中国西南喀斯特地域淡水蟹类的物种多样性及分子系统地理学研究

发布时间：2023-05-07 02:24

　　目的:1.基于16S rRNA基因建立分布于中国西南喀斯特地域淡水蟹物种的系统发生树,探讨与确立中国淡水蟹类地理区划分区单元与西南喀斯特地貌的关系。2.基于作者采集和南昌大学基础医学院淡水十足目甲壳动物与并殖吸虫研究室标本库所保藏的西南八省区的31属129物种合计640个淡水蟹类个体,由此构建西南喀斯特地域淡水蟹类地理信息系统(GIS),旨在寻找喀斯特地貌与淡水蟹类物种的分布方式及物种多样性间可能存在的内在规律。3.测定中国西南喀斯特地貌溪蟹科下7属7种淡水蟹线粒体基因组,并进行系统发生分析以及比较线粒体基因组学研究,尝试厘清中国西南喀斯特地貌淡水蟹类的分子系统发育关系,推演该地域淡水蟹类属、种可能的分化年代。方法:1.基于对西南喀斯特地域淡水蟹类形态分类及其分子亲缘的初步研究,样点的选择以淡水蟹类“种”为基准,依据喀斯特地貌特征来确定标本的具体采集地点,作者与研究团队按照课题计划前往拟定的地点进行标本采集,并统计研究室标本库历年已在西南喀斯特地域采集保存的淡水蟹类标本一同用于本项目研究。对所选取的标本在与模式标本比对的基础上进行形态学鉴定,记录标本采集样点的经纬度等,并对其是否处于喀...

【文章页数】：123 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 引言
    1.1 中国西南喀斯特地域特征概况
        1.1.1 西南喀斯特的分布及特征
        1.1.2 生物喀斯特
        1.1.3 西南喀斯特的生物多样性
    1.2 中国西南喀斯特地域淡水蟹类的物种多样性
    1.3 中国大陆淡水蟹类的研究进展
        1.3.1 形态学方面的分类研究
        1.3.2 分子水平的分类研究
        1.3.3 短尾类系统发生分析概况
        1.3.4 线粒体基因组在短尾类中的研究概况
    1.4 地理信息系统(GIS)研究概况
第二章 中国西南喀斯特淡水蟹类的分布格局的探讨及地理信息系统(GIS)的构建与初步应用
    2.1 实验材料
        2.1.1 样本采集与保存
        2.1.2 形态学分类与鉴定
        2.1.3 主要实验仪器和设备
    2.2 实验方法
        2.2.1 DNA的提取
        2.2.2 PCR扩增
        2.2.3 数据选择与分析
        2.2.4 系统发生分析
        2.2.5 地理信息系统分析
    2.3 实验结果
        2.3.1 形态学分类鉴定
        2.3.2 系统发生分析
        2.3.3 基于地理信息系统分析淡水蟹类的分布格局
    2.4 讨论
第三章 中国西南喀斯特地域7属7种淡水蟹线粒体全基因组分析
    3.1 实验材料
    3.2 实验方法
        3.2.1 测序、组装和注释线粒体基因组
        3.2.2 系统发生分析
        3.2.3 分歧时间估算
    3.3 实验结果
        3.3.1 凯里龙溪蟹Longpotamon kenliense
        3.3.2 茂兰中国溪蟹Chinapotamon maolanense
        3.3.3 相似非拟溪蟹Aparapotamon similium
        3.3.4 镜头华石蟹Sinolapotamon patellifer
        3.3.5 兴安内陆溪蟹Neilupotamon xinganense
        3.3.6 灵川博特溪蟹Bottapotamon lingchuanense
        3.3.7 宽腹小石蟹安顺亚种Tenuilapotamon latilum anshunense
        3.3.8 线粒体基因组组成及分析
        3.3.9 基因重排分析
        3.3.10 系统发生的分析
        3.3.11 分歧时间估算
    3.4 讨论
第四章 结论
致谢
参考文献
攻读学位期间的研究成果
综述
    参考文献



本文编号：3810058