双孢蘑菇转录组测序及酶促褐变相关基因筛选的研究

发布时间：2020-06-11 01:45

【摘要】：双孢蘑菇味道鲜美,营养丰富,但采后极易褐变,造成严重的经济损失。为从分子水平研究双孢蘑菇酶促褐变的机理,本研究以双孢蘑菇为试验材料,将4℃贮藏组和短波紫外线照射组在三个贮藏时间的双孢蘑菇菌盖进行转录组测序,对转录组测序结果进行测序数据评估、参考序列比对分析、基因表达水平分析、相关性分析、差异表达分析、GO富集分析及KEGG富集分析,并采用与RT-PCR结合的方法,筛选出与酶促褐变相关的基因,为今后双孢蘑菇抗褐变改良储备基因资源,为后期改进双孢蘑菇品质提供理论基础。具体研究结果如下:(1)采用Trizol法提取六个双孢蘑菇菌盖样品的总RNA,能够高效的提取双孢蘑菇RNA,并采用三种检测方法检测总RNA,结果表明RNA纯度高、完整性好,符合质量要求,可以进行后续测序。总RNA检测合格后,进行RNA-seq文库的构建,并库检合格。构建得到的文库经过Illumina HiSeq~(TM)测序平台对其进行测序,得到后的测序数据通过测序数据质量评估、参考序列比对分析、基因表达分析和RNA-Seq相关性检查等检测过程,结果表明转录组测序数据的数量和质量较高,基因表达水平较高,样本选择可靠且合理,可对其进行后续分析。(2)4℃贮藏期间双孢蘑菇褐变度随着贮藏时间的延长呈现逐渐增加的趋势,并对此条件下的双孢蘑菇菌盖转录组进行转录组测序,共获得176 329 392个raw reads,168 607 212个高质量的clean reads。按照，

本文编号：2707199