基于癌症基因组图谱挖掘丙酮酸脱氢酶激酶1在脑胶质瘤中的表达及临床意义

发布时间：2021-11-17 18:39

　　目的 利用癌症基因组图谱（TCGA）分析丙酮酸脱氢酶激酶1（PDK1）在脑胶质瘤中的表达和临床意义。方法 回顾性分析TCGA数据库中641例脑胶质瘤患者的临床资料。采用GEPIA（http：//gepia.cancer-pku.cn/）在线分析网站分析PDK1在脑胶质瘤患者中的表达情况。之后采用Pearson相关分析法创建与PDK1相关的基因列表,再利用STRING在线分析工具对差异基因进行互作网络分析,根据可信度大小筛选出关键蛋白。进一步通过基因本体分析（GO）获得PDK1相关差异基因的功能及与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路的关系。根据PDK1蛋白表达量将所有患者分为PDK1蛋白低表达组（380例）和PDK1蛋白高表达组（261例）,采用Kaplan-Meier生存曲线比较两组患者的生存期差异。进一步采用单因素和多因素Cox回归分析法判断PDK1蛋白表达对脑胶质瘤患者预后的作用。结果 PDK1蛋白在世界卫生组织（WHO）Ⅳ级胶质瘤中的表达明显高于Ⅱ、Ⅲ级（均P<0.05）,且Ⅱ、Ⅲ级间的差异无统计学意义（Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级的蛋白相对表达量分别为7.24±0.60、7.34±... 

【文章来源】：中华神经外科杂志. 2020,36(03)

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本文编号：3501464