枇杷脂类相关质体蛋白基因PAP的克隆及表达分析

发布时间：2024-03-10 16:29

　　本研究以‘大五星’(红肉)和‘川农159’(白肉)枇杷不同发育阶段的果皮、果肉为试验材料,采用同源克隆法从枇杷中分离PAP基因后采用qRT-PCR对两种材料不同时期的皮和肉进行定量分析。结果如下:该基因的CDS区具有一个长744 bp的开放阅读框,编码247个氨基酸。氨基酸序列的同源性分析表明,枇杷PAP蛋白与白梨(Pyrus bretschneideri)相似性高达97%。进化树也进一步说明,枇杷与白梨的进化关系最近。定量分析表明:白肉枇杷果肉中PAP基因的表达量平均水平较低,成熟的果皮果肉中PAP基因的表达量都表现为红肉枇杷显著高于白肉枇杷,表明PAP影响枇杷色素形成。本试验结果更清晰地呈现出了EjPAP基因的序列结构以及PAPs蛋白在枇杷果实呈色过程中的重要作用。

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

图4PAP基因推导的氨基酸序列与其他植物PAP氨基酸序列的多重比对

类胡萝卜素是枇杷的重要呈色色素(洪敏等,2018a)。植物类胡萝卜素是一类在质体(包括植物组织器官中的叶绿体其他有色体等)中合成、积累的脂溶性色素，植物细胞内不同类型的质体可以进行对类胡萝卜素分子的锚定、储藏或留存，以此达到对类胡萝卜素的累积的调控作用(Luetal.,200....

图1RNA电泳和PAP扩增电泳

以‘大五星’(红肉)和“川农1-5-9”(白肉)提取RNA后经反转录得到单链cDNA，利用简并引物PCR扩增后得到一条788bp的条带(图1)，克隆后获得PAP基因碱基序列(图2)，比对后发现两个品种PAP基因的cDNA序列相似率达99.47%，与白梨(Pyrus×brets....

图2‘大五星’和‘川农1-5-9’枇杷PAP基因序列比对

将由ORFFinder寻找出的氨基酸序列进行同源性检索对比(图4)，发现枇杷PAP蛋白与蔷薇科的白梨(XP＿018504515.1)、苹果(XP＿008393974.1)、野樱(PQQ05784.1)、桃(XP＿007209976.2)的一致性分别为97%、95%、86%、85....

图3PAP蛋白三维结构预测

图2‘大五星’和‘川农1-5-9’枇杷PAP基因序列比对进化树建立的结果表明(图5)，说明枇杷PAP蛋白与白梨的进化关系最近，与拟南芥的进化关系最远，同时苹果与枇杷的进化关系也比较近，这与枇杷其他基因进化关系分析也几近相同。

本文编号：3925076