海南山栏稻抗旱基因转录组分析

发布时间：2023-05-28 11:43

　　山栏稻是海南独有的地方旱稻,具有丰富的抗旱基因资源。本研究以海南山栏稻品种白沙糯为材料,利用转录组测序技术研究在模拟干旱胁迫后其转录组水平的变化。主要结果如下:山栏稻白沙糯干旱胁迫后有2 791个基因差异表达,差异表达基因中有184个转录因子在干旱胁迫后显著上调,包含了Znf、AP2/ERF、MYB、NAC、bZIP等抗旱转录因子,其中Znf家族转录因子所占数量最多。表达分析显示一些未注释的基因,如Os01g0910800随着胁迫时间的延长,表达水平逐渐上升且倍数明显。该研究获得的转录组数据和数字基因表达谱,为山栏稻抗旱机理的研究提供了信息资源,并为进一步解析山栏稻的抗旱机理奠定基础。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 植物材料培育
        1.2.2 建库和转录组测序
        1.2.3 数据过滤、重新序列组装以及unigenes的功能注释
        1.2.4 CDS预测基因和表达水平分析
        1.2.5 差异表达unigenes的验证和表达分析
2 结果
    2.1 转录组拼接质量分析及参考序列比对
    2.2 SNP与InDel
    2.3 基因表达对比
    2.4 差异基因GO富集分析和KEGG富集分析
    2.5 差异基因转录因子对比
    2.6 差异表达基因验证
    2.7 干旱胁迫相关差异基因不同胁迫时段的表达检测
3 讨论
4 结论



本文编号：3824523