青花菜钙依赖蛋白激酶基因BoCDPK1的克隆与表达

发布时间：2021-07-03 01:17

　　钙依赖蛋白激酶（calcium-dependent protein kinase,CDPK）为Ca²⁺传感蛋白,在植物生长发育和逆境响应中起着重要作用。在克隆青花菜BoCDPK1基因的基础上,开展序列分析、系统发育分析和表达分析,为后续的基因功能鉴定和抗逆育种奠定基础。该研究以青花菜为材料,利用PCR法克隆1个CDPK基因,利用生物信息学对序列进行分析,并采用qRT-PCR研究该基因在霜霉菌和核盘菌侵染下的表达模式。测序结果表明,BoCDPK1的基因组DNA全长为2 414 bp,具6个内含子,编码区全长为1 647 bp,编码548个氨基酸;BoCDPK1有1个S_TKc和4个EF手性结构域。多序列比对结果表明,BoCDPK1与芸薹属植物同源序列的相似性最高,仅个别氨基酸残基存在差异,它们在系统发育树上聚于一组。qRT-PCR结果表明,BoCDPK1的表达受霜霉菌和核盘菌的诱导,表达量均呈现先上升后下降的规律。在霜霉菌的诱导下,BoCDPK1的表达量在72 h达最大值,为对照的3.4倍;而在核盘菌侵染下,BoCDPK1的表达量在36 h达最大... 

【文章来源】：浙江农业学报. 2020,32(04)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

BoCDPK1基因的克隆

BoCDPK1基因的结构

系统发育分析结果表明,青花菜BoCDPK1与3种芸薹属植物的CDPK处于同一分支,支持率达100%,它们再与山嵛菜(Eutrema salsugineum, XP_024016164)聚于一组,支持率较小,仅为53%;3种棉属植物聚于同一分支,支持率达100%,它们与大戟科(Euphorbiaceae)的麻风树(Jatropha curcas, XP_020535061)和蓖麻(Ricinus communis, NP_001310655)聚于一组;十字花科的亚麻荠(Camelina sativa, XP_010467489)和荠(Capsella rubella, XP_006297360)聚于一组,支持率为89%;而山柑科(Capparaceae)的醉蝶花(Tarenaya hassleriana, XP_010548179)与豆科(Leguminosae)的大豆(Glycine max, XP_003519696)单独成组(图5)。图4 BoCDPK1部分序列及其同源蛋白的比较

【参考文献】：
期刊论文
[1]盐藻CDPK基因的克隆与生物信息学分析[J]. 张晓琳,柴晓杰,张婷,余祝君,薛飞.  核农学报. 2013(04)
[2]普通烟草CDPK基因家族的克隆及表达分析[J]. 太帅帅,刘贯山,孙玉合,陈珈.  中国农业科学. 2009(10)



本文编号：3261565