不同养殖环境下罗非鱼肠道微生物的比较分析

发布时间：2023-05-28 10:56

　　为了比较不同养殖环境下罗非鱼肠道菌群结构和相对丰度变化规律,选取稻田和池塘两种养殖环境下的罗非鱼为研究对象,定期测定实验期间的水质指标(溶氧、水温、pH值和氨氮),取养殖202d的罗非鱼,通过16SrRNA高通量测序检测其肠道微生物,并分析不同养殖环境下罗非鱼肠道菌群的变化规律。实验结果表明,养殖水质参数均在正常范围内,但不同养殖环境的水质参数存在差异,可能会导致罗非鱼肠道微生物的结构组成和多样性发生变化。在两种不同养殖环境下,梭杆菌门(Fusobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)3个菌群相对丰度均较高。蓝菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)物种丰富度存在显著性差异,其中蓝菌门在稻田组的罗非鱼肠道菌群中所占比例高于池塘组,而拟杆菌门和放线菌门在池塘组的罗非鱼肠道菌群中所占比例高于稻田组;在属水平下,Cetobacterium,Paeniclostrdium和Romboutsia等菌属在稻田组罗非鱼肠道菌群相对丰度较高,池塘组罗非鱼肠道菌群相对丰度较高...

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【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 实验动物及养殖
    1.2 取样方法
    1.3 PCR扩增及基因文库构建
        1.3.1 基因组DNA的提取和PCR扩增
        1.3.2 PCR产物的混样和纯化
        1.3.3 基因文库构建
    1.4 测序分析
        1.4.1 数据处理
        1.4.2 OUTs聚类和物种注释
2 结果与分析
    2.1 水质变化情况
    2.2 肠道菌群α多样性分析结果
    2.3 肠道菌群结构
        2.3.1 门水平下的肠道菌群结构
        2.3.2 属水平下的肠道菌群结构
3 讨论
    3.1 水质参数的影响
    3.2 肠道菌群结构



本文编号：3824453