盘丽鱼属鱼类线粒体基因组比较研究

发布时间：2024-03-27 06:13

　　随着全球观赏鱼贸易市场的蓬勃发展,捕捞力度和压力的逐年增加以及生态环境栖息地的不断恶化,亚马逊河流域的盘丽鱼属鱼类(Symphysodon)野生资源因此遭受到了比较严重的破坏。本文采用了分子生物学的手段首次对野生棕七彩神仙鱼和野生绿七彩神仙鱼的线粒体基因组全序列进行了分析,旨在探讨盘丽鱼属鱼类之间的系统发育进化关系,为该属鱼类的遗传进化提供更多的参考理论依据。具体研究内容如下:1.野生棕七彩神仙鱼和野生绿七彩神仙鱼线粒体基因组全序列测定采用第二代测序的方法,获得野生棕七彩神仙鱼和野生绿七彩神仙鱼的mtDNA全序列长度分别为16543bp和16545bp,其线粒体结构都包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个D-loop非编码区。在碱基构成上,H链编码的12个蛋白质编码基因都表现出显著的反G偏倚现象。通过与已知的该属野生黑格尔七彩神仙鱼的线粒体基因组序列进行比对分析,3种野生种类的同源蛋白质编码基因起始密码子均相同:CO1编码蛋白基因以GTG为起始密码子,而其余的12个编码蛋白基因的起始密码子都是标准的ATG起始密码子;终止密码子却不尽相同,即完整的TAA和T...

【文章页数】：51 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1野生棕七彩神仙鱼线粒体基因组结构

11图1-1野生棕七彩神仙鱼线粒体基因组结构Fig1-1.StructureofmitochondrialgenomeofSymphysodonharaldi1.2.2野生棕七彩神仙鱼线粒体基因组的组成与结构野生棕七彩神仙鱼线粒体基因组的碱基组成中，运用软件进....

图.趁从镶通，诬福

SeC（UCA）Ala（UGC）Asn（GUU）CysTyr（GUA）Ser（UGA）

图1-2野生棕七彩神仙鱼tRNA二级结构预测图

Glu（UUC）Thr（UGU）Pro（UGG）图1-2野生棕七彩神仙鱼tRNA二级结构预测图Fig1-2.PredictedsecondarystructuresofmitochondrialtRNAofSymphysodonharaldi1.2.....

图2-1野生绿七彩神仙鱼线粒体基因组结构

上海海洋大学硕士学位论文野生黑格尔七彩神仙鱼这3种鱼的线粒体基因组全序列放在NCBI生物信息数据库中搜索后，发现在已知的序列中相似度最高的是中北美一种慈鲷鱼-花身副丽鱼（Parachromismanaquensis），其NCBI登录号为KP728467，相似的程度都为88....

本文编号：3940304