南海冷泉微生物多样性分析及一株新菌的鉴定
发布时间:2020-12-12 00:25
深海占据了约三分之二的地球总面积,是全球最大的生态系统,含有丰富的生物资源,但由于深海研究起步晚、难度大,人们对这一生态系统及其中生物的了解还十分有限。冷泉系统由海底碳氢化合物渗漏形成,是深海贫瘠环境中的“绿洲”,在世界范围内广泛存在。大多数冷泉系统富含甲烷和硫化氢,其中参与硫循环和甲烷循环的硫氧化菌、硫酸盐还原菌和甲烷氧化古菌等微生物在该生态系统中发挥着极其重要的作用。本文针对2017年“科学号”科学考察船在南海台湾西南部冷泉区采集的水体和沉积物样品,利用非培养法和培养法对其中的微生物进行了分析。我们通过16S rDNA高通量测序技术对来源于南海冷泉渗漏区、非渗漏区以及非冷泉区的水体和沉积物样品进行了微生物群落结构分析。通过将冷泉区样品与其他样品中的微生物进行比较分析,我们发现冷泉区存在着独特的微生物群落结构:冷泉区样品中大量存在参与硫循环和甲烷循环的微生物,其含量远远高于非渗漏区和非冷泉区,且沉积物中微生物群落随深度变化表现出明显的分布特征。具体来说,冷泉渗漏区水体及表层0-8 cm沉积物样品中存在大量的硫氧化菌Sulfurovum,占总OTU(operational taxono...
【文章来源】:中国科学院大学(中国科学院海洋研究所)山东省
【文章页数】:94 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
采样位置
南海冷泉区各样品测序结果
辛普森指数 0.343 0.006** 0.181ACE 指数 0.265 0.266 0.032*Chao1 0.281 0.231 0.028*p 值为 0.05。**表示组间有极显著差异(p<0.01),*表示组间有显著差异(p<0.05)。CSP为非冷泉区沉积物样品,CSRP 为冷泉区沉积物样品,CSW 为水体样品。(2)物种多样性曲线描述各样品组内菌群多样性的曲线为稀释曲线(Rarefaction Curve)和等级聚类曲线(Rank Abundance Curve),二者既可说明各样本的物种丰富度,也可说明测序数据的合理性。各样品组的稀释曲线和等级聚类曲线(图 2.3)均随测序深度的增加逐渐趋向平坦,表明测序数据量渐进合理,测序深度足够,所有文库都有较好的说明性。
本文编号:2911501
【文章来源】:中国科学院大学(中国科学院海洋研究所)山东省
【文章页数】:94 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
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南海冷泉区各样品测序结果
辛普森指数 0.343 0.006** 0.181ACE 指数 0.265 0.266 0.032*Chao1 0.281 0.231 0.028*p 值为 0.05。**表示组间有极显著差异(p<0.01),*表示组间有显著差异(p<0.05)。CSP为非冷泉区沉积物样品,CSRP 为冷泉区沉积物样品,CSW 为水体样品。(2)物种多样性曲线描述各样品组内菌群多样性的曲线为稀释曲线(Rarefaction Curve)和等级聚类曲线(Rank Abundance Curve),二者既可说明各样本的物种丰富度,也可说明测序数据的合理性。各样品组的稀释曲线和等级聚类曲线(图 2.3)均随测序深度的增加逐渐趋向平坦,表明测序数据量渐进合理,测序深度足够,所有文库都有较好的说明性。
本文编号:2911501
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/2911501.html
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