自然发酵乳中乳酸乳球菌乳酸亚种群体遗传学和功能基因组学研究

发布时间：2021-08-01 21:34

　　乳酸乳球菌乳酸亚种（Lactococcus lactissubsp.lactis,L.lactissubsp.lactis）是乳球菌属的模式种,既是自然发酵乳中常见乳酸菌,也是生产奶酪和低温发酵乳等发酵乳制品常用的发酵剂菌种之一。L.lactis subsp.lactis具有广泛的应用前景和较高的经济价值。系统解析L.lactis subsp.lactis的遗传背景、进化历程和功能特征对开发利用L.lactis subsp.lactis有着极为重要的意义。但从群体基因组水平解析L.lactis subsp.lactis遗传背景和功能特征的研究鲜有报道。本研究采用Illumina Hiseq高通量测序平台完成了 227株分离自自然发酵乳制品中的L.lactis subsp.lactis基因组重测序技术,结合NCBI已公布的89株全基因组序列,利用群体遗传学手段解析了L.lactis subsp.lactis群体的遗传背景、系统发育关系和种群结构,揭示了不同遗传谱系菌株的功能特征,利用全基因关联分析（genome-wide association analysis,GWAS）在基因组中对与... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：87 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２?２２７株菌株所有变异位点在基因组上的分布图??

翻P分布规律直方圈

图６?２２７株菌株群体的ｌｇ（Ｋａ／Ｋｓ）值和Ｔａｊｉｍａ’ｓ?Ｄ值在基因组上的分布??Ｆｉｇｕｒｅ．６．?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｌｇ（Ｋａ／Ｋｓ）?ａｎｄ?Ｔａｊｉｍａ＇ｓ?Ｄ?ｖａｌｕｅｓ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｇｅｎｏｍｅ?ｏｆ?２２７?ｓｔｒａｉｎｓ??

【参考文献】：
期刊论文
[1]细菌全基因组关联研究的方法与应用[J]. 杨超,杨瑞馥,崔玉军.  遗传. 2018(01)
[2]群体基因组学在乳酸菌研究中的应用[J]. 孙志宏.  中国食品学报. 2017(08)
[3]传统发酵乳制品中微生物多样性研究[J]. 李伟程,侯强川,于洁,孙志宏,孙天松.  食品工业科技. 2018(01)
[4]自然发酵乳制品中乳酸菌的生物多样性[J]. 张和平.  生命科学. 2015(07)

博士论文
[1]德氏乳杆菌保加利亚亚种的群体遗传学和功能基因组学研究[D]. 宋宇琴.内蒙古农业大学 2018
[2]自然发酵乳中嗜热链球菌群体遗传学和功能基因组学研究[D]. 赵洁.内蒙古农业大学 2018
[3]高黏附力重组乳酸乳球菌靶向投递KiSS1蛋白对结直肠癌细胞的抑制作用研究[D]. 张博.中国农业大学 2017



本文编号：3316285