三角帆蚌Dmrt1基因的分子特征和表达研究
发布时间:2024-06-07 18:50
Dmrt (Doble-sex and mab-3 relatated transcription factor)基因的主要功能是决定性别、分化性腺和形成组织和器官。为研究其在三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)性腺发育和分化过程中的作用,本实验通过比对三角帆蚌转录组序列和RACE扩增的方法,获得了三角帆蚌Dmrt1基因(HcDmrt1)全长cDNA,采用实时定量PCR的方法研究该基因在性腺发育和分化的表达情况。结果显示,HcDmrt1基因全长为1 561 bp,ORF区(开放阅读框区域) 1 161 bp,编码386个氨基酸。编码蛋白具有DM (Doublesex/MAB-3) Domain family保守结构域。三角帆蚌2~10月龄个体性腺荧光定量结果显示该基因参与了早期性腺发育;组织荧光定量结果显示,HcDmrt1在各组织中均有表达,但是在雌雄性腺组织中表达差异最大,雄性中表达量明显高于雌性。性腺的原位杂交结果显示,该基因主要在卵母细胞的细胞膜上检测到表达信号,在雄性性腺中,主要在滤泡腔中的精细胞观察到信号。由此推测,HcDmrt1基因参与了三角帆蚌的性腺发育过程。
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【部分图文】:
本文编号:3990949
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图1三角帆蚌HcDmrt1基因cDNA全长及推导的氨基酸序列
对HcDmrt1基因ORF区进行同源性检测,发现其与池蝶蚌(Hyriopsisschlegelii)同源性最高。通过ClustalW软件将HcDmrt1与其他物种的Dmrt1对比,再使用MEGA6.0建立NJ系统进化树(图4)。通过分析发现三角帆蚌与池蝶蚌(Hyriopsis....
图2Phyre2预测的HcDmrt1蛋白三级结构预测
图1三角帆蚌HcDmrt1基因cDNA全长及推导的氨基酸序列1.5HcDmrt1基因的组织表达差异分析
图3HcDmrt1与不同物种Dmrt1氨基酸序列比对
各组织荧光定量结果显示(图5),HcDmrt1在雄性中的相对表达量都比雌性高,在性腺和外套膜中的表达差异极显著;斧足中表达差异显著,在肝和鳃中表达差异不显著。2~10月龄性腺荧光定量结果显示(图6),HcDmrt1在2月左右高表达,随后表达量下降,在5~7月龄左右表达量再次上升,....
图3HcDmrt1与不同物种Dmrt1氨基酸序列比对
图3HcDmrt1与不同物种Dmrt1氨基酸序列比对图4不同物种HcDmrt1基因氨基酸序列构建的NJ系统进化树
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