沃尔巴克菌对孔弄蝶属线粒体DNA遗传多样性影响的研究
发布时间:2021-12-28 04:14
昆虫中广泛存在一类和线粒体DNA(mt DNA)具有相同遗传方式的细胞内共生细菌沃尔巴克菌Wolbachia,其母系遗传的传播方式会影响寄主线粒体DNA的遗传多样性,这导致线粒体DNA难以正确反映被感染寄主的种群遗传结构和物种分类等信息。在蝶类沃尔巴克菌的研究中,尚未有以“属”作为分析单位进行的系统研究,无法对沃尔巴克菌与蝶类寄主线粒体DNA的互作关系及由此引起的分析误差做出系统的评价。本研究采用孔弄蝶属共17个种的204个样本,首先检测了沃尔巴克菌感染情况,结合地理分布对环境气候与沃尔巴克菌感染率进行了关联分析。并通过孔弄蝶属线粒体基因单倍型网络图的绘制,以及针对线粒体基因、核基因及沃尔巴克菌的多位点序列分型片段进行了多个系统发育树的构建,对沃尔巴克菌不同株系与宿主遗传基因的多样性进行了讨论。本研究在“属”这一分类单元下,根据上述分析方法目前得出以下结论:1)共发现6个种感染了沃尔巴克菌,34%(70/204只)的孔弄蝶属样本测得沃尔巴克菌阳性结果,采用wsp标记检测出三个沃尔巴克菌的菌株,分别为w Nas1,w Nas2和w Nas3。进一步通过多位点序列分型(MLST)将其还能分...
【文章来源】:上海师范大学上海市
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
样本采集情况
样本中沃尔巴克菌感染分布情况
第3章结果与分析上海师范大学硕士学位论文26图3-2由孔弄蝶属与其他物种中沃尔巴克菌ST序列共同构建的ML系统发育树Fig3-2.Maximum-likelihoodphylogenetictreeofWolbachiaSTsequencesfromPolytremisandotherspecies3.2孔弄蝶属线粒体DNA和核基因的分析3.2.1线粒体基因序列的分析将扩增的所有孔弄蝶属样本的线粒体DNA(包括COI、COII及ND5基因)和秈弄蝶外群的线粒体串联序列(包括COI、COII及ND5,大小为1840bp)的测序结果进行比较,发现在666个核苷酸位点存在多态性,其中包括617个简约信息位点。并有保守位点1174个。该序列集的平均碱基组成含量为腺嘌呤(A)33.3%、胸腺嘧啶(T)42.2%,鸟嘌呤(G)11.6%和胞嘧啶(C)12.9%,A+T的含量为75.5%,C+G的含量为24.5%,显示出在昆虫线粒体基因组中常见的A
【参考文献】:
期刊论文
[1]果蝇细胞内共生菌Wolbachia研究进展[J]. 张广,陈雨,王蓓蕾. 中国实验动物学报. 2018(02)
[2]共生菌Wolbachia感染对果蝇适合度的影响[J]. 齐琳,云月利,李长春,陈建,张增焘,彭宇. 湖北大学学报(自然科学版). 2017(02)
[3]系统生物学家最终能得到完全一致的生命之树吗?[J]. 鲁丽敏,陈之端,路安民. 科学通报. 2016(09)
[4]人和动物丝虫共生菌——沃尔巴克氏体研究进展[J]. 刘梅,杨光友. 动物医学进展. 2015(04)
[5]常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰[J]. 张丽娜,荣昌鹤,何远,关琼,何彬,朱兴文,刘佳妮,陈红菊. 动物学研究. 2013(06)
[6]蚊虫Wolbachia野外试验的研究进展[J]. 张东京,梁格豪,郑展图,刘秀婷,何石萍,叶慧珍,李卓雅,詹希美,郑小英. 中国人兽共患病学报. 2013(02)
[7]Wolbachia与昆虫寄主关系研究进展[J]. 王哲,乔格侠. 应用昆虫学报. 2011(06)
[8]稻纵卷叶螟感染Wolbachia的ftsZ基因和16S rDNA基因的序列分析[J]. 柴换娜,杜予州,吴海燕. 昆虫学报. 2011(04)
[9]分子系统发育分析的生物信息学方法[J]. 张树波,赖剑煌. 计算机科学. 2010(08)
[10]谱系年代研究进展[J]. 杨群,丛培允,孙晓燕,马俊业,盖永华,李春香,郝家胜,夏旭华. 古生物学报. 2009(03)
硕士论文
[1]孔弄蝶属(Polytremis)的分子系统学研究[D]. 宋超.上海师范大学 2013
[2]中国刺胫弄蝶族分类研究(鳞翅目:弄蝶科:弄蝶亚科)[D]. 朱建青.上海师范大学 2012
本文编号:3553380
【文章来源】:上海师范大学上海市
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
样本采集情况
样本中沃尔巴克菌感染分布情况
第3章结果与分析上海师范大学硕士学位论文26图3-2由孔弄蝶属与其他物种中沃尔巴克菌ST序列共同构建的ML系统发育树Fig3-2.Maximum-likelihoodphylogenetictreeofWolbachiaSTsequencesfromPolytremisandotherspecies3.2孔弄蝶属线粒体DNA和核基因的分析3.2.1线粒体基因序列的分析将扩增的所有孔弄蝶属样本的线粒体DNA(包括COI、COII及ND5基因)和秈弄蝶外群的线粒体串联序列(包括COI、COII及ND5,大小为1840bp)的测序结果进行比较,发现在666个核苷酸位点存在多态性,其中包括617个简约信息位点。并有保守位点1174个。该序列集的平均碱基组成含量为腺嘌呤(A)33.3%、胸腺嘧啶(T)42.2%,鸟嘌呤(G)11.6%和胞嘧啶(C)12.9%,A+T的含量为75.5%,C+G的含量为24.5%,显示出在昆虫线粒体基因组中常见的A
【参考文献】:
期刊论文
[1]果蝇细胞内共生菌Wolbachia研究进展[J]. 张广,陈雨,王蓓蕾. 中国实验动物学报. 2018(02)
[2]共生菌Wolbachia感染对果蝇适合度的影响[J]. 齐琳,云月利,李长春,陈建,张增焘,彭宇. 湖北大学学报(自然科学版). 2017(02)
[3]系统生物学家最终能得到完全一致的生命之树吗?[J]. 鲁丽敏,陈之端,路安民. 科学通报. 2016(09)
[4]人和动物丝虫共生菌——沃尔巴克氏体研究进展[J]. 刘梅,杨光友. 动物医学进展. 2015(04)
[5]常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰[J]. 张丽娜,荣昌鹤,何远,关琼,何彬,朱兴文,刘佳妮,陈红菊. 动物学研究. 2013(06)
[6]蚊虫Wolbachia野外试验的研究进展[J]. 张东京,梁格豪,郑展图,刘秀婷,何石萍,叶慧珍,李卓雅,詹希美,郑小英. 中国人兽共患病学报. 2013(02)
[7]Wolbachia与昆虫寄主关系研究进展[J]. 王哲,乔格侠. 应用昆虫学报. 2011(06)
[8]稻纵卷叶螟感染Wolbachia的ftsZ基因和16S rDNA基因的序列分析[J]. 柴换娜,杜予州,吴海燕. 昆虫学报. 2011(04)
[9]分子系统发育分析的生物信息学方法[J]. 张树波,赖剑煌. 计算机科学. 2010(08)
[10]谱系年代研究进展[J]. 杨群,丛培允,孙晓燕,马俊业,盖永华,李春香,郝家胜,夏旭华. 古生物学报. 2009(03)
硕士论文
[1]孔弄蝶属(Polytremis)的分子系统学研究[D]. 宋超.上海师范大学 2013
[2]中国刺胫弄蝶族分类研究(鳞翅目:弄蝶科:弄蝶亚科)[D]. 朱建青.上海师范大学 2012
本文编号:3553380
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3553380.html
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