宏基因组技术在抗生素抗性基因筛选中的初步研究
发布时间:2023-03-23 18:36
【背景】抗生素被过度滥用的情况十分普遍,细菌耐药问题越渐成为人们的焦点。【目的】构建广东省珠江淇澳岛红树林湿地土壤宏基因组文库并进行抗生素抗性基因的功能筛选。【方法】采集土壤标本并提取总DNA构建宏基因组文库,利用梯度平板筛选法筛选新型抗生素抗性基因,对筛选到的基因进行生物信息学分析。【结果】构建了片段多样性良好、阳性克隆率高、插入片段平均长度为5kb的红树林土壤宏基因组文库。筛选获得硫酸链霉素抗性基因strr719,并对新基因strr719进行了生物信息学分析。【结论】建立起一种可对生态系统进行潜在抗生素抗性基因污染的健康评估手段,为今后对抗生素抗性基因这种新型的污染物进行进一步的研究奠定了一定的基础,有助于对抗生素抗性基因污染问题的解决。
【文章页数】:3 页
【文章目录】:
1 背景
2 材料与方法
2.1 样品、材料来源
2.2 土壤基因组的提取
2.3 宏基因组文库的构建和保存
2.4 抗生素抗性基因ARGs的筛选
2.5 测序和序列分析
3 结果与分析
3.1 土壤DNA的提取与纯化
3.2 宏基因组文库的质量验证
3.3 抗生素抗性基因ARGs的筛选
3.4 硫酸链霉素抗性基因的生物信息学初步分析
4 结论
本文编号:3768530
【文章页数】:3 页
【文章目录】:
1 背景
2 材料与方法
2.1 样品、材料来源
2.2 土壤基因组的提取
2.3 宏基因组文库的构建和保存
2.4 抗生素抗性基因ARGs的筛选
2.5 测序和序列分析
3 结果与分析
3.1 土壤DNA的提取与纯化
3.2 宏基因组文库的质量验证
3.3 抗生素抗性基因ARGs的筛选
3.4 硫酸链霉素抗性基因的生物信息学初步分析
4 结论
本文编号:3768530
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