富油新绿藻叶绿体基因组测序及几种产油微绿藻叶绿体基因比较研究

发布时间：2023-06-17 21:31

　　随着经济发展和世界人口的激增,全球能源和粮食消耗急剧增加。资源缺乏,生态环境恶化,耕地面积不断减少种种问题也随之而来。微藻的养殖受地域和季节影响较小,且不占用耕地。微藻资源的开发和利用顺应着社会的发展需要。富油新绿藻(Neochloris oleoabundans)具有高产油能力,有作为食品新资源生产食用油的潜力,但有关这种产油微藻的生物学特性在分子水平上的研究还十分不足。研究微藻叶绿体基因组有助于分类学研究、基因工程应用以及微藻资源在食品领域的开发和利用。本文首次对富油新绿藻的叶绿体分离条件进行优化,提取出其叶绿体基因组并进行测序,将获得的基因组序列与几种产油微绿藻的叶绿体基因组进行生物信息学分析和比较。本文的研究对于加深富油新绿藻分类学等生物学基础的认识、产油微藻在食用油基因工程研究以及生物活性物质在微藻叶绿体中高效表达提供研究基础。本文的主要研究内容及结果如下:(1)通过优化percoll密度梯度离心法对富油新绿藻叶绿体进行分离,确定了percoll密度组合为10%、35%、50%,结合恰当的离心机操作可以达到最好的分离效果。(2)通过对富油新绿藻的叶绿体基因组测序、序列组装、基...

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 绪论
    1.1 微藻及其应用
        1.1.1 微藻
        1.1.2 微藻应用现状
        1.1.3 微藻应用研究存在的问题
    1.2 叶绿体基因组的研究进展
        1.2.1 叶绿体
        1.2.2 叶绿体基因组
        1.2.3 微藻叶绿体基因组研究的意义
        1.2.4 叶绿体基因组测序技术
    1.3 几种产油微绿藻的研究进展
        1.3.1 生物学基础研究
        1.3.2 应用研究
    1.4 选题意义与主要研究内容
        1.4.1 选题意义
        1.4.2 主要研究内容
2 富油新绿藻的叶绿体分离和叶绿体基因组提取
    2.1 材料与设备
        2.1.1 富油新绿藻藻种
        2.1.2 主要仪器与设备
        2.1.3 实验试剂
    2.2 实验方法
        2.2.1 富油新绿藻的培养与收获
        2.2.2 富油新绿藻叶绿体分离中Percoll密度梯度优化
        2.2.3 富油新绿藻叶绿体基因组提取
        2.2.4 琼脂糖凝胶电泳检测
        2.2.5 DNA总量测定
    2.3 结果与分析
        2.3.1 富油新绿藻叶绿体研磨效果观察
        2.3.2 离心加速度筛选
        2.3.3 富油新绿藻叶绿体分离中percoll密度梯度分离液优化
        2.3.4 富油新绿藻的叶绿体基因提取
        2.3.5 富油新绿藻cpDNA总量测定
    2.4 讨论
    2.5 小结
3 富油新绿藻叶绿体基因组结构拼接与解析
    3.1 材料与设备
        3.1.1 实验材料
    3.2 实验方法
        3.2.1 建库测序
        3.2.2 基因组组装及其图谱绘制
        3.2.3 基因预测与注释
        3.2.4 简单重复序列分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 富油新绿藻叶绿体基因组基因组成及结构特征
        3.3.2 富油新绿藻叶绿体基因组简单重复序列分析
    3.4 讨论
    3.5 小结
4 几种产油微藻叶绿体基因比较分析
    4.1 材料与方法
        4.1.1 基因序列
        4.1.2 基因序列的共线性分析
        4.1.3 系统发育树构建
        4.1.4 密码子偏好性分析
    4.2 结果与分析
        4.2.1 共线性分析
        4.2.2 系统发育树
        4.2.3 索氏小球藻密码子偏好性分析
        4.2.4 富油新绿藻密码子偏好性分析
    4.3 讨论
    4.4 小结
5 结论与展望
    5.1 结论
    5.2 创新点
    5.3 展望
参考文献
致谢
作者简介
导师简介



本文编号：3834175