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草鱼unc45b基因的全长克

发布时间:2023-05-11 05:13
  试验一草鱼unc45b基因的全长克隆、生物信息学分析及组织差异表达UNC45b(unc-45 myosin chaperone b)是肌球蛋白的分子伴侣,在肌纤维形成过程中调控肌球蛋白(粗肌丝)的折叠、组装和积累,对维持肌节稳定和肌肉发育起着重要作用。本实验采用c DNA末端快速扩增法首次克隆获得草鱼unc45b基因全长序列,对其编码蛋白质序列的特性进行预测和分析,并采用实时荧光定量PCR法检测草鱼各组织unc45b基因的差异表达。结果表明,草鱼unc45b基因全长3163bp,含60 bp的5’端非编码区、298 bp的3’端非编码区及长2865 bp编码934个氨基酸的开放阅读框。草鱼unc45b基因编码的氨基酸序列与斑马鱼、斑点叉尾鮰、墨西哥丽脂鲤、尼罗罗非鱼和大西洋鲑unc45b的氨基酸序列同源性分别达92%、86%、86%、82%和81%;生物信息学分析显示草鱼unc45b蛋白分子质量103,699.8Da,理论等电点7.39,为亲水性非分泌蛋白,不含信号肽;其二级、三级结构包括α-螺旋(α-helix)和环(loop)。组织差异表达结果显示unc45b基因在草鱼血液、肝脏、...

【文章页数】:64 页

【学位级别】:硕士

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摘要
Abstract
引言
    1. 普通草鱼和脆化草鱼
    2. 肌肉
        2.1 肌肉品质
        2.2 肌原纤维
        2.3 伴侣蛋白与肌节装配与降解
        2.4 热激蛋白 90 (Hsp90)
        2.5 Unc45蛋白
        2.6 CHIP蛋白
        2.7 国内外研究现状
    3. 丝裂原活化蛋白激酶 (MAP K)
    4. 本论文研究的目的、内容和意义
        4.1 草鱼unc45b基因的全长克隆、生物信息学分析及组织差异表达
        4.2 脆化草鱼肌节装配相关基因unc45b的时空表达
第一章 草鱼unc45b基因的全长克隆、生物信息学分析及组织差异表达
    1. 材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 方法
    2.结果
        2.1 unc45b基因全长克隆与序列分析
        2.2 Unc45b氨基酸序列同源性比对和系统进化树构建
        2.3 Unc45b蛋白质结构分析
        2.4 草鱼unc45b基因的组织差异表达
    3. 讨论
        3.1 草鱼Unc45b基因与氨基酸同源性比较及系统进化树构建
        3.2 草鱼Unc45b蛋白质结构
        3.3 草鱼unc45b基因组织差异表达
        3.4 Unc45b蛋白功能
    4. 小结
第二章 脆化草鱼肌节装配相关基因unc45b的时空表达
    1. 材料与方法
        1.1 材料来源
        1.2 养殖实验设计
        1.3 养殖管理
        1.4 样品采集
        1.5 实验试剂与仪器
        1.6 各组织总RNA的提取及反转录
        1.7 实时荧光定量PCR测定草鱼unc45b基因不同时期的表达
    2. 结果
        2.1 0周、4 周、8 周、12周各时间点鱼体体重
        2.2 定量反应体系检测
        2.3 草鱼不同组织unc45b基因的时空表达分析 (组内分析)
        2.4 蚕豆对草鱼不同组织unc45b基因表达的影响 (组间分析)
    3. 讨论
        3.1 蚕豆对草鱼生长的影响
        3.2 unc45b基因的功能
        3.3 unc45b基因表达的组织特异性
        3.4 草鱼骨骼肌和心肌组织unc45b基因的时空表达及蚕豆的促表达作用
        3.5 草鱼肝脏和皮肤组织 unc45b 基因的时空表达
    4. 小结
全文总结
参考文献
论文发表
致谢



本文编号:3814231

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