中华鳖遗传多样性研究及其GHR、GHITM基因表达分析

发布时间：2023-11-25 03:59

　　中华鳖是我国淡水名特养殖对象,具有较高的经济价值。在其养殖业发展过程中因缺乏有效的品种选育,不同地理群体无序流动及国外群体的引入,导致当前中华鳖种质混杂,有关中华鳖遗传基础研究薄弱,遗传育种工作才刚刚起步。本研究利用高通量测序技术对雌雄中华鳖进行转录组测序,通过序列的拼接和注释,发掘与生长、性别等主要经济性状相关的候选基因,为中华鳖功能基因研究和分子育种工作提供有价值的信息。从转录组测序获得的Unigenes中筛选并验证了微卫星(SSR)标记,结合扩增片段长度多态性(AFLP)标记分析了中华鳖四个主要养殖群体的遗传多样性,并利用RT-PCR技术,对中华鳖生长激素受体(GHR)和生长激素诱导跨膜转运蛋白(GHITM)基因进行了基因克隆和表达分析。为中华鳖遗传分析、遗传连锁图谱构建及生长相关QTLs等工作提供了有力工具。主要结果如下：1.研究不同生长阶段中华鳖形态特征差异及雌雄中华鳖体重与形态特征差异,采用相关分析计算了形态特征与体重的关系,通径分析计算表型特征对体重的通径系数、决定系数,探讨各形态特征的对体重的影响程度。100日龄中华鳖腹甲长对体重影响最大,300日龄中华鳖体高对体重影响...

【文章页数】：115 页

【学位级别】：博士

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摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1 中华鳖种质资源现状
        1.1 中华鳖分布及种群
        1.2 种质资源研究
    2 水产动物分子标记辅助育种研究现状
        2.1 AFLP技术
        2.2 微卫星技术
    3 转录组学研究
        3.1 高通量测序技术发展概况
        3.2 转录组学
        3.3 转录组学的应用
        3.4 有无参考基因组的转录组测序研究
    4 水产动物生长相关基因研究现状
        4.1 生长激素受体基因研究进展
        4.2 生长激素诱导跨膜转运蛋白研究进展
    5 本文研究目的与意义
第二章 雌雄中华鳖转录组测序和分析
    1 试验材料与方法
        1.1 试验材料
        1.2 主要试剂与仪器
        1.3 试验方法
        1.4 数据处理
    2 结果与分析
        2.1 RNA提取和转录组文库的构建
        2.2 序列分析和拼接组装
        2.3 Unigene功能注释、GO分类和代谢途径分析
        2.4 差异基因表达分析
        2.5 微卫星标记分析
        2.6 生长相关基因与信号转导途径
        2.7 性别相关基因
    3 讨论
        3.1 中华鳖转录组文库总体评价
        3.2 生长相关基因筛选
        3.3 性别相关基因筛选
        3.4 SSR在中华鳖转录中的分布特点
    4 小结
第三章 中华鳖形态及群体遗传多样性分析
    1 中华鳖体重与形态特征的关联分析
        1.1 材料与方法
        1.2 结果与分析
        1.3 讨论
        1.4 小结
    2 雌雄中华鳖表型性状对体重的影响效果
        2.1 材料与方法
        2.2 结果与分析
        2.3 讨论
        2.4 小结
    3 遗传多样性微卫星分析
        3.1 材料和方法
        3.2 结果与分析
        3.3 讨论
    4 遗传多样性AFLP分析
        4.1 材料和方法
        4.2 结果与分析
        4.3 讨论
        4.4 小结
第四章 中华鳖GHR和GHITM基因克隆及表达
    1 试验材料和方法
        1.1 试验用鱼
        1.2 主要药品与试剂
        1.3 引物
        1.4 试验方法
    2 结果与分析
        2.1 中华鳖GHR及GHTIM cDNA克隆及序列分析
        2.2 基因编码氨基酸序列功能域分析
        2.3 蛋白质信号肽和蛋白跨膜区域预测
        2.4 氨基酸序列亲/疏水性分析
        2.5 蛋白二级结构预测
        2.6 蛋白的高级结构预测
        2.7 系统进化树分析
        2.8 组织表达特性及发育阶段变化
    3 讨论
        3.1 GHR基因
        3.2 GHITM基因
        3.3 GHR和GHITM在不同日龄雌雄中华鳖中的表达变化
结论、创新点及研究展望
    1. 研究结论
    2. 研究创新
    3. 展望
参考文献
缩略语
致谢
作者简历



本文编号：3867229