人类蛋白质组计划研究现状与趋势

发布时间：2021-10-27 07:56

　　在人类基因组草图完成之际,一批科学家迅速集结于国际人类蛋白质组组织（HUPO）旗下,启动"人类蛋白质组计划（HPP）"。近20年来,以鉴定和定量复杂体系中基因组编码全套蛋白质为核心的蛋白质组学技术获得了空前发展。在这篇文章中,我们将回顾HPP的发展历程和我国在蛋白质组学领域的最新进展,并简略讨论"蛋白质组学驱动的精准医学"的发展趋势和应用前景。 

【文章来源】：中国基础科学. 2020,22(04)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

HUPO的人类蛋白质组项目的结构示意图

基于染色体的C-HPP是HPP的一个组成部分。它的科学使命是绘制和注释由每个染色体编码的预测人类蛋白质组[7],它侧重于以无偏的方式采集数据,根据蛋白质编码基因在所有人类染色体中的位置进行分类和国际分工(如人类染色体1-22,X和Y及线粒体基因组,见图2)。这种方法的一个基本原理是基因定位可能影响表达,并与蛋白质组学、生物学和疾病的发生相关。C-HPP的一个重要目标是正确定义每个染色体上开放阅读框编码的典型蛋白的数量。当在高可信度蛋白质证据(PE)下鉴定时,这些蛋白质被称为PE1蛋白,那些蛋白在PE1水平上没有被明确鉴定,但有其他证据的蛋白质称为PE2-4“缺失蛋白质”(PE2,检测到基因的转录本,但没有足够的翻译证据;PE3,来自相关物种的证据表明该基因编码蛋白质;PE4,基因预测显示该基因编码蛋白质可能性较大,但没有其他证据归类为PE1-3)[8]。在过去的10年中,对预测的人类蛋白质组的翻译进行可靠的检测已经取得了巨大的进展(见图3)。到2020年,90%以上的PE1-4蛋白已经被检测到。然而,很明显,近年来进展缓慢,人们认识到,目前“缺失”的 1,899 个PE2-4蛋白的检测将越来越困难。

C-HPP的一个重要目标是正确定义每个染色体上开放阅读框编码的典型蛋白的数量。当在高可信度蛋白质证据(PE)下鉴定时,这些蛋白质被称为PE1蛋白,那些蛋白在PE1水平上没有被明确鉴定,但有其他证据的蛋白质称为PE2-4“缺失蛋白质”(PE2,检测到基因的转录本,但没有足够的翻译证据;PE3,来自相关物种的证据表明该基因编码蛋白质;PE4,基因预测显示该基因编码蛋白质可能性较大,但没有其他证据归类为PE1-3)[8]。在过去的10年中,对预测的人类蛋白质组的翻译进行可靠的检测已经取得了巨大的进展(见图3)。到2020年,90%以上的PE1-4蛋白已经被检测到。然而,很明显,近年来进展缓慢,人们认识到,目前“缺失”的 1,899 个PE2-4蛋白的检测将越来越困难。2.2 B/D-HPP


本文编号：3461188