辣椒转录因子CaNAC23基因的克隆与表达分析

发布时间：2021-09-23 02:16

　　为分析NAC转录因子在辣椒发育及非生物胁迫中的功能,本研究以‘晋尖椒22’为试验材料,克隆获得CaNAC23基因全长,该基因全长1 899 bp,编码632个氨基酸,预测分子量约为72.54 kD,等电点为6.26,无序化区域有7个。二级结构预测和亚细胞定位预测表明CaNAC23含有一个保守的NAC结构域,定位于细胞核。氨基酸序列比对和进化树分析表明CaNAC23和拟南芥AT3G03200 （NAC045）同源性较高,进化上在同一分支。CaNAC23基因的组织表达特异性和非生物胁迫下的表达模式结果表明:CaNAC23在叶片中表达量最高,其次是根,暗示CaNAC23基因可能参与辣椒叶片或根发育相关。CaNAC23能够被干旱和盐胁迫诱导表达,推测其参与调控辣椒的非生物胁迫调控。本研究结果为研究NAC转录因子在辣椒发育及非生物胁迫应答中的功能提供了参考依据。 

【文章来源】：分子植物育种. 2020,18(12)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

CaNAC23 cDNA全长PCR扩增

CaNAC23基因cDNA测序全长序列及氨基酸序列

为了进一步了解该蛋白，对辣椒CaNAC23转录因子氨基酸序列进行了理化性质分析，以及蛋白的三级结构预测。氨基酸序列的无序化分析表明：CaNAC23转录因子整个氨基酸序列中无序化区域共有7个，最大无序化区域是从307位的甘氨酸至444位的丝氨酸共138个氨基酸残基，其次为46位到124位，174位～227位，560～589位，490～507位，135～148位，484～488位，总无序化氨基酸数目为338个，无序化占比53.48%(图4A)。对CaNAC23蛋白组成及亲水性进行分析，结果表明CaNAC23蛋白由20种氨基酸组成，其中含量最高的为丝氨酸(Ser)，含量为8.1%，含量最低的为半胱氨酸(Cys)，含量仅为1.7%。脂肪族系数(Aliphatic amino acid)为70.79；不稳定系数为43.05；亲水性平均系数为-0.611，表现为亲水性(图4B)。


本文编号：3404826