际读图中,补齐法更加有效便捷,因此可根据试验方法和样品来源选择该数据读取方法。对前期开发的达氏鳇和西伯利亚鲟微卫星引物进行验证,从而筛选出具有高多态性位点的20对达氏鳇和21对西伯利亚鲟引物。从筛选出的21对西伯利亚鲟微卫星引物中筛选出14对进行两两组合建立了7组微卫星多重PCR体系。使用新筛选出的微卫星位点,对养殖达氏鳇和西伯利亚鲟种群进行遗传多样性分析得知,达氏鳇种群和西伯利亚鲟种群在新微卫星位点上分别检测到443和644个等位基因,各群体的平均有效等位基因数分别是9.0759、13.4074。所有位点平均PIC指数分别为0.8595、0.8797,均大于0.5,表明验证得到的这些微卫星位点均属于高多态性位点。两种群平均表观杂合度是0.9534、0.9084,平均期望杂合度是...

【文章页数】：57 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
英文缩略词
第一章 前言
    1.1 鲟鱼
        1.1.1 分类及体型
        1.1.2 分布及生境
        1.1.3 食性及生长
        1.1.4 洄游及繁殖
        1.1.5 经济价值
        1.1.6 保护现状
    1.2 微卫星
        1.2.1 微卫星标记
        1.2.2 微卫星标记的优缺点
        1.2.3 微卫星标记的应用
    1.3 遗传多样性
        1.3.1 遗传多样性概述
        1.3.2 遗传多样性研究意义
    1.4 研究的目的与意义
第二章 养殖小体鲟种群微卫星数据分析方法比较研究
    2.1 材料与方法
        2.1.1 样品采集及基因组DNA提取
        2.1.2 PCR扩增及检测
        2.1.3 数据分析
    2.2 结果
    2.3 讨论
第三章 养殖达氏鳇微卫星引物验证及遗传多样性分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 试验材料
        3.1.2 试验仪器与试剂
        3.1.3 达氏鳇基因组DNA提取
        3.1.4 达氏鳇新SSR引物的筛选
        3.1.5 达氏鳇新SSR引物的克隆验证
        3.1.6 PCR扩增及遗传多样性分析
        3.1.7 跨种扩增及遗传多样性分析
    3.2 结果
        3.2.1 基因组DNA的提取
        3.2.2 SSR引物筛选
        3.2.3 SSR引物克隆验证
        3.2.4 PCR扩增及分析
        3.2.5 跨种扩增及分析
    3.3 讨论
第四章 养殖西伯利亚鲟微卫星引物验证及遗传多样性分析
    4.1 材料和方法
        4.1.1 试验材料
        4.1.2 试验仪器与试剂
        4.1.3 西伯利亚鲟基因组DNA提取
        4.1.4 西伯利亚鲟新SSR引物的筛选及多重PCR建立
        4.1.5 西伯利亚鲟新SSR引物的验证
        4.1.6 PCR扩增及遗传多样性分析
        4.1.7 跨种扩增及遗传多样性分析
    4.2 结果
        4.2.1 基因组DNA的提取
        4.2.2 SSR引物的筛选
        4.2.3 SSR引物的克隆验证
        4.2.4 PCR扩增及分析
        4.2.5 PCR跨种扩增及分析
    4.3 讨论
第五章 结论
参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文
致谢



本文编号：3784098