濒危植物水青树雷公山居群的小尺度空间遗传结构研究
发布时间：2021-11-13 09:35
植物空间遗传结构（SGS）是探讨植物之间以及植物与环境之间相互作用规律的研究,对于评估濒危植物种群发展的潜力和进化方向具有重要的意义。小尺度范围SGS的形成最主要的影响因素是受限的基因流。本文以雷公山国家级自然保护区内水青树（Tetracentron sinense Oliv.）天然居群为研究对象,利用15对微卫星（SSR）引物对其进行小尺度SGS和基因流分析,评估雷公山水青树居群的进化发展潜力,探讨水青树的致濒机制,为居群进化方向的推断和保护策略的制定提供理论依据和数据支持。主要研究结果如下:（1）遗传多样性研究15对SSR引物扩增结果显示:雷公山水青树居群在物种水平和斑块水平上的等位基因数目（A）、有效等位基因数目（AE）、观测杂合度（HO）和期望杂合度（HE）（斑块水平为uHE）分别为4.067、2.769、0.483、0.598和3.667、2.498、0.487、0.564。结果表明,小尺度水青树居群的遗传多样性在濒危植物中居于中等水平。水青树四个斑块的遗传多样性水平有差异,产生了显著的遗...
【文章来源】：西华师范大学四川省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
居群和个体坐标图
第三章结果与分析14第三章结果与分析3.1nSSR引物分析用15对引物对雷公山水青树天然居群155个个体进行扩增，图3-1是SSR97引物对部分个体扩增的效果图。等位基因数（A）是反应遗传变异大小的指标。由表3-1可看出，本研究共检测到61个等位基因，每对引物等位基因数在2（SSR6、SSR62）~8（SSR97）之间，平均4.067；有效等位基因数（AE）在1.411（SSR69）~5.094（SSR97）之间，平均2.769。杂合度是指杂合子在被检测的群体位点中的占比，本研究总体观测杂合度（HO）为0.483，范围在0.200（SSR69）~0.743（SSR69）之间。在微卫星SSR标记中，期望杂合度（HE）是衡量遗传多样性主要的指标[89]，雷公山水青树物种水平总体期望杂合度0.598，范围在0.296（SSR69）~0.815（SSR97）之间，观测杂合度均小于期望杂合度，表明雷公山水青树居群存在近亲繁殖的现象。PIC值在0.324（SSR69）~0.784（SSR97）之间，总体为0.542，说明水青树具有较丰富的遗传变异。15对引物在155个个体中未出现零位点，适合本实验的数据分析。图3-1引物SSR97扩增的部分条带Fig.3-1ThepolyacrylamidegelelectrophoresisofsamplesamplifiedbySSR97
Table 3-3 AMOVA analysis of four patches 方差来源Source 自由度d.f. 变异百分比% Percentage of molecular variance 遗传分化系数 Fst 基因流Nm P 斑块间 Among patches 3 7.91% <0.001* 斑块内 Within patches 306 92.09% <0.001* 总和 Total 309 100% 0.079 2.91 <0.001* Among Patches Percentages of molecular variance
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于水青树叶表型性状的核心种质资源库构建策略[J]. 张欢,王东,段帆,李珊,甘小洪. 林业科学研究. 2019(02)
[2]广东省中山市五桂山土沉香空间遗传结构[J]. 刘盼盼,廖浩斌,蒋谦才,谭宗健,孙红梅,王瑞江,曹洪麟,黄向旭,赖思茹,梁丹,王峥峰. 热带亚热带植物学报. 2019(01)
[3]利用ISSR分子标记构建濒危植物水青树核心种质[J]. 段帆,张欢,李珊,田忠琼,甘小洪. 亚热带植物科学. 2018(02)
[4]雷公山地貌的发育控制因素及对自然地理环境影响研究[J]. 杨廷锋,吴显春,蒋焕洲. 宁夏农林科技. 2018(03)
[5]森林片断化对植物种群空间遗传结构的影响[J]. 徐刚标,郭小丹. 中南林业科技大学学报. 2017(10)
[6]喀斯特耐阴灌木淡黄金花茶的精细空间遗传结构与基因流[J]. 彭国清,唐绍清. 生态学报. 2017(21)
[7]植物种群小尺度空间遗传结构研究进展[J]. 王丹碧,赫佳,张云燕,施恩,耿其芳,王中生. 江苏农业科学. 2017(10)
[8]濒危植物水青树叶的表型性状变异[J]. 李珊,甘小洪,憨宏艳,许宁,侯正扬,陈杨,邓晓娟. 林业科学研究. 2016(05)
[9]Fine-scale spatial genetic structure in predominantly selfing plants with limited seed dispersal:a rule or exception?[J]. Sergei Volis,Danara Ormanbekova,Irina Shulgina. Plant Diversity. 2016(02)
[10]光照及地面覆盖物对水青树种子萌发和幼苗初期生长的影响[J]. 许宁,憨宏艳,甘小洪. 植物资源与环境学报. 2015(03)
博士论文
[1]鹅掌楸群体空间遗传结构研究[D]. 李博.南京林业大学 2013
硕士论文
[1]地果种群遗传格局及其成因研究[D]. 付荣华.西华师范大学 2018
[2]濒危植物水青树的遗传多样性研究[D]. 李珊.西华师范大学 2017
[3]国产沉香属植物遗传结构研究[D]. 刘涛.南昌大学 2016
[4]特有濒危植物琅琊榆、醉翁榆种群动态及小尺度空间遗传结构研究[D]. 赫佳.南京大学 2016
[5]淡黄金花茶精细空间遗传结构[D]. 彭国清.广西师范大学 2016
[6]濒危植物水青树幼苗更新机制研究[D]. 许宁.西华师范大学 2016
[7]银杏天目山“避难所”群体的小尺度遗传结构与基因流研究[D]. 谢春香.浙江大学 2014
[8]雷公山自然保护区的保护与苗族文化的传承研究[D]. 张国洋.贵州师范大学 2008
[9]不同地方乌骨鸡种群遗传多样性的微卫星分析[D]. 李亮.四川农业大学 2001
本文编号：3492785
【文章来源】：西华师范大学四川省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
居群和个体坐标图
第三章结果与分析14第三章结果与分析3.1nSSR引物分析用15对引物对雷公山水青树天然居群155个个体进行扩增，图3-1是SSR97引物对部分个体扩增的效果图。等位基因数（A）是反应遗传变异大小的指标。由表3-1可看出，本研究共检测到61个等位基因，每对引物等位基因数在2（SSR6、SSR62）~8（SSR97）之间，平均4.067；有效等位基因数（AE）在1.411（SSR69）~5.094（SSR97）之间，平均2.769。杂合度是指杂合子在被检测的群体位点中的占比，本研究总体观测杂合度（HO）为0.483，范围在0.200（SSR69）~0.743（SSR69）之间。在微卫星SSR标记中，期望杂合度（HE）是衡量遗传多样性主要的指标[89]，雷公山水青树物种水平总体期望杂合度0.598，范围在0.296（SSR69）~0.815（SSR97）之间，观测杂合度均小于期望杂合度，表明雷公山水青树居群存在近亲繁殖的现象。PIC值在0.324（SSR69）~0.784（SSR97）之间，总体为0.542，说明水青树具有较丰富的遗传变异。15对引物在155个个体中未出现零位点，适合本实验的数据分析。图3-1引物SSR97扩增的部分条带Fig.3-1ThepolyacrylamidegelelectrophoresisofsamplesamplifiedbySSR97
Table 3-3 AMOVA analysis of four patches 方差来源Source 自由度d.f. 变异百分比% Percentage of molecular variance 遗传分化系数 Fst 基因流Nm P 斑块间 Among patches 3 7.91% <0.001* 斑块内 Within patches 306 92.09% <0.001* 总和 Total 309 100% 0.079 2.91 <0.001* Among Patches Percentages of molecular variance
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于水青树叶表型性状的核心种质资源库构建策略[J]. 张欢,王东,段帆,李珊,甘小洪. 林业科学研究. 2019(02)
[2]广东省中山市五桂山土沉香空间遗传结构[J]. 刘盼盼,廖浩斌,蒋谦才,谭宗健,孙红梅,王瑞江,曹洪麟,黄向旭,赖思茹,梁丹,王峥峰. 热带亚热带植物学报. 2019(01)
[3]利用ISSR分子标记构建濒危植物水青树核心种质[J]. 段帆,张欢,李珊,田忠琼,甘小洪. 亚热带植物科学. 2018(02)
[4]雷公山地貌的发育控制因素及对自然地理环境影响研究[J]. 杨廷锋,吴显春,蒋焕洲. 宁夏农林科技. 2018(03)
[5]森林片断化对植物种群空间遗传结构的影响[J]. 徐刚标,郭小丹. 中南林业科技大学学报. 2017(10)
[6]喀斯特耐阴灌木淡黄金花茶的精细空间遗传结构与基因流[J]. 彭国清,唐绍清. 生态学报. 2017(21)
[7]植物种群小尺度空间遗传结构研究进展[J]. 王丹碧,赫佳,张云燕,施恩,耿其芳,王中生. 江苏农业科学. 2017(10)
[8]濒危植物水青树叶的表型性状变异[J]. 李珊,甘小洪,憨宏艳,许宁,侯正扬,陈杨,邓晓娟. 林业科学研究. 2016(05)
[9]Fine-scale spatial genetic structure in predominantly selfing plants with limited seed dispersal:a rule or exception?[J]. Sergei Volis,Danara Ormanbekova,Irina Shulgina. Plant Diversity. 2016(02)
[10]光照及地面覆盖物对水青树种子萌发和幼苗初期生长的影响[J]. 许宁,憨宏艳,甘小洪. 植物资源与环境学报. 2015(03)
博士论文
[1]鹅掌楸群体空间遗传结构研究[D]. 李博.南京林业大学 2013
硕士论文
[1]地果种群遗传格局及其成因研究[D]. 付荣华.西华师范大学 2018
[2]濒危植物水青树的遗传多样性研究[D]. 李珊.西华师范大学 2017
[3]国产沉香属植物遗传结构研究[D]. 刘涛.南昌大学 2016
[4]特有濒危植物琅琊榆、醉翁榆种群动态及小尺度空间遗传结构研究[D]. 赫佳.南京大学 2016
[5]淡黄金花茶精细空间遗传结构[D]. 彭国清.广西师范大学 2016
[6]濒危植物水青树幼苗更新机制研究[D]. 许宁.西华师范大学 2016
[7]银杏天目山“避难所”群体的小尺度遗传结构与基因流研究[D]. 谢春香.浙江大学 2014
[8]雷公山自然保护区的保护与苗族文化的传承研究[D]. 张国洋.贵州师范大学 2008
[9]不同地方乌骨鸡种群遗传多样性的微卫星分析[D]. 李亮.四川农业大学 2001
本文编号：3492785
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3492785.html
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