河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性比较研究
发布时间：2023-10-02 06:52
本文通过线粒体DNA控制区全长序列和细胞色素b基因部分片段遗传标记辅以简单形态学数据测量,分析比较了分布在新疆北屯、乌伦古湖、博斯腾湖的3个河鲈野生群体和北湖、五家渠的2个河鲈养殖群体的遗传多样性。为河鲈的野生群体种质资源的复壮及可持续开发利用和人工养殖群体优良种质资源的培育提供一定的理论参考基础,结果如下:1.在欧洲河鲈已识别部分保守序列基础上,对新疆河鲈线粒体DNA控制区全序列测定后进一步识别了中央保守区的CSB-F、CSB-E、CSB-C和CSB-B的序列。划分出河鲈线粒体DNA控制区的终止序列区(TAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的界限。对新疆河鲈、欧洲河鲈和黄金鲈三者间以及新疆河鲈的野生和养殖群体两者间进行了mt DNA控制区碱基结构组成分析,发现在终止序列区(TAS)的碱基结构组成上,新疆河鲈以4个重复序列为主,欧洲河鲈以3个重复序列为主,而黄金鲈只有4个重复序列,并且三者在控制区其它区域也存在差异,与欧洲河鲈相比,新疆河鲈和黄金鲈出现了部分碱基的缺失;新疆河鲈野生群体的重复序列碱基变异类型多于养殖群体。以圆斑星鲽为外群,用邻接法(NJ)构建系统发育树表明,...
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
中英符号缩略词表
第一章 文献综述
1 河鲈概述
1.1 河鲈的分类地位及分布历史简介
1.2 河鲈形态特征
1.3 河鲈生活环境及食性
1.4 河鲈营养功效
1.5 河鲈的国内外研究现状
2 鱼类遗传多样性研究概况
2.1 鱼类遗传多样性概述
2.2 鱼类遗传多样性的研究方法及应用
3 本研究的目的和意义
第二章 基于线粒体DNA控制区研究河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性及差异
前言
1 实验材料与设备
1.1 实验材料
1.2 主要仪器
1.3 主要试剂
2 研究方法
2.1 河鲈基因组DNA的提取及检测
2.2 河鲈线粒体DNA控制区单倍型筛选
2.3 河鲈线粒体DNA D-loop全长序列扩增
2.4 目的条带的纯化回收
2.5 目的条带的连接和转化
2.6 数据分析和处理
2.6.1 河鲈线粒体DNA控制区结构分析
2.6.2 新疆河鲈野生与养殖群体mtDNA控制区遗传多样性比较分析
3 结果分析
3.1 河鲈总DNA提取
3.2 河鲈线粒体DNA控制区单倍型筛选
3.3 线粒体DNA D-loop区全序列扩增
3.4 河鲈线粒体DNA控制区碱基结构分析
3.4.1 新疆河鲈、欧洲河鲈和黄金鲈线粒体DNA控制区序列差异比较
3.4.2 新疆河鲈、欧洲河鲈和黄金鲈线粒体DNA控制区序列比较分析
3.4.3 新疆河鲈野生和养殖群体线粒体DNA控制区差异比较
3.4.4 系统发育分析
3.5 新疆河鲈野生与养殖群体线粒体DNA控制区遗传多样性比较分析
4 讨论
4.1 河鲈线粒体DNA控制区结构分析
4.2 新疆河鲈野生与养殖群体线粒体DNA控制区遗传多样性比较分析
第三章 基于线粒体细胞色素b基因部分序列研究河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性
前言
1 实验材料和设备
1.1 实验材料
1.2 主要仪器
1.3 主要试剂
2 研究方法
2.1 基因组DNA提取及纯度检测
2.2 PCR扩增测序
2.3 数据处理
3 结果分析
3.1 新疆河鲈野生群体和养殖群体细胞色素b基因部分序列变异分析
3.2 新疆河鲈野生群体和养殖群体细胞色素b基因部分序列遗传结构分析
4 讨论
4.1 河鲈野生和养殖群体的分子遗传多样性比较
4.2 河鲈群体的遗传分化
第四章 基于简单形态学数据分析河鲈野生群体和养殖群体的表型差异
前言
1 实验材料
2 实验方法
2.1 河鲈年龄的鉴定及简单形态学测量
2.2 形态学数据处理
3 实验结果
3.1 年龄鉴定
3.2 体长和体重的比较
4 讨论
第五章 河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性及差异研究结论总述
第六章 创新点和展望
1 创新点
2 展望
参考文献
附录
附录一 实验所用试剂配方
附录二 新疆河鲈野生群体和养殖群体的体长、体重测量及年龄测定原始数据
致谢
作者简介
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表
本文编号：3850317
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
中英符号缩略词表
第一章 文献综述
1 河鲈概述
1.1 河鲈的分类地位及分布历史简介
1.2 河鲈形态特征
1.3 河鲈生活环境及食性
1.4 河鲈营养功效
1.5 河鲈的国内外研究现状
2 鱼类遗传多样性研究概况
2.1 鱼类遗传多样性概述
2.2 鱼类遗传多样性的研究方法及应用
3 本研究的目的和意义
第二章 基于线粒体DNA控制区研究河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性及差异
前言
1 实验材料与设备
1.1 实验材料
1.2 主要仪器
1.3 主要试剂
2 研究方法
2.1 河鲈基因组DNA的提取及检测
2.2 河鲈线粒体DNA控制区单倍型筛选
2.3 河鲈线粒体DNA D-loop全长序列扩增
2.4 目的条带的纯化回收
2.5 目的条带的连接和转化
2.6 数据分析和处理
2.6.1 河鲈线粒体DNA控制区结构分析
2.6.2 新疆河鲈野生与养殖群体mtDNA控制区遗传多样性比较分析
3 结果分析
3.1 河鲈总DNA提取
3.2 河鲈线粒体DNA控制区单倍型筛选
3.3 线粒体DNA D-loop区全序列扩增
3.4 河鲈线粒体DNA控制区碱基结构分析
3.4.1 新疆河鲈、欧洲河鲈和黄金鲈线粒体DNA控制区序列差异比较
3.4.2 新疆河鲈、欧洲河鲈和黄金鲈线粒体DNA控制区序列比较分析
3.4.3 新疆河鲈野生和养殖群体线粒体DNA控制区差异比较
3.4.4 系统发育分析
3.5 新疆河鲈野生与养殖群体线粒体DNA控制区遗传多样性比较分析
4 讨论
4.1 河鲈线粒体DNA控制区结构分析
4.2 新疆河鲈野生与养殖群体线粒体DNA控制区遗传多样性比较分析
第三章 基于线粒体细胞色素b基因部分序列研究河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性
前言
1 实验材料和设备
1.1 实验材料
1.2 主要仪器
1.3 主要试剂
2 研究方法
2.1 基因组DNA提取及纯度检测
2.2 PCR扩增测序
2.3 数据处理
3 结果分析
3.1 新疆河鲈野生群体和养殖群体细胞色素b基因部分序列变异分析
3.2 新疆河鲈野生群体和养殖群体细胞色素b基因部分序列遗传结构分析
4 讨论
4.1 河鲈野生和养殖群体的分子遗传多样性比较
4.2 河鲈群体的遗传分化
第四章 基于简单形态学数据分析河鲈野生群体和养殖群体的表型差异
前言
1 实验材料
2 实验方法
2.1 河鲈年龄的鉴定及简单形态学测量
2.2 形态学数据处理
3 实验结果
3.1 年龄鉴定
3.2 体长和体重的比较
4 讨论
第五章 河鲈野生群体和养殖群体遗传多样性及差异研究结论总述
第六章 创新点和展望
1 创新点
2 展望
参考文献
附录
附录一 实验所用试剂配方
附录二 新疆河鲈野生群体和养殖群体的体长、体重测量及年龄测定原始数据
致谢
作者简介
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表
本文编号：3850317
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