芥蓝miR156a家族进化特性及表达分析

发布时间：2023-11-24 22:17

　　miRNA广泛参与植物的发育过程。芥蓝形态多样,叶片发育因品种而异。为了解miR156a家族的进化特性及其在芥蓝叶片发育中的表达模式。该研究对芥蓝miR156a成员及其前体pre-miR156a成员进行生物信息学分析,比较不同品种芥蓝叶形的差异,并采用qRT-PCR方法分析芥蓝不同组织部位中pre-miR156a的表达水平、以及叶形相似的芥蓝品种‘翠宝’和‘改良香菇’中不同类型叶片的pre-miR156a成员及其靶基因的表达水平。结果表明:(1)多序列比对和进化树分析发现芥蓝miR156a家族成员和pre-miR156a-3p₁在进化过程中高度保守;二级结构预测发现pre-miR156a每个成员均能形成茎环结构并包含2～3个miR156a成员序列;靶基因预测显示miR156a-5p和miR156a主要靶向SPL,而miR156a-3p₁则靶向CTPS等不同的基因。(2)‘翠宝’和‘改良香菇’芥蓝的叶形最为相似,qRT-PCR分析显示,pre-miR156a在‘翠宝’营养生长期的叶片中高度表达。(3)pre-miR156a成员在‘翠宝’和‘改良...

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料种植及取样
    1.2 引物设计及靶基因预测
    1.3 荧光定量PCR分析
2 结果与分析
    2.1 植物miR156a序列分析
    2.2 植物pre-miR156a进化树分析
    2.3 芥蓝pre-miR156a成员二级结构分析
    2.4 芥蓝miR156a成员靶基因预测分析
    2.5 pre-miR156a成员和SPL2/10/15在‘翠宝’和‘改良香菇’芥蓝不同类型叶片中的表达分析
3 讨 论
    3.1 芥蓝miR156a成员进化分析
    3.2 芥蓝miR156a成员靶基因SPL分析
    3.3 芥蓝miR156a成员及其候选靶基因在不同类型叶片中的表达模式
4 结 论



本文编号：3866698