中国对虾SNP标记的开发及与耐高pH性状关联性分析

发布时间：2024-03-10 16:06

　　中国对虾(Fenneropenaeus chinensis),隶属节肢动物门(Arthropoda),甲壳纲(Crustacea),十足目(Decapoda),游泳亚目(Natantia),对虾亚目(Dendrobranchiata),对虾科(Penaeidae),明对虾属(Fenneropenaeus)。目前,中国对虾的育种方法主要依靠传统的人工选育,这种方法是根据中国对虾对环境的响应及耐受性的表型值进行选育的,传统选育需大批量的亲本,同时也存在很多无法确定性的因素,费时费力。可以与分子标记辅助选择育种(Molecular Marker-assisted Selection,MAS)结合,在选育优质新品种时得到了广泛的应用,其中,SNP标记作为第三代分子标记技术,有位点数量多,多态性丰富,能够稳定遗传,且检测方法简单快速等优点。目前,结合转录组的测序结果进行SNP位点的筛选及与相关性状的SNP标记关联分析已经成为重要的分子育种的研究方向之一。本研究在中国对虾转录组De novo测序的基础上,初步筛选得到967个SNP位点,再组建敏感组和抗性组进行BSA分析,利用直接测序法获得237个...

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【部分图文】：

图1-1直接测序法操作流程和结果示意图

上海海洋大学硕士学位论文5验需求，选择针对特定序列上特定位点进行检测，很少有某个体的某位点检测不出的情况，比较适合少量个体少量SNP位点的分型；缺点是大批量的SNP位点的分型，直接测序法的人力物力的相关费用就会相应提高。直接测序法操作流程和结果示意图：图1-1直接测序法操作流程和....

图1-2高通量测序法操作流程和结果示意图

上海海洋大学硕士学位论文5验需求，选择针对特定序列上特定位点进行检测，很少有某个体的某位点检测不出的情况，比较适合少量个体少量SNP位点的分型；缺点是大批量的SNP位点的分型，直接测序法的人力物力的相关费用就会相应提高。直接测序法操作流程和结果示意图：图1-1直接测序法操作流程和....

图1-3PCR-RFLP酶切法操作流程和结果示意图

上海海洋大学硕士学位论文6限制性片段长度多态性（restritionfragmentlengthpolymorphism，RFLP）是指有限制性酶切位点间的插入、缺失、重排或点突变所引起的基因型见限制性片段长度的差异。PCR-RFLP酶切法是通过PCR扩增一段DNA目标产物，然后....

图1-4PCR-LDR连接酶法操作流程和结果示意图

上海海洋大学硕士学位论文6限制性片段长度多态性（restritionfragmentlengthpolymorphism，RFLP）是指有限制性酶切位点间的插入、缺失、重排或点突变所引起的基因型见限制性片段长度的差异。PCR-RFLP酶切法是通过PCR扩增一段DNA目标产物，然后....

本文编号：3925051