伊氏锥虫（Trypanosoma evansi）全基因组的深入分析及抑制剂靶向关键酶的初步研究

发布时间：2021-07-02 20:58

　　伊氏锥虫（Trypanosoma evansi）是一种真核的单细胞血液鞭毛虫,寄生于几乎所有的脊椎动物体内,能通过蝇、虻作为媒介（vector）在动物之间传播,也可通过生食感染动物的肉和血经破损的黏膜组织直接传播。伊氏锥虫感染野生动物和家畜引起动物锥虫病,又称苏拉病（Surra）,该病广泛分布于热带和亚热带地区。近年来,也有伊氏锥虫感染人的报道,提示伊氏锥虫具有成为人兽共患寄生虫病病原的可能性。目前对该病的有效防治手段较少,其对畜牧业和野生动物的危害仍然严重。伊氏锥虫利用其体表变异的表面糖蛋白（VSG）逃避宿主的免疫识别,深入解析该病原的分子生物学特性是建立有效防治措施的理论依据。伊氏锥虫的近缘物种布氏锥虫（Trypanosoma brucei）的基因组数据为伊氏锥虫和布氏锥虫的比较基因组学研究提供了良好的基础。伊氏锥虫的20 S蛋白酶体（20 S Proteasome）和磷酯酰肌醇3-激酶（PI3K）参与蛋白质降解途径和PI3K-AKT信号通路,抑制这两种酶的活性能够影响虫体生长发育和凋亡,二者有望成为潜在的新药靶标。本研究利用三代PacBio SMART测序平台,构建伊氏锥虫的27... 

【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省

【文章页数】：137 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

伊氏锥虫的形态结构

沈阳农业大学博士学位论文11末端外显子（alternativepolyAsiteandterminalexon）。其中，内含子保留和外显子跳跃是哺乳动物最常见的AS方式，至少占已知所有AS的三分之一(Sammethetal,2008)。可变的5"或3"剪接点AS也很常见，共同占已知AS事件的四分之一，这种类型的AS能够在编码序列中引入极细微的变化，差异仅为单个密码子，例如人基因组中约30%的基因包含NAGNAG序列，这些序列有可能充当串联剪接位点的受体(Michaeletal,2004)。图1-2真核生物转录的可变剪接(Michaeletal,2004)图中左侧为真核生物的七种类型可变剪接，右侧为这七种可变剪接形成的不同转录产物。Figure1-2ASeventsineukaryotetranscripts(original)TheleftcolumisseventypesofASineukaryotes,whiletherightcolumistheirdifferenttranscriptionproducts.

第一章文献综述14图1-3真核生物的剪接机制（ZefengandBurge,2008)（A）剪接体组装的复合体示意图，SR蛋白与剪接增强子位点结合，U1snRNP和U2AF分别与供体位点和受体位点结合。U2snRNP与分支点结合(Matlinetal,2005b)；（B）剪接抑制的广义模型。剪接抑制蛋白(多数为hnRNPs)与外显子(ESS)和内含子(ISS)中的剪接沉默子结合。它们抑制U1snRNP与供体位点的结合，抑制U2AFS和U2snRNP与受体位点和分支点的结合。这个过程导致跳过外显子(黄色)形成剪接抑制(ZefengandBurge,2008)；（C）剪接活化的广义模型。ESE为外显子，ISE为内含子。U1snRNP和U2AFS、U2snRNP分别与受体和供体位点结合(ZefengandBurge,2008)。Figure1-3Mechanismofsplicingineukaryotes(A)Complexofspliceosomeassembly.SRbindstothespliceenhanersiteandassistsU1snRNPtobindtothedonorsite,andU2AFbindstoacceptorsiteandthepolypyrimidinebundle.U2snRNPbindswithbranchpoint;(B)Generalizedmodelofspliceinhibition.Splicinginhibitoryproteins(mostlyhnRNPs)bindtosplicesilencersinexons(ESS)andintrons(ISS).TheyinhibitthebindingofU1snRNPtothedonorsiteandthebindingofU2AFSandU2snRNPtotheacceptorsiteandthebranchsite.Thisprocesscausesskippingexons(yellow)toformsplicesuppression;(C)GeneralizedModelofSplicingActivation.Splicingactivatingproteins(mainlySRproteins)bindtosplicingenhancersinexons(ESE)andintrons(ISE).TheyfacilitatethebindingofU1snRNPtothedonorsiteandthebindingofU2AFSandU2snRNPtotheacceptorsiteandthepivot.1.2.1.5可变剪接的分析方法对全基因组范围内的AS分析有很多种方法。对大量EST测序，通过比较序列差异寻找AS转录产物的方法具

【参考文献】：
期刊论文
[1]26S蛋白酶体的结构生物学研究进展[J]. 王丰,施一公.  中国科学:生命科学. 2014(10)



本文编号：3261217