人类TMEM121基因的生物信息学分析

发布时间：2021-07-18 10:49

　　目的:以人类心肌特异性表达基因TMEM121为研究部对象,对其编码蛋白的结构和功能进行预测。方法:利用生物信息学方法对TMEM121蛋白的同源度、二级结构、互作蛋白及功能等进行预测分析。结果:TMEM121蛋白在进化上高度保守,与猩猩、绿猴、家猫、大鼠及小鼠等的同源度高达96%以上,主要二级结构是α螺旋,无信号肽,定位于内质网的可能性比较大,具有转运及信号转导等功能。结论:人类TMEM121基因可能作为转运和信号转导因子与其他蛋白共同作用参与成体心脏功能的调控。 

【文章来源】：湖南师范大学学报(医学版). 2020,17(01)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

不同物种间TMEM121蛋白的同源度分析

通过SOPHMA程序[5,6]预测人TMEM121蛋白的二级结构（https：//npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa＿automat.pl?page=npsa＿sopma.html），发现由155个氨基酸残基构成的α螺旋结构占整个二级结构的48.59%(155/319），是TMEM12二级结构的主要构成原件；无规则卷曲占29.47%(94/319）；延伸链占17.8%(57/319）及β转角站4.08%(13/319）（图2-A,B）。以上数据说明TMEM121蛋白中大部分氨基酸残基处在一个基本有序的结构中，这有利于执行其应有的功能。应用COILS在线软件对人类TMEM121蛋白进行卷曲螺旋分析，结果显示该蛋白不存在任何卷曲（图2-C）。2.4 人TMEM121蛋白的三级结构预测分析

进一步应用模拉曼图方法（The Structure Analysis and Verification Server)(http：//services.mbi.ucla.edu/SAVES/）[8]分析该模型的空间结构的合理性，得到图3-C，结果显示预测模型中的大部分氨基酸残基均在拉曼图中的红色核心区内和黄色的合理区域内，说明该模型中的所有氨基酸均形成的二面角均合理可靠，表明该模型的空间结构基本合理。2.5 人TMEM121的相互作用蛋白分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]铁蛋白重链多肽对RAW264.7细胞中凋亡相关基因表达的影响[J]. 杜军伟,王远志,陈创夫,葛阳春.  石河子大学学报(自然科学版). 2010(05)
[2]慢性鼻-鼻窦炎患者嗅觉功能和嗅觉标记蛋白的研究[J]. 高海燕,诸小侬,彭诗东,张呼和,范尔钟,王鸿,韩德民.  中华耳鼻咽喉科杂志. 2004(08)



本文编号：3289425