海岛棉转录因子基因GbTCP27的克隆及表达特性分析

发布时间：2021-06-01 01:21

　　为探究转录因子GbTCP27在棉花纤维发育中的作用,使用RT-PCR技术从海岛棉‘新海21号’中克隆GbTCP27,并对其进行生物信息学和表达特性分析。结果表明,该基因有1个1 017 bp的开放阅读框,编码338个氨基酸,预测分子量约为35.37 ku,等电点为9.08,分子式为C₁₅₄₉H₂₅₁₁N₄₃₉O₄₈₃S₁₁,序列中含有一个高度保守的TCP结构域;氨基酸序列对比表明,海岛棉GbTCP27基因在进化过程中是相当保守的,蛋白序列与其他植物中的TCP蛋白序列有较高的一致性;亚细胞定位结果显示,GbTCP27属于核定位基因,推测GbTCP27可能在复制和转录的过程中发挥作用;进化树分析表明,海岛棉GbTCP27基因与亚洲棉GaTCP9基因分布在同一分支上;实时荧光定量PCR表明,GbTCP27基因在开花当天的花瓣和开花当天的胚珠中表达量最高;综上所述,GbTCP27转录因子可能参与棉花纤维起始期胚珠表皮细胞的发育。 

【文章来源】：中国农业大学学报. 2020,25(02)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

棉花GbTCP27基因PCR产物电泳分析

海岛棉GbTCP27与雷蒙德氏棉GrTCP9(XP_012489844.1)之间进行氨基酸序列比对,其相似性为98.22%。与亚洲棉GaTCP9(XP_017630785.1)氨基酸序列的相似性为100%,与陆地棉GhTCP9(XP_016695435.1)的相似性为97.63%,结果显示海岛棉中的GbTCP27基因与亚洲棉的GaTCP9的相似性最高,说明GbTCP27基因可能来源于亚洲棉基因组,进一步表明TCP基因从二倍体棉花进化成四倍体棉花时序列的保守性非常高。图3 GbTCP27蛋白磷酸化位点预测

GbTCP27蛋白磷酸化位点预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]棉花纤维品质改良相关基因研究进展[J]. 杨君,马峙英,王省芬.  中国农业科学. 2016(22)
[2]我国棉花生产现状与发展趋势[J]. 喻树迅.  中国工程科学. 2013(04)
[3]陆地棉干旱胁迫响应基因GhGR的克隆及特征分析[J]. 宋贵方,樊伟丽,王俊娟,王德龙,王帅,周凯,叶武威.  中国农业科学. 2012(08)



本文编号：3209373