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优雅蝈螽肠道微生物多样性研究

发布时间:2024-07-02 19:46
  昆虫肠道共生大量微生物,其丰富度因种类不同有较大差异。大多数昆虫的微生物定殖尚未了解,其菌群组成还有很大研究空间。优雅蝈蟲(Gampsocleis gratiosa)隶属于直翅目(Orthoptera)蟲斯科(Tettigoniidae),是研究直翅目昆虫生长发育的良好模式生物,其研究对不完全变态、也非社会性的昆虫有代表意义。主要结果如下:1、本课题基于16S rDNA V3-V4区450 bp高变序列,通过Illumina MiseqTM高通量测序,分别对优雅蝈螽两性1-7龄若虫、以及成体4个阶段,在活体状态持续收集粪便,对肠道微生物组成进行研究,每组3个生物学重复,共66个粪便样品。单个样品测序20.79-24.82万条序列,共计获得20.96 Gb原始数据。2、去除Barcode、引物和接头序列,根据Overlap关系,把成对序列拼接成一条序列。然后按照测序前的Barcode标签,分离出需要的各样本数据。并对分离得到的数据质控过滤,以去除嵌合体和非特异性扩增序列,获得最终数据。按照97%的相似性阈值,共获得576684个OTU。3、门、纲、目、科级水平,优势菌均比较单一,其他菌群...

【文章页数】:122 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图2-1?DNA电泳图??Fig.2-1?The?electrophoresis?of?DNA??

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图2-1?DNA电泳图??Fig.2-1?The?electrophoresis?of?DNA??表2-4点样顺序及浓度??Table?2-4?The?spot?order?and?concentration??Sample—ID?MN1-A?MN2-A?MN3-A?MN4-A?....


图2-2?16S?rDNA?V3-V4?PCR产物电泳图??Fig.2-2?The?PCR?electrophoresis?products?of?16S?rDNA?V3-V4??

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图2-3质控后优雅蝈螽雄性序列长度分布图??Fig.2-3?Length?distribution?of?reads?after?QC?(male?

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图2-4质控后优雅蝈螽雌性序列长度分布图??Fig.2-4?Length?distribution?of?reads?after?QC?(female?Gampsocleis?gratiosa)??各样本的编号、分组情况、Barcode序列、原始序列数目,以及?

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本文编号:3999918

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