胰α-淀粉酶基因5'端调控序列与鱼类食性的关系

发布时间：2024-02-14 21:07

　　为了研究不同鱼类胰α-淀粉酶基因5’端调控序列转录因子差异与鱼类食性分化之间的关系。通过PCR克隆测序和查询NCBI数据库,获得32种鱼类胰α淀粉酶基因5’端824 bp序列,并对鱼类胰α淀粉酶基因5’端序列进行转录因子和系统发育分析。按不同的营养类型将鱼类分为杂食性、植食性和肉食性,通过百分比相似性分析不同食性鱼类的胰α淀粉酶基因转录因子的组成差异以及转录因子与鱼类食性的关系。结果显示:不同食性鱼类的胰α-淀粉酶基因5’端序列存在转录因子种类差异,植食性-肉食性鱼类差异主要体现在E47、C/EBPalpha、NF-Y和Pax-2,植食性-杂食性差异主要体现在deltaEF1、MyoD、NF-Y、AREB6和Pax-2,杂食性-肉食性差异主要体现在GATA-1、SRY、MyoD、HFH-8、AREB6、Pax-2、STAT5A和AP-1。系统发育结果与传统形态分类学大体相符,相同食性的鱼类并没有聚为一类。鱼类胰α-淀粉酶基因5’端调控序列中与食性分化相关的转录因子有E47、C/EBPalpha、NF-Y、Pax-2、deltaEF1、MyoD、AREB6、GATA-1、SRY、HFH-...

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【部分图文】：

图1克隆获得序列的部分片段

利用在线软件NNPP分析了这5种鱼类α-淀粉酶基因5?端序列的转录起始位点TSS(+1),(图1)。在α-淀粉酶基因转录起始位点上游-17(-19)处存在TATA-box,但是鳤的TATA-box序列“GG-ATATAAACTGCAC”和其他4种鱼类“GTATATA-AACTGC....

图232种鱼类转录因子类型的数量

本文研究的32种鱼类隶属12目、19科(表1)。利用胰α-淀粉酶基因对32种鱼类进行系统发育分析,根据胰α-淀粉酶基因启动子序列构建了系统进化树。结果显示,鲈形目鱼类深裂眶锯雀鲷、堇菜色猿线鳚、攀鲈、眼斑双锯鱼、大弹涂鱼、尖吻鲈和大黄鱼聚为一类;鲤形目鱼类草鱼、鳤、青鱼、鲮、鳙、....

图3淀粉酶基因5?侧翼序列的系统发育树分析

图232种鱼类转录因子类型的数量3讨论

本文编号：3898619