花烟草NaERF1基因的克隆及在非生物胁迫下的表达模式分析

发布时间：2021-08-13 04:24

　　AP2/ERF类转录因子,是植物所特有的最大的一类转录因子家族,在植物的生长发育过程中,扮演着重要的角色。探究花烟草ERF转录因子的生理功能,为花烟草抵御逆境的分子机制研究提供借鉴。采用同源克隆的方法进行基因克隆。通过对花烟草进行非生物胁迫,运用qPCR的方法进行基因表达模式分析。从花烟草（Nicotiana alata）中克隆了一个属于ERF家族的基因NaERF1。该基因的开放阅读框全长为819 bp,编码了272个氨基酸。生物信息学分析结果表明,该基因编码的蛋白分子量为30.7 kD,等电点为6.07;具有AP2/ERF类转录因子家族典型的保守结构域;该基因主要定位于细胞质内,并含有多个磷酸化位点。同源性分析的结果显示,NaERF1基因与茄科植物的ERF同源性较高,并且与普通烟草的ERF亲缘关系最近。NaERF1基因的表达具有组织表达特异性,花中表达量最高,茎中次之,根和叶中表达量较低。同时,在高盐、干旱、低温、ABA、低钾及H2O2等非生物胁迫下,NaERF1的表达呈现5种模式。其中,对低钾及ABA胁迫的响应强烈。NaERF1基因属于AP2/ERF类转录因子,可能广泛参与了花烟草... 

【文章来源】：生物技术通报. 2020,36(01)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

NaERF1基因克隆

利用ExPaSy网站的ProtScale(http：//web.expasy.org/protscale/），选择Hphob./Kyte&Doolittle算法，对NaERF1蛋白的亲/疏水性进行了分析，结果如图2所示。NaERF1蛋白序列中第13位氨基酸最高分值为1.144，第266位氨基酸最低分为-2.322。总体上看，亲水性氨基酸均匀分布在整个肽链中，且平均分值大于疏水性氨基酸，可推测NaERF1蛋白属于亲水性蛋白。2.2.3 跨膜结构预测

采用ExPASy提供的TMHMM Server(http：//www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）软件，在线对NaERF的跨膜区进行预测，结果如图3所示。预测结果表明，NaERF1蛋白没有跨膜区，不属于跨膜蛋白。2.2.4 亚细胞定位

【参考文献】：
期刊论文
[1]植物AP2/ERF转录因子及其在非生物胁迫应答中的作用[J]. 高春艳,吴芮,袁玉,刘同玥,任莉萍.  江汉大学学报(自然科学版). 2017(03)
[2]烟草NtCBL1基因的克隆、表达载体构建及表达分析[J]. 张雪薇,刘仑,鲁黎明,李立芹.  植物研究. 2017(03)
[3]ERF转录因子研究进展[J]. 高浩,竺锡武.  现代农业科技. 2017(08)
[4]普通烟草ERF转录因子亚家族成员鉴定及表达模式分析[J]. 任昂彦,孔英珍.  中国烟草科学. 2017(01)
[5]玉米转录因子ZmERF1的克隆及表达分析[J]. 史庆玲,董永彬,周强,马智艳,乔大河,邓飞,李玉玲.  生物技术进展. 2017(01)
[6]烟草钾转运体基因TPK1的电子克隆及生物信息学分析[J]. 鲁黎明.  中国农业科学. 2011(01)
[7]ERF转录因子及其在植物防卫反应中的作用[J]. 黄泽军,黄荣峰,黄大昉.  植物病理学报. 2004(03)



本文编号：3339737