基于粪便DNA技术的鸟类物种鉴定体系研究

发布时间：2022-10-10 15:38

　　利用粪便DNA技术对候鸟进行物种鉴定,对了解鸟类在繁殖地和越冬地的种类分布、研究其迁徙路线等具有重要意义。本研究扩增、测定了76份雁形目鸟类粪便的Dloop区序列,将其与NCBI数据库中已知鸟类同源序列进行比对分析（BLAST比对法）。结果表明:相似度为98. 07%—100%,其中75%的单倍型可以被认定为单一物种,25%的单倍型检测为非单一物种,即包含2个近缘物种。比较基于Ts、Ts+Tv碱基替换计算的K2P遗传距离,说明后者更适合于D-loop区序列特征。而且,以此为基础的遗传距离法、ABGD划分法和系统发育树法可以得出一致的物种鉴定结果,消除了BLAST比对法时出现的非单一物种。由此构建了一套方法齐全、标准明确的鸟类粪便物种鉴定体系。该体系使得鸟类物种鉴定流程更具系统性、规范性,得出可信的鉴定结论,可以推广应用于其他检材的物种鉴定领域。 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 基因组DNA提取、PCR扩增与测序
    1.3 数据处理
2 结果
    2.1 序列比对
    2.2 遗传距离、系统发育分析与ABGD的划分
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]运用DNA条形码技术鉴定茶园蜘蛛物种[J]. 邢树文,孙延杰,朱慧,查广才.  植物保护. 2019(01)
[2]线粒体COI基因条形码在鲿科鱼类物种鉴定中的应用[J]. 梁宏伟,孟彦,罗相忠,李忠,邹桂伟.  中国水产科学. 2018(04)
[3]粪便DNA分析技术在分子生态学研究中的机遇与挑战[J]. 单磊,胡义波,魏辅文.  兽类学报. 2018(03)
[4]基于DNA条形码技术的永暑礁泻湖鱼卵鉴定研究[J]. 吴娜,张楠,曹明,郭华阳,朱克诚,杨静文,江世贵,张殿昌.  淡水渔业. 2018(02)
[5]动物DNA条形码之分析方法研究进展[J]. 李晶,刘雪涛,郭华威,岳碧松,李静.  四川动物. 2013(06)
[6]基于进化树、距离和特征的DNA条形码方法研究——以百花山地区草螟科为例[J]. 杨聪慧,金倩,陈付强,武春生,张爱兵.  应用昆虫学报. 2013(01)
[7]DNA技术鉴定动物物种研究评述[J]. 周用武.  通化师范学院学报. 2008(02)
[8]DNA条形编码技术在动物分类中的研究进展[J]. 王鑫,黄兵.  生物技术通报. 2006(04)
[9]生物分类学的新动向——DNA条形编码[J]. 肖金花,肖晖,黄大卫.  动物学报. 2004(05)

硕士论文
[1]基于粪便分子生物学的马鹿个体识别、亲缘关系分析及家域确定[D]. 张辉.东北林业大学 2010



本文编号：3689900