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罗非鱼耐盐性状QTL作图研究

发布时间:2024-04-09 03:12
  罗非鱼原产于非洲及中东地区,是世界上重要的水产养殖品种之一,繁殖能力和适应性强。它能在海水和淡水中存活,是一种典型的广盐性鱼。目前,罗非鱼主要以淡水养殖为主,而我国的淡水资源有限,海水资源非常丰富,因此,提高罗非鱼的耐盐性以适应海水养殖显得尤为重要。罗非鱼养殖品种多,不同品种的罗非鱼生长速度和耐盐性相差较大。本研究主要选择生长速度快的吉富罗非鱼和星洲红罗非鱼为实验材料,首先对其耐盐区间进行QTL定位;其次,利用微卫星分子标记对该QTL区间进行验证;最后,对该区间中耐盐性相关候选基因进行筛选和鉴定。本研究的主要结果如下:1.吉富罗非鱼耐盐QTL分析和分子标记验证。首先根据QTL-seq测序的结果,将吉富罗非鱼耐盐性QTL定位于chrLG4:22670000-28455000及chrLG18:15550000-25125000区间内。为了验证该QTL定位的准确性,随后在LG4号染色体和LG18号染色体上各开发5个微卫星分子标记对该QTL区间进行验证,结果显示LG4和LG18这两个QTL区间都与耐盐性显著相关。2.星洲红罗非鱼耐盐QTL分析和分子标记验证。利用QTL-seq的方法对一个星洲红...

【文章页数】:82 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1-1吉富罗非鱼全同胞家系数量性状数据

图1-1吉富罗非鱼全同胞家系数量性状数据

图1-1吉富罗非鱼全同胞家系数量性状数据。红点代表耐盐组个体的存活时间,蓝点代表不耐盐的存活时间。Fig.1-1TraitdataforaFullsibfamilyofGIFTtilapia.Redspotsrepresentthesurvival....


图1-2QTLseq技术鉴定的吉富罗非鱼基因组上的QTL位点

图1-2QTLseq技术鉴定的吉富罗非鱼基因组上的QTL位点

LG6358140.720-4620.0360.007-0.LG7445034.920-3910.0370.006-0.LG8379541.220-3000.0360.004-0.LG9228234.020-2120.0370.011-0.....


图1-3对chrLG4上的QTLs峰值进行精细定位

图1-3对chrLG4上的QTLs峰值进行精细定位

非鱼耐盐性QTL区间的验证非鱼LG4号染色体耐盐性QTL区间验证(SSR)指DNA基因组中小于10个核苷酸的简单重复序列,行串联重复排列,因重复数不同而表现出多态性(Shehataeta分辨率高,遗传信息量大;稳定性强和多态性丰富;对变异反简单成本低、分析....


图1-4SSR442分子标记基因型的鉴定

图1-4SSR442分子标记基因型的鉴定

(1)微卫星分子标记的基因分型。为了进一步验证QTLseq高通量测序结果的准确性LG18号染色体上开发了5个微卫星分子标记,以分子标记SSR442为例,PAGE胶见图1据亲子代之间的遗传规律对图1-4的PAGE胶进行基因型读取,条带的读取原则为:子代带必须一....



本文编号:3949226

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