模拟高海拔低氧对青海田鼠脑组织蛋白磷酸化的影响
发布时间：2021-11-24 23:30
生物对氧的感受与调控过程非常复杂,应答机制主要涉及基因组、转录组与蛋白质组等,其中蛋白质组及其翻译后修饰组是研究此类问题的重要手段。生物对高海拔低氧适应机制是研究热点,目前缺乏蛋白质组及磷酸化蛋白质组在生物应对低氧环境中作用机制的研究。青海田鼠（Neodon fuscus）世居于青藏高原高寒草甸地区,布氏田鼠（Lasiopodomys brandtii）则分布于内蒙古草原,两种田鼠分类地位较近,栖息地类型相似,是高海拔低氧相关研究的良好物种。本论文以青海田鼠为研究对象,布氏田鼠为对照,经个性化与肥满度筛选后,分别将20只个体在实验室低氧舱内模拟100m、3000m、5000m和7000m海拔的氧环境,经24小时处理后取脑组织,采用高通量质谱鉴定技术获取两种田鼠的蛋白质组和磷酸化蛋白质组定量数据;通过差异蛋白鉴定方法,确定差异蛋白表达趋势,采用GO与KEGG富集、蛋白结构域预测等方法,对特定表达趋势类型的差异蛋白进行分析;使用GPS 2.1算法,结合蛋白质相互作用数据,预测两种田鼠的位点特异性激酶与底物的相互关系,并构建相应的激酶-位点磷酸化调控网络,分析该网络调控低氧适应的分子机制。旨...
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：95 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
旷场-镜像实验装置示意图[79]
2蛋白质组及磷酸化蛋白质组的质谱鉴定12基于青海田鼠和布氏田鼠磷酸化蛋白质组数据，分别筛选出可定量的且位点修饰概率大于0.75的磷酸化位点，及其相应蛋白和肽段作为后续磷酸化组学分析的数据集。2.3结果与分析2.3.1个性化得分和肥满度分别对27只青海田鼠和布氏田鼠的个性化得分进行正态分布检验，结果表明青海田鼠（Kolmogorov-SmirnovZ=0.143，df=27，P=0.163）和布氏田鼠（Kolmogorov-SmirnovZ=0.138，P=0.200）的个性化得分均表现为正态分布（图2.2）。青海田鼠个性化得分均值为8.14±0.67，95%置信区间为6.75-9.52，中值8.48，方差12.26，标准差3.50，范围是12.84（1.47-14.31），四分位距6.08，偏度-0.30±0.45，峰度-0.81±0.87（图2.2A）。布氏田鼠个性化得分均值为15.35±0.64，95%置信区间为14.01-16.67，中值16.00，方差11.19，标准差3.34，范围是11.06（8.94-20.00），四分位距6.40，偏度-0.18±0.45，峰度-1.09±0.87（图2.2B）。图2.2青海田鼠（A）和布氏田鼠（B）个性化得分直方图Figure2.2ThehistogramofpersonalizedscoreinN.fuscus(A)andL.brandtii(B)
青海田鼠（Kolmogorov-Smirnov Z=0.179，df=27，P=0.027）和布氏田鼠（Kolmogorov-Smirnov Z=0.240，df=27，P<0.001）肥满度均不符合正态分布。青海田鼠肥满度均值为 4.92±0.16，95%置信区间为 4.60-5.24，中值 4.70，方差0.67，标准差 0.82，范围是 2.73（3.85-6.58），四分位距 1.30，偏度 0.49±0.45，峰度-1.08±0.87（图 2.3A）。布氏田鼠肥满度均值为 4.95±0.11，95%置信区间为4.72-5.17，中值 5.00，方差 0.33，标准差 0.57，范围是 2.00（4.00-6.00），四分位距 0.30，偏度 0.15±0.45，峰度-0.08±0.87（图 2.3B）。 Mann-Whitney U 检验发现青海田鼠和布氏田鼠肥满度之间不存在显著性差异（P=0.4924，U=324.5）。两种田鼠均选择肥满度 4-6.5 区间，对后续低氧实验造成干扰可能会较小。
【参考文献】：
期刊论文
[1]青藏高原东部地区田鼠物种的分子鉴定[J]. 赵贤贤,李邦,林恭华,马万军,巨海兰,苏建平,张同作. 兽类学报. 2017(01)
[2]中国哺乳动物多样性[J]. 蒋志刚,马勇,吴毅,王应祥,冯祚建,周开亚,刘少英,罗振华,李春旺. 生物多样性. 2015(03)
[3]布氏田鼠种群遗传结构的研究[J]. 葛永斌,魏磊. 滁州学院学报. 2014(02)
[4]布氏田鼠和青海田鼠自然种群鼠疫抗性差异[J]. 魏磊,王承民,胡奕,罗静,张敏,何宏轩. 四川动物. 2013(02)
[5]模拟低氧环境中弥散富氧对大鼠行为学指标的影响[J]. 石永杰,申广浩,谢康宁,孙涛,刘娟,罗二平. 中国医学物理学杂志. 2013(01)
[6]布氏田鼠栖息地特征的研究[J]. 蒋永恩,Enkhbold.Nanj,Nyamdorj.Batsaikhan,王登,易津,乌仁其木格,单丽燕,杜桂林,施大钊. 草地学报. 2012(01)
[7]高原鼢鼠和高原鼠兔心脏对低氧环境的适应[J]. 齐新章,王晓君,朱世海,饶鑫峰,魏莲,魏登邦. 生理学报. 2008(03)
[8]青海田鼠活动规律的调查[J]. 李富忠,汪立茂,李光清,吴国康,魏柏青,陈洪舰,刘振才. 现代预防医学. 2001(04)
[9]布氏田鼠肥满度分析和小型兽类肥满度指标K与KWL（重长指标）的比较[J]. 房继明,孙儒泳,刘志龙. 动物学报. 1995(02)
博士论文
[1]棕色田鼠和布氏田鼠昼夜节律调节机制比较研究[D]. 孙红.郑州大学 2019
[2]基于磷酸化蛋白质组的激酶—底物磷酸化网络模拟与分析[D]. 王勇博.华中科技大学 2017
[3]基于比较转录组的棕色田鼠与布氏田鼠低氧适应研究[D]. 李扬威.郑州大学 2017
[4]植物磷酸化蛋白质组的生物信息学分析[D]. 程涵.华中科技大学 2015
硕士论文
[1]布氏田鼠婚配制度初探[D]. 牟媛媛.曲阜师范大学 2019
[2]个性化对棕色田鼠雌性配偶选择和子代的影响[D]. 虞静.郑州大学 2016
本文编号：3516960
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：95 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
旷场-镜像实验装置示意图[79]
2蛋白质组及磷酸化蛋白质组的质谱鉴定12基于青海田鼠和布氏田鼠磷酸化蛋白质组数据，分别筛选出可定量的且位点修饰概率大于0.75的磷酸化位点，及其相应蛋白和肽段作为后续磷酸化组学分析的数据集。2.3结果与分析2.3.1个性化得分和肥满度分别对27只青海田鼠和布氏田鼠的个性化得分进行正态分布检验，结果表明青海田鼠（Kolmogorov-SmirnovZ=0.143，df=27，P=0.163）和布氏田鼠（Kolmogorov-SmirnovZ=0.138，P=0.200）的个性化得分均表现为正态分布（图2.2）。青海田鼠个性化得分均值为8.14±0.67，95%置信区间为6.75-9.52，中值8.48，方差12.26，标准差3.50，范围是12.84（1.47-14.31），四分位距6.08，偏度-0.30±0.45，峰度-0.81±0.87（图2.2A）。布氏田鼠个性化得分均值为15.35±0.64，95%置信区间为14.01-16.67，中值16.00，方差11.19，标准差3.34，范围是11.06（8.94-20.00），四分位距6.40，偏度-0.18±0.45，峰度-1.09±0.87（图2.2B）。图2.2青海田鼠（A）和布氏田鼠（B）个性化得分直方图Figure2.2ThehistogramofpersonalizedscoreinN.fuscus(A)andL.brandtii(B)
青海田鼠（Kolmogorov-Smirnov Z=0.179，df=27，P=0.027）和布氏田鼠（Kolmogorov-Smirnov Z=0.240，df=27，P<0.001）肥满度均不符合正态分布。青海田鼠肥满度均值为 4.92±0.16，95%置信区间为 4.60-5.24，中值 4.70，方差0.67，标准差 0.82，范围是 2.73（3.85-6.58），四分位距 1.30，偏度 0.49±0.45，峰度-1.08±0.87（图 2.3A）。布氏田鼠肥满度均值为 4.95±0.11，95%置信区间为4.72-5.17，中值 5.00，方差 0.33，标准差 0.57，范围是 2.00（4.00-6.00），四分位距 0.30，偏度 0.15±0.45，峰度-0.08±0.87（图 2.3B）。 Mann-Whitney U 检验发现青海田鼠和布氏田鼠肥满度之间不存在显著性差异（P=0.4924，U=324.5）。两种田鼠均选择肥满度 4-6.5 区间，对后续低氧实验造成干扰可能会较小。
【参考文献】：
期刊论文
[1]青藏高原东部地区田鼠物种的分子鉴定[J]. 赵贤贤,李邦,林恭华,马万军,巨海兰,苏建平,张同作. 兽类学报. 2017(01)
[2]中国哺乳动物多样性[J]. 蒋志刚,马勇,吴毅,王应祥,冯祚建,周开亚,刘少英,罗振华,李春旺. 生物多样性. 2015(03)
[3]布氏田鼠种群遗传结构的研究[J]. 葛永斌,魏磊. 滁州学院学报. 2014(02)
[4]布氏田鼠和青海田鼠自然种群鼠疫抗性差异[J]. 魏磊,王承民,胡奕,罗静,张敏,何宏轩. 四川动物. 2013(02)
[5]模拟低氧环境中弥散富氧对大鼠行为学指标的影响[J]. 石永杰,申广浩,谢康宁,孙涛,刘娟,罗二平. 中国医学物理学杂志. 2013(01)
[6]布氏田鼠栖息地特征的研究[J]. 蒋永恩,Enkhbold.Nanj,Nyamdorj.Batsaikhan,王登,易津,乌仁其木格,单丽燕,杜桂林,施大钊. 草地学报. 2012(01)
[7]高原鼢鼠和高原鼠兔心脏对低氧环境的适应[J]. 齐新章,王晓君,朱世海,饶鑫峰,魏莲,魏登邦. 生理学报. 2008(03)
[8]青海田鼠活动规律的调查[J]. 李富忠,汪立茂,李光清,吴国康,魏柏青,陈洪舰,刘振才. 现代预防医学. 2001(04)
[9]布氏田鼠肥满度分析和小型兽类肥满度指标K与KWL（重长指标）的比较[J]. 房继明,孙儒泳,刘志龙. 动物学报. 1995(02)
博士论文
[1]棕色田鼠和布氏田鼠昼夜节律调节机制比较研究[D]. 孙红.郑州大学 2019
[2]基于磷酸化蛋白质组的激酶—底物磷酸化网络模拟与分析[D]. 王勇博.华中科技大学 2017
[3]基于比较转录组的棕色田鼠与布氏田鼠低氧适应研究[D]. 李扬威.郑州大学 2017
[4]植物磷酸化蛋白质组的生物信息学分析[D]. 程涵.华中科技大学 2015
硕士论文
[1]布氏田鼠婚配制度初探[D]. 牟媛媛.曲阜师范大学 2019
[2]个性化对棕色田鼠雌性配偶选择和子代的影响[D]. 虞静.郑州大学 2016
本文编号：3516960
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3516960.html
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