黄曲霉转录因子AfMcrA的克隆及功能预测
发布时间：2021-12-31 15:36
为初步探究黄曲霉McrA的生物学功能,采用反转录聚合酶链式反应（reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR）克隆黄曲霉转录因子Af McrA基因,并对其编码蛋白的理化性质、保守结构域、亚细胞定位、二级结构等进行预测。实时荧光定量聚合酶链式反应（quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,qRT-PCR）对不同培养时间Af McrA的表达情况进行分析。结果表明,Af McrA基因全长1 448 bp,由3个内含子和4个外显子组成。c DNA为1 101 bp,编码366个氨基酸。生物信息学预测,Af McrA是一个分子质量为39.82 k Da,理论等电点为8.97,不稳定的亲水蛋白,且不含信号肽和跨膜结构域; Af McrA具有一个高度保守的Zn（Ⅱ）2Cys6锌指结构域,属于C6转录转因子; Predict NLS预测Af McrA亚细胞定位于细胞核中; Af McrA二级结构主要由无规则卷曲组成,延伸链、α-螺旋和β-转角含量较低。qRT-...
【文章来源】：食品与发酵工业. 2020,46(20)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
黄曲霉RNA和Af McrA的c DNA序列扩增
以黄曲霉g DNA为模板，Mcr AF和Mcr AR为特异引物，PCR扩增出1条1 200～2 000 bp的条带(图2)。克隆测序获得Af Mcr A的g DNA序列为1 448 bp。采用DNA-MAN软件对Af Mcr A的c DNA和g DNA序列进行比对，发现Af Mcr A由3个内含子和4个外显子组成，且内含子的剪切位点均符合真核生物的5"-GT和3"-AG原则(图3)。2.3 Af McrA编码蛋白的生物信息学分析
Af Mcr A共编码366个氨基酸(图3)。生物信息学预测，Af McrA是1个分子质量为39.82 kDa，理论等电点为8.97，不稳定的亲水蛋白质，且不含信号肽和跨膜结构域。SMART预测，Af McrA包含1个GAL4锌指蛋白结构域(氨基酸残基位点117～165)，且氨基酸序列Cys-X2-Cys-X6-Cys-X10-Cys-X2-Cys-X6-Cys(图3)符合Zn(Ⅱ)2Cys6型转录因子典型的保守基因序列特征，其中6个半胱氨酸残基共结合2个Zn2+。
本文编号：3560515
【文章来源】：食品与发酵工业. 2020,46(20)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
黄曲霉RNA和Af McrA的c DNA序列扩增
以黄曲霉g DNA为模板，Mcr AF和Mcr AR为特异引物，PCR扩增出1条1 200～2 000 bp的条带(图2)。克隆测序获得Af Mcr A的g DNA序列为1 448 bp。采用DNA-MAN软件对Af Mcr A的c DNA和g DNA序列进行比对，发现Af Mcr A由3个内含子和4个外显子组成，且内含子的剪切位点均符合真核生物的5"-GT和3"-AG原则(图3)。2.3 Af McrA编码蛋白的生物信息学分析
Af Mcr A共编码366个氨基酸(图3)。生物信息学预测，Af McrA是1个分子质量为39.82 kDa，理论等电点为8.97，不稳定的亲水蛋白质，且不含信号肽和跨膜结构域。SMART预测，Af McrA包含1个GAL4锌指蛋白结构域(氨基酸残基位点117～165)，且氨基酸序列Cys-X2-Cys-X6-Cys-X10-Cys-X2-Cys-X6-Cys(图3)符合Zn(Ⅱ)2Cys6型转录因子典型的保守基因序列特征，其中6个半胱氨酸残基共结合2个Zn2+。
本文编号：3560515
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3560515.html
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