基因组学技术在病毒鉴定与宿主溯源中的应用

发布时间：2022-02-24 06:48

　　基因组学技术,特别是宏基因组测序在未知病毒的鉴定与溯源中起到了重要作用。相较于传统的病毒分离培养方法,宏基因组技术可以从混合样本中获得病毒的核酸序列,极大加速了未知病毒的鉴定与溯源,在针对高流行性、高致病性的病毒研究中发挥了重要作用。基于宏基因组技术对未知病毒进行鉴定和溯源,其准确性很大程度上依赖于取样及已知宿主的病毒库的完整性。然而,当前病毒多样性的基础研究相对薄弱,病毒的宿主信息则更加匮乏。野生动物和畜禽是人畜共患病致病病毒的重要中间宿主,构建广泛的动物–病毒关联数据库对于准确、快速地鉴定和预防致病性病毒具有重要意义。本综述以SARS-CoV-2为例,总结了基因组学技术在病毒的鉴定与溯源上的应用,并针对当前动物病毒库完整性低的现状,对构建野生和家养动物携带病毒的关联数据库的可行性提出依据与建议。 

【文章来源】：生物多样性. 2020,28(05)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 基于宏基因组方法鉴定病毒种类
2 构建基因组系统发育关系,分析病毒进化历史并推测其宿主来源
3 利用基因组学方法构建完善的病毒基因数据库及“宿主–病毒”关联信息库
4 问题与展望


【参考文献】：
期刊论文
[1]On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2[J]. Xiaolu Tang,Changcheng Wu,Xiang Li,Yuhe Song,Xinmin Yao,Xinkai Wu,Yuange Duan,Hong Zhang,Yirong Wang,Zhaohui Qian,Jie Cui,Jian Lu.  National Science Review. 2020(06)
[2]Decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus（SARS-CoV-2/HCoV-19）using whole genomic data[J]. Wen-Bin Yu,Guang-Da Tang,Li Zhang,Richard T.Corlett.  Zoological Research. 2020(03)



本文编号：3642192