基于转录组学数据的急性髓细胞白血病分子标志物研究

发布时间：2020-06-22 15:32

【摘要】：癌症的复发转移导致百分之九十的患者直接死亡。分析癌症复发转移的分子机制是肿瘤研究的重要领域,通过分子标志物研究,对于癌症的早期诊断、个体化治疗与预后判断等都具有极其重要的理论意义与应用价值。急性髓细胞白血病具有高度异质性且死亡率较高,通过整合转录组学数据,从系统生物学的角度发现决定癌症复发转移的分子标志物,对于改进癌症转移复发预测和提高预后预测的准确度具有重要意义。本研究有效地整合了多种转录组学数据,基于网络功能模块挖掘算法发现了GMI分子标志物。首先,通过收集861名AML患者和75名正常人群的转录组学数据确定差异表达基因。其次,基于miRWalk算法实现识别功能性miRNA-mRNA调控模块。然后,收集癌症基因组图谱的转录组学数据,在训练集中构建基于GMI分子标志物的随机生存森林预测模型,并对独立测试集进行测试。最后,基于单变量和多变量Cox比例风险回归分析对GMI分子标志物的有效性进行评价。在本研究中,我们将23个差异表达基因和16个互作靶向miRNA命名为GMI分子标志物,并基于构建的随机生存森林模型的评分系统将独立的患者群组分为总体存活率显著不同的两组。研究表明,GMI分子标志物与白血病转移复发密切相关。基于GMI分子标志物的构建的RSF预后模型能够有效预测白血病患者的预后。
【学位授予单位】：合肥工业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R733.71;Q811.4
【图文】：

18图 1 总体流程图Fig 1 Outline of the study design3.2 AML 数据集的样本收集和处理3.2.1 PubMedPubMed 是一个关于生物医学方面公开的非付费的搜索引擎，它的数据库的最主要来源是 MEDLINE，这是当前网上使用最为广泛的综合信息数据库之一，也是

miRNA-mRNA功能网络图

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 戢莉;;新的分子标志物在骨髓增殖性肿瘤中的研究进展[J];健康之路;2017年10期

2 姚春;相关分子标志物在前DIC诊断中的意义[J];临床血液学杂志;1998年06期

3 卜庆伟;张枝焕;夏星辉;;分子标志物参数在识别土壤多环芳烃(PAHs)来源中的应用[J];土壤通报;2008年05期

4 李刚,沈玉祥;血栓分子标志物在评估非瓣膜性心房颤动患者血栓栓塞危险性的临床价值[J];临床心血管病杂志;2004年09期

5 王珂;李雪梅;;相关分子标志物检测在pre-DIC诊断中的意义[J];现代检验医学杂志;2006年02期

6 李文鹤;童f ;梁悦;张琳;周亦武;;创伤性脑损伤后生物分子标志物的研究进展[J];中国法医学杂志;2017年02期

7 管考鹏;李长岭;;肾细胞癌相关分子标志物研究现状及进展[J];癌症进展;2007年06期

8 李志广;弥散性血管内凝血分子标志物诊断的临床应用进展[J];中国实验诊断学;1999年04期

9 高艳华,梁友信;二硫化碳的生物学监测及分子标志物研究[J];中华劳动卫生职业病杂志;1997年02期

10 刘刚,赵建宁;早期骨关节炎评估中分子标志物的意义[J];中国临床康复;2005年10期

相关会议论文 前10条

1 丁晓萍;;寻找蛋白质分子标志物及其在纯化过程的分析[A];2008年全国生物化学与分子生物学学术大会论文摘要[C];2008年

2 蒋焱熠;刘一臻;商利;石超;郝佳洁;张钰;徐昕;蔡岩;王明荣;;肺癌早期分子标志物研究[A];细胞—生命的基础——中国细胞生物学学会2013年全国学术大会·武汉论文摘要集[C];2013年

3 吴一龙;张绪超;;肺癌分子标志物及临床应用[A];第十三届中国科协年会第18分会场-癌症流行趋势和防控策略研究研讨会论文集（补充）[C];2011年

4 李建芳;朱正纲;刘炳亚;;以肿瘤分子标志物为基础的转化医学研究进展[A];第9届全国胃癌学术会议暨第二届阳光长城肿瘤学术会议论文汇编[C];2014年

5 宋韦;;肿瘤分子标志物发现和验证:问题和策略讨论[A];2010’全国肿瘤分子标志及应用学术研讨会暨第五届中国中青年肿瘤专家论坛论文汇编[C];2010年

6 林能明;;基于分子标志物检测技术的NSCLC精准治疗实践[A];2015年浙江省医学会临床药学分会、浙江省中西医结合学会中药分会学术会议论文集[C];2015年

7 程克斌;高蓓兰;苏奕亮;徐金富;;肺癌患者血栓前状态分子标志物检测及其意义[A];中华医学会呼吸病学年会——2013第十四次全国呼吸病学学术会议论文汇编[C];2013年

8 李冬伟;汉景泰;孙会国;李东;庞忠和;崔琳琳;王旭;曹蕴宁;刘卫国;;长白山-贝加尔湖断面水生植物正构烷烃及其氢同位素与环境水的分馏关系[A];中国科学院地质与地球物理研究所2015年度（第15届）学术论文汇编——新生代地质与环境研究室[C];2016年

9 蒋焱熠;刘一臻;商利;郝佳洁;张钰;徐昕;蔡岩;王明荣;;肺癌分子标志物及其临床相关性研究[A];中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会论文摘要汇编（2009-2013）[C];2013年

10 赵瑶瑶;张四纯;张新荣;;生物标志物的固相微萃取探针快速富集常压质谱检测[A];中国化学会第二届全国质谱分析学术报告会会议摘要集[C];2015年

相关重要报纸文章 前4条

1 健康时报记者 吴润果 田茹 韦川南;治癌不要喜新厌旧[N];健康时报;2012年

2 胡德荣;新型胃癌分子标志物研究获突破[N];中国医药报;2010年

3 陈英云 乔蕤琳;我省专家利用系列生物信息方法识别重大疾病风险分子标志物[N];黑龙江经济报;2010年

4 记者李天舒;新的鼻咽癌分子标志物被发现[N];健康报;2011年

相关博士学位论文 前10条

1 胡朔枫;泛癌症分析及基于泛癌症分子标志物的肿瘤预后模型构建[D];中国人民解放军军事医学科学院;2017年

2 柏景乔;膀胱癌和乳腺癌相关分子标志物的研究[D];北京协和医学院;2012年

3 谢丽华;COPD动态miRNA表达谱的构建及血清miRNA分子标志物的筛选与鉴定[D];中南大学;2014年

4 王帅;非小细胞肺癌分子标志物的临床意义及靶向治疗相关研究[D];北京协和医学院;2014年

5 张舒;肝病中血清结合珠蛋白β亚基的N-糖基化修饰及意义[D];复旦大学;2012年

6 张文玲;鼻咽癌发病不同阶段分子标志物的鉴定及差异表达基因相互作用网络的构建[D];中南大学;2009年

7 沈胤晨;结直肠癌分子标志物及临床意义研究[D];北京协和医学院;2016年

8 易呈浩;结直肠肿瘤分子标志物的应用研究及结直肠癌临床分期的优化[D];浙江大学;2016年

9 郑浩;肝炎病毒感染调控肝癌增殖和转移作用和机制的研究[D];第二军医大学;2017年

10 程捷瑶;早期胃癌及癌前病变的分子特征及内镜治疗决策的研究[D];北京协和医学院;2017年

相关硕士学位论文 前10条

1 徐国富;基于转录组学数据的急性髓细胞白血病分子标志物研究[D];合肥工业大学;2019年

2 任晓艳;红细胞体积分布宽度、乳腺癌分子标志物与乳腺癌病变程度的相关性研究[D];兰州大学;2016年

3 郝李刚;非小细胞肺癌预后分子标志物的研究[D];天津医科大学;2015年

4 毕芳芳;DEK蛋白在胰腺癌中的分子标志物作用研究[D];延边大学;2015年

5 谢子钧;唾液miRNA对食管癌预测诊断价值的探讨[D];南方医科大学;2013年

6 姜忠信;冠心病病人血栓前状态分子标志物的变化及临床意义[D];青岛大学;2002年

7 何庆娟;儿童过敏性紫癜止血分子标志物的研究[D];苏州大学;2002年

8 蒋焱熠;非小细胞肺癌分子标志物及其临床相关性研究[D];安徽师范大学;2011年

9 宋欣;细支气管肺泡癌和肺腺癌分子标志物的临床病理学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2008年

10 熊伟明;鼻咽癌特异性血清miRNA筛选与鉴定[D];桂林医学院;2013年

本文编号：2725871