群体感应淬灭酶YtnP对草鱼肠道菌群结构的影响

发布时间：2023-11-11 18:08

　　【目的】揭示群体感应淬灭作用与宿主肠道菌群结构间的作用关系,为具有群体感应淬灭作用益生菌及其淬灭酶在水产养殖上的推广应用提供理论依据。【方法】选取30尾规格为25±1 g/尾的草鱼随机分为对照组和试验组,试验组每尾草鱼腹腔注射100μL溶解稀释后的YtnP(25μg/mL),对照组每尾草鱼腹腔注射等量的300 mmol/L分子筛缓冲液,分别在注射后24和48 h采集草鱼前肠、中肠和后肠的肠道组织及内容物,提取各肠段总DNA及PCR扩增16S rRNA序列V3～V4可变区,然后基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析外源添加YtnP对草鱼肠道菌群多样性与丰度的影响。【结果】12份草鱼肠道样品测序共获得原始序列(Raw reads)660205条,有效序列(Valid reads)416614条;对照组和试验组样品的OTU数目分别为142±102和143±67个。在门分类水平上,对照组和试验组草鱼肠道优势菌群均为放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes);相对于对照组,...

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【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验设计
    1.3 肠道样品采集
    1.4 肠道菌群分析方法及步骤
        1.4.1 样品基因组DNA提取及PCR扩增
        1.4.2 上机测序与数据统计
        1.4.3 数据分析
2 结果与分析
    2.1 草鱼肠道微生物多样性
    2.2 草鱼肠道菌群结构及其相对丰度
    2.3 草鱼肠道菌群结构Alpha多样性分析结果
    2.4 草鱼肠道菌群结构Beta多样性分析结果
3 讨论
4 结论



本文编号：3863058