盲鼹形鼠属（Spalax）物种形成式样的基因组研究

发布时间：2024-12-17 21:45

　　物种形成是生物多样性的基础。生态物种形成（ecological speciation）是指以生态为基础的歧化选择使祖先物种的不同群体分化产生生殖隔离的物种形成过程。生态物种形成可分为辐射式（radiative speciation）和二歧式（bifurcating divergence）两种方式。以色列境内的盲鼹形鼠（Spalax）对不同气候带的适应歧化形成了不同的物种,但其成种式样尚未阐明。本研究通过比较Spalax属的5个不同物种的基因组,解析了物种形成过程中的基因组分化、群体历史、物种形成式样及其各物种对不同气候带适应的关键基因,主要研究结果如下:1、对分布于以色列境内5个不同地区的52个个体进行全基因组重测序,mapping到参考基因组,经过过滤去除亲缘关系近的个体后得到41个个体的全基因组数据,采用进化树分析、主成分分析和遗传结构分析,结果表明Spalax属5个物种呈现显著的遗传分化。同一物种内的个体聚集在一起,5个种群相互分开。各物种编码区和非编码区SNPs构建的进化树呈现相同的遗传结构。2、Spalax的5个物种均以二歧方式成种（其中S.galili chalk和S.gal...

【文章页数】：79 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1辐射式成种（A）和二歧式成种（B）形成式样示意图

1概述2态环境，进化出多样的表型，这种物种形成方式主要发生在岛屿物种形成过程中（图1A）。由于它们几乎同时分化，导致不同的种间基因流频繁发生，很多情况下种对之间的基因流大小类似；并且由于分化时间短，祖先多态性也经常保留在物种内，和基因流一起导致物种树呈现平行式而非二歧式[8]。相....

图2（A）染色体正常状态和（B）罗伯逊易位状态形成示意图

┥⒌娜?龇较蛭?投?砂氲骸⑽诳死嫉厍?以及中东和非洲北部地区。这种气候适应性呈现出具有明显趋势的染色体数目差异，在盲鼹形鼠起源地区的染色体数目为2n=38，三个扩散方向的终点均为2n=62[25]。在以色列境内通过形态学、生理学、行为学、基因组学和蛋白质组学等手段将盲鼹形鼠属划分....

图3Spalax属物种染色体罗伯逊易位示意图

1概述4罗伯逊易位（Robertsoniantranslocation），是在1916年由罗伯逊（Robertson）所发现而得名，是哺乳动物中最常见的染色体重排之一[26,27]，发生易位时两条临近的着丝粒染色体首先断裂，然后它们的长臂在着丝粒处接合形成一条衍生染色体；两个短臂....

图4（A）盲鼹形鼠的地理分布、气候特征、年降雨量与降雨天数

1概述5体条数为2n=58，年降雨量为500～650mm，降雨天数为44～55天；S.judaei分布在温暖干燥的以色列中南部地区，深入到内盖夫沙漠北部地区，如图4A中的棕色区域，其染色体条数为2n=60，年降雨量为100～500mm，年降雨天数为15～45天；图中的白色区域为半....

本文编号：4016574