浙南坛紫菜实验品系与传统品系遗传多样性的AFLP分析

发布时间：2024-05-22 02:04

　　本研究利用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术从基因组DNA水平上分析坛紫菜新品系浙南3号(ZN3)和浙江主要坛紫菜栽培品系(YH)的遗传差异,从16对选择性扩增引物中筛选出8对扩增效果好的引物,并用这8对引物对YH和ZN3 2个坛紫菜群体进行分析。结果显示,60个坛紫菜个体中共检测到964个有效位点,其中多态位点955个;坛紫菜2个群体整体水平上的多态位点百分率(PPL)为99.1%,2个群体各自的多态位点百分率分别是69.0%和81.5%,均值为75.3%。2个坛紫菜群体的Nei’s遗传多样性指数(H)为0.153 3和0.202 3,Shannon’s信息指数(I)为0.247 8和0.324 1,2个坛紫菜群体的总遗传变异(H_t)和群体内遗传变异(H_s)分别为0.240 2和0.177 8,群体间遗传分化系数(G_st)为0.252 6,即群体间遗传变异占总变异的25.3%,群体内遗传变异占总变异的74.7%,表明不同品系的群体间遗传分化程度较低。2个坛紫菜群体间基因流动系数(N_m)为1...

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图1坛紫菜部分AFLP选择性扩增结果

用16对引物组合对坛紫菜样品进行扩增,共筛选出以下8对多态性好的引物组合:E-AAC/M-CAG、E-AAC/M-CTC、E-AAC/M-CTG、E-AAG/M-CAG、E-AAG/M-CTC、E-AAG/M-CTG、E-AGG/M-CAA、E-ACC/M-CTG。用筛选出的8对....

图2基于遗传距离的坛紫菜UPGMA(A)和NJ(B)聚类树

表4群体间遗传相似度和遗传距离群体ZN3YHZN30.4111YH0.8890注:对角线上为遗传相似度;对角线下为遗传距离。3讨论

本文编号：3980238