尼罗罗非鱼p38MAPK基因克隆与表达分析

发布时间：2024-05-13 19:41

　　为了探究p38MAPK与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)免疫功能的相关性,本实验运用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)获得尼罗罗非鱼埃及品系ntp38MAPK的cDNA全长序列,结果显示,该序列全长1 789 bp,开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)长1 086 bp,5′非编码区(Untranslated Region,UTR)长342 bp,3′UTR为361 bp。ORF编码361个氨基酸,预测分子量为41.598 kD,理论等电点为5.10。序列含有p38家族典型保守的Thr-Gly-Tyr(TGY)双磷酸化位点以及紧密相连的底物结合位点Ala-Thr-Arg-Trp(ATRW)。同源性以及系统进化树分析结果显示,尼罗罗非鱼的p38MAPK与大黄鱼(Larimichthys crocea)和鲈(Dicentrarchus labrax)的相似性最高。采用qRT-PCR的方法研究了ntp38MAPK在各组织以及无乳链球菌感染过程中的表达差异情况,结果显示,ntp38...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
    1.2 实验方法
        1.2.1 总RNA的提取及cDNA第一链的合成
        1.2.2 尼罗罗非鱼p38MAPK基因的cDNA克隆
        1.2.3 序列分析
        1.2.4 ntp38MAPK基因的组织表达分析
        1.2.5 ntp38MAPK基因链球菌感染后的表达分析
        1.2.6 统计学分析
2 结果与分析
    2.1 ntp38MAPK基因cDNA的克隆及序列分析
    2.2 同源性分析
    2.3 ntp38MAPK基因的组织表达分析
    2.4 无乳链球菌感染后ntp38MAPK表达分析
3 讨论



本文编号：3972615