肉类食品中沙门氏菌耐药性与代谢特征关系的研究
发布时间：2021-11-15 05:24
沙门氏菌（Salmonella）是一种典型的食源性致病菌,其污染对国民健康构成了严重的威胁。随着抗生素的广泛使用,沙门氏菌的耐药性也日益严重,其在食品生产链的各个环节都可能存在,并通过食品对人类健康造成严重的危害。耐药沙门氏菌在食品链的分布情况与传播机制已经成为当前研究热点,亟需开展不同食品链环节的沙门氏菌耐药性相关研究。本论文以肉类食品在养殖、屠宰和零售三个食品链环节的181株沙门氏菌为研究对象,研究食源性沙门氏菌耐药性的空间分布,并基于代谢组学分析耐药性与代谢特征之间的关系,为耐药机制研究和干预防控提供新的思路与方法,主要内容如下:1.研究肉类食品中沙门氏菌耐药性的空间分布特征。通过食品链各环节样品采集发现,养殖环节沙门氏菌污染最为严重（74.18%）,且血清型相对单一。零售环节污染率为16.68%,但血清型种类丰富;屠宰环节污染则相对较低（7.14%）。所有分离菌株对环丙沙星、左氧氟沙星和甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲噁唑均呈现耐药性。养殖环节中对1015种抗生素耐药的沙门氏菌占56.72%,对超过15种抗生素耐药的沙门氏菌占20.90%;零售环节对51
【文章来源】：江南大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
沙门氏菌致病机理[10]
第一章绪论3门氏菌中都至少对一种及以上的抗生素呈现出耐药性，其中四环素（68%）、链霉素（61%）等抗生素的耐药情况较为严重[30]。同样，我国食源性沙门氏菌耐药情况也非常严峻，60年代对两种及以上抗生素耐药的沙门氏菌仅占37%[31]，而如今对8~9种抗生素耐药的沙门氏菌已成为了普遍现象，可占到80%~85%[32,33]。2012年至2016年期间，我国各地区在对肉类食品沙门氏菌的检测中发现，分离鉴定得到的沙门氏菌中平均90%都具有耐药情况，其中75%左右的沙门氏菌还呈现出多重耐药性，主要对萘啶酸、氨苄西林、四环素、环丙沙星以及头孢类抗生素的耐药性较高[34-36]。这一类抗生素药物常被用于治疗沙门氏菌感染，因此在环境选择压力下，沙门氏菌对这几类抗生素的耐药性逐渐强化且逐步呈现多重耐药，这对于人体感染后的治疗是非常不利的。图1-2我国抗生素用量及人源分离菌耐药性[37]Figure.1-2ConsumptionofantimicrobialsandantimicrobialresistanceofhumanisolatesinChina1.1.4食源性沙门氏菌不同血清型的耐药性分布众多调查研究表明，沙门氏菌的耐药性和血清型呈现出一定的相关性。肠炎和伤寒
江南大学硕士学位论文6图1-3基因水平的抗生素耐药生态体系[57]Figure.1-3Gene-levelantibioticsuspicionecosystem1.2.3水解或修饰抗生素细菌可以通过水解或修饰作用破坏抗生素的结构，使其失去活性从而获得耐药性。目前细菌体内发现的抗生素灭活酶主要分为两种，水解酶和钝化酶。β内酰胺酶（BLA）是一种革兰氏阴性菌常用于水解β-内酰胺类抗生素的酶，其通过破坏β内酰胺单环，改变抗生素构象，使之失活，导致细菌对青霉素等β-内酰胺类抗生素耐药[58]。常见的水解酶有超广谱β-内酰胺酶（ESBLs），金属β-内酰胺酶（MBLs）和头孢菌素类β-内酰胺酶等[59]。Luke等人[60]通过对环境和肉类等多种来源沙门氏菌进行基因测序，发现40%的沙门氏菌株都具有BLA相关或同源基因，且在耐药性检测中，对四环素、链霉素和磺酰胺类等抗生素均呈现出耐药性。氨基糖苷类抗生素具有较多暴露的羟基和酰胺基团的大分子，因此菌体内的修饰酶更容易修饰该类抗生素而获得高水平的抗性。目前研究中常见的氨基糖苷修饰酶有乙酰转移酶、磷酸转移酶和核苷酸转移酶[61]。乙酰转移酶通过破坏氨基糖苷类抗生素的羟基或酰胺基，从而影响了其与菌体rRNA的结合，引发相关抗生素的耐药性[62]；磷酸转移酶则是通过使抗生素发生磷酸化，影响其与核糖体A位点的结合能力，从而导致耐药性的产生。核苷酸转移酶利用三磷酸腺苷（ATP）作为第二底物，转移ATP部分的单磷酸核苷到抗生素的羟基基团上，从而进行抗生素的修饰，使其失活[63]。1.3代谢组学及其在微生物中的研究1.3.1代谢组学概述在后基因组时代，代谢组学，转录组学和蛋白质组学已经成为系统生物学研究中的重要研究工具[64]。代谢组学作为一种研究生物系统中所有代谢物的综合分析方法，通过
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国2010—2016年家庭食源性疾病暴发事件流行特征分析[J]. 张晶,李薇薇,杨淑香,郭云昌,付萍. 中国公共卫生. 2019(10)
[2]湖南地区猪源和鸡源沙门氏菌的分离鉴定与耐药性分析[J]. 夏宇飞,周汝顺,黎满香. 湖南农业科学. 2019(07)
[3]鸡沙门氏菌耐药性研究进展[J]. 李凤玲,秦俊,吕宗德,刘婷婷,黄鑫. 农业开发与装备. 2019(05)
[4]关于畜牧业生产中兽用抗菌药减量化使用问题[J]. 万遂如. 养猪. 2019(02)
[5]沙门氏菌中与萘啶酮酸和环丙沙星抗性相关基因及突变的检测分析[J]. 黄巾凌,王嘉炜,牛沁雅,廉鲁昕,尹明远,武运,杨保伟. 食品科学. 2019(22)
[6]食品中耐药细菌风险评估的研究进展[J]. 姜竹茂,艾春梅,王晔茹,董庆利,刘东红,丁甜. 食品科学. 2019(05)
[7]沙门氏菌对常用抗菌药物的耐药机制研究进展[J]. 邓飞,陈斌,邵靓,李丽,邱明双,周莉媛. 畜禽业. 2018(11)
[8]河南省临床鼠伤寒沙门氏菌的耐药性分析[J]. 李永瑞,李艳. 河南科技大学学报(医学版). 2018(03)
[9]肉鸡生产中如何规范、减量使用抗菌素[J]. 王建. 兽医导刊. 2018(11)
[10]1996—2015年间沙门氏菌食物中毒事件特征分析[J]. 李光辉,高雪丽,郭卫芸,王永辉,孙思胜. 食品工业. 2018(05)
硕士论文
[1]大肠杆菌脂多糖影响HeLa细胞胞内ATP能量的传感检测及代谢机制研究[D]. 张入元.江南大学 2019
[2]南宁市售鲜肉中四种食源菌的监测及沙门氏菌致病性和耐药性的研究[D]. 吴科敏.广西大学 2017
[3]新疆动物源沙门氏菌耐药性及MLST分析[D]. 江萍.新疆农业大学 2017
[4]河北省鸡沙门氏菌的分离鉴定及耐药性分析[D]. 刘新静.山东农业大学 2015
[5]2012-2013四川部分地区市售鸡肉中沙门氏菌污染及耐药性分析[D]. 韦婷.四川农业大学 2015
本文编号：3496122
【文章来源】：江南大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
沙门氏菌致病机理[10]
第一章绪论3门氏菌中都至少对一种及以上的抗生素呈现出耐药性，其中四环素（68%）、链霉素（61%）等抗生素的耐药情况较为严重[30]。同样，我国食源性沙门氏菌耐药情况也非常严峻，60年代对两种及以上抗生素耐药的沙门氏菌仅占37%[31]，而如今对8~9种抗生素耐药的沙门氏菌已成为了普遍现象，可占到80%~85%[32,33]。2012年至2016年期间，我国各地区在对肉类食品沙门氏菌的检测中发现，分离鉴定得到的沙门氏菌中平均90%都具有耐药情况，其中75%左右的沙门氏菌还呈现出多重耐药性，主要对萘啶酸、氨苄西林、四环素、环丙沙星以及头孢类抗生素的耐药性较高[34-36]。这一类抗生素药物常被用于治疗沙门氏菌感染，因此在环境选择压力下，沙门氏菌对这几类抗生素的耐药性逐渐强化且逐步呈现多重耐药，这对于人体感染后的治疗是非常不利的。图1-2我国抗生素用量及人源分离菌耐药性[37]Figure.1-2ConsumptionofantimicrobialsandantimicrobialresistanceofhumanisolatesinChina1.1.4食源性沙门氏菌不同血清型的耐药性分布众多调查研究表明，沙门氏菌的耐药性和血清型呈现出一定的相关性。肠炎和伤寒
江南大学硕士学位论文6图1-3基因水平的抗生素耐药生态体系[57]Figure.1-3Gene-levelantibioticsuspicionecosystem1.2.3水解或修饰抗生素细菌可以通过水解或修饰作用破坏抗生素的结构，使其失去活性从而获得耐药性。目前细菌体内发现的抗生素灭活酶主要分为两种，水解酶和钝化酶。β内酰胺酶（BLA）是一种革兰氏阴性菌常用于水解β-内酰胺类抗生素的酶，其通过破坏β内酰胺单环，改变抗生素构象，使之失活，导致细菌对青霉素等β-内酰胺类抗生素耐药[58]。常见的水解酶有超广谱β-内酰胺酶（ESBLs），金属β-内酰胺酶（MBLs）和头孢菌素类β-内酰胺酶等[59]。Luke等人[60]通过对环境和肉类等多种来源沙门氏菌进行基因测序，发现40%的沙门氏菌株都具有BLA相关或同源基因，且在耐药性检测中，对四环素、链霉素和磺酰胺类等抗生素均呈现出耐药性。氨基糖苷类抗生素具有较多暴露的羟基和酰胺基团的大分子，因此菌体内的修饰酶更容易修饰该类抗生素而获得高水平的抗性。目前研究中常见的氨基糖苷修饰酶有乙酰转移酶、磷酸转移酶和核苷酸转移酶[61]。乙酰转移酶通过破坏氨基糖苷类抗生素的羟基或酰胺基，从而影响了其与菌体rRNA的结合，引发相关抗生素的耐药性[62]；磷酸转移酶则是通过使抗生素发生磷酸化，影响其与核糖体A位点的结合能力，从而导致耐药性的产生。核苷酸转移酶利用三磷酸腺苷（ATP）作为第二底物，转移ATP部分的单磷酸核苷到抗生素的羟基基团上，从而进行抗生素的修饰，使其失活[63]。1.3代谢组学及其在微生物中的研究1.3.1代谢组学概述在后基因组时代，代谢组学，转录组学和蛋白质组学已经成为系统生物学研究中的重要研究工具[64]。代谢组学作为一种研究生物系统中所有代谢物的综合分析方法，通过
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国2010—2016年家庭食源性疾病暴发事件流行特征分析[J]. 张晶,李薇薇,杨淑香,郭云昌,付萍. 中国公共卫生. 2019(10)
[2]湖南地区猪源和鸡源沙门氏菌的分离鉴定与耐药性分析[J]. 夏宇飞,周汝顺,黎满香. 湖南农业科学. 2019(07)
[3]鸡沙门氏菌耐药性研究进展[J]. 李凤玲,秦俊,吕宗德,刘婷婷,黄鑫. 农业开发与装备. 2019(05)
[4]关于畜牧业生产中兽用抗菌药减量化使用问题[J]. 万遂如. 养猪. 2019(02)
[5]沙门氏菌中与萘啶酮酸和环丙沙星抗性相关基因及突变的检测分析[J]. 黄巾凌,王嘉炜,牛沁雅,廉鲁昕,尹明远,武运,杨保伟. 食品科学. 2019(22)
[6]食品中耐药细菌风险评估的研究进展[J]. 姜竹茂,艾春梅,王晔茹,董庆利,刘东红,丁甜. 食品科学. 2019(05)
[7]沙门氏菌对常用抗菌药物的耐药机制研究进展[J]. 邓飞,陈斌,邵靓,李丽,邱明双,周莉媛. 畜禽业. 2018(11)
[8]河南省临床鼠伤寒沙门氏菌的耐药性分析[J]. 李永瑞,李艳. 河南科技大学学报(医学版). 2018(03)
[9]肉鸡生产中如何规范、减量使用抗菌素[J]. 王建. 兽医导刊. 2018(11)
[10]1996—2015年间沙门氏菌食物中毒事件特征分析[J]. 李光辉,高雪丽,郭卫芸,王永辉,孙思胜. 食品工业. 2018(05)
硕士论文
[1]大肠杆菌脂多糖影响HeLa细胞胞内ATP能量的传感检测及代谢机制研究[D]. 张入元.江南大学 2019
[2]南宁市售鲜肉中四种食源菌的监测及沙门氏菌致病性和耐药性的研究[D]. 吴科敏.广西大学 2017
[3]新疆动物源沙门氏菌耐药性及MLST分析[D]. 江萍.新疆农业大学 2017
[4]河北省鸡沙门氏菌的分离鉴定及耐药性分析[D]. 刘新静.山东农业大学 2015
[5]2012-2013四川部分地区市售鸡肉中沙门氏菌污染及耐药性分析[D]. 韦婷.四川农业大学 2015
本文编号：3496122
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