窄吉丁亚科分子系统发育研究

发布时间：2023-03-19 11:49

　　窄吉丁亚科Agrilinae隶属于鞘翅目Coleoptera吉丁总科Buprestoidea吉丁科Buprestidae,已知4族23亚族200属。前人对窄吉丁亚科的研究主要集中在传统分类学研究,涉及分子系统发育研究的报道较少。目前,窄吉丁亚科的分类系统存在较多争议,且窄吉丁亚科系统发育关系不清楚。本文首次对窄吉丁亚科分子系统学进行研究,选用了吉丁亚科Bupretinae 4属4种和筒吉丁亚科Polycestinae 1属1种作为外群,窄吉丁亚科4族13亚族20属69种作为内群,基于线粒体基因和核基因联合序列(COI、Cytb、18Sr DNA和28Sr DNA)运用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树,对窄吉丁亚科内的族级系统进行了探讨。本文通过测序获得窄吉丁亚科COI基因序列51条、Cytb基因序列57条、18Sr DNA序列41条和28Sr DNA序列31条,共计180条序列。研究发现,四基因序列联合构建的系统发育树比三基因序列联合构建的系统发育树的拓扑结构更稳定,置信度更高,贝叶斯树(BI)和最大似然树(ML)更相似。在所构建的系统发育树中,BI树和ML树基部拓扑结构不同,多数端...

【文章页数】：73 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 窄吉丁亚科昆虫概述
        1.1.1 窄吉丁亚科昆虫形态特征
        1.1.2 窄吉丁亚科高级阶元分类系统发展
    1.2 分子标记的运用
        1.2.1 分子系统学概述
        1.2.2 线粒体DNA(mt DNA)
        1.2.3 细胞核DNA(r DNA)
    1.3 研究进展
    1.4 存在问题及研究目的和意义
        1.4.1 存在的问题
        1.4.2 本研究的目的和意义
第2章 实验材料和方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 标本收集和保存
        2.1.2 主要实验仪器和试剂
    2.2 实验方法
        2.2.1 基因组DNA提取
        2.2.2 引物设计与合成
        2.2.3 不同基因片段的PCR扩增与测序
    2.3 数据处理和分析
        2.3.1 测序数据的处理和序列拼接及对比
        2.3.2 序列的组成分析
        2.3.3 遗传距离分析
        2.3.4 饱和性分析
        2.3.5 模型选择
        2.3.6 系统发育树的构建
        2.3.7 系统发育树的处理
第3章 结果与分析
    3.1 序列特征分析
        3.1.1 序列组成成分分析
        3.1.2 遗传距离分析
        3.1.3 碱基替换饱和性分析
    3.2 系统发育分析
        3.2.1 三基因联合构建的系统发育树
        3.2.2 基于18Sr DNA、28Sr DNA、COI和 Cytb四基因联合构建的系统发育树
    3.3 不同方法所构建的系统发育树的比较
第4章 讨论
    4.1 窄吉丁亚科的单系性
    4.2 窄吉丁亚科族间的系统发育关系
    4.3 窄吉丁亚科部分亚族间、属间的系统发育关系
        4.3.1 潜吉丁族部分亚族间、属间的系统发育关系
        4.3.2 头吉丁族部分亚族间、属间的系统发育关系
        4.3.3 纹吉丁族部分亚族间、属间的系统发育关系
        4.3.4 窄吉丁族部分亚族间、属间的系统发育关系
第5章 结论
第6章 本文的创新点
第7章 本文的不足
第8章 展望
参考文献
附录
致谢
在学期间的科研情况



本文编号：3765197