利用COI序列序列鉴定常见嗜尸性蝇种

发布时间：2017-12-10 22:03

  本文关键词：利用COI序列序列鉴定常见嗜尸性蝇种

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【摘要】：目的检测嗜尸性蝇类线粒体DNA(mtDNA)细胞色素氧化酶辅酶I(COI)中278bp序列,鉴定蝇科3属5种嗜尸性蝇,解决其形态学种类鉴定的难题,为死亡时间推断提供技术支持。方法从15省、市(地区)室外草地家兔尸体上采集蝇科3属5种共计18个蝇类成蝇样本,提取mtDNA进行PCR扩增,序列测定且上传GENBANK,并使用MEGA软件进行序列比对及进化距离分析,构建不同地区各种内和种间系统发育树,尝试区分常见嗜尸性蝇类。结果基因序列分析结果显示,上述蝇类mtDNA上COI基因序列的种内进化分歧均数在0%～0.8%,种间进化分歧均数在7.6%～13.4%之间;进化距离分析显示,在种间水平,家蝇和孕幼家蝇、斑趾黑蝇和家蝇、厩螫蝇和厚环黑蝇Bootstrap检验的可信度分别为56%、31%、53%;种内水平除了家蝇和厚环黑蝇外,其他Bootstrap检验可信度均为100%。结论嗜尸性蝇类mtDNA中COI序列分析能够区分常见嗜尸性蝇类,作为形态学方法的补充手段,实现精确的蝇种鉴定。
【作者单位】： 中南大学基础医学院法医学系;湖南公安警官学校;
【基金】：湖南省自然科学基金资助项目(11JJ5075) 公安部应用创新计划项目(2011YYCXHNST074) 大学生教育创新基金(YC09139,YC10108,YC10118)
【分类号】：D919
【正文快照】： 嗜尸性昆虫种类鉴定,可对案件推断死亡时间起到关键作用。本研究尝试运用国际上广泛应用的278 bp COI基因序列,对采集于15省、市(地区)的蝇科3属5种共计18个蝇类成蝇样本进行种类鉴定。通过此项研究丰富法医学死亡时间的研究方法,推动分子生物学技术在法医昆虫学中的应用及发

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 安瑞生,谭声江,陈晓峰;小型昆虫DNA提取时匀浆方法的改进[J];昆虫知识;2002年04期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前8条

1 蔡继峰,董建国,刘敏,应斌武,陶涛,潘洪富,张林,闫红涛,张嘉陵,廖志钢;呼和浩特等地区嗜尸性苍蝇mtDNA中COⅠ基因序列检测及法医学应用[J];法医学杂志;2005年02期

2 王利华,吴益东;与拟除虫菊酯抗性相关的烟粉虱钠通道基因突变及其检测[J];昆虫学报;2004年04期

3 蔡继峰,刘敏,应斌武,董建国,邓振华,陶涛,潘洪富,张红霞,闫红涛,廖志钢;成都地区四种食尸性蝇类mtDNA中COⅠ基因序列检测[J];昆虫学报;2005年01期

4 杨子祥;陈晓鸣;冯颖;缪迎春;;蚜虫基因组DNA提取方法的改进[J];昆虫知识;2006年06期

5 杨子祥,冯颖,陈晓鸣;一种有效的蚜虫基因组DNA提取方法[J];林业科学研究;2005年05期

6 马丽滨;许升全;;蚂蚁DNA提取方法的研究[J];陕西师范大学学报(自然科学版);2006年01期

7 张翔;刘思源;徐小军;贺虹;;五种林木蚜虫的RAPD分析[J];西北林学院学报;2006年01期

8 蔡凤环,赵惠燕;麦长管蚜自然群体的遗传变异研究[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);2004年02期

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 娄蕴萍;张友军;吴青君;徐宝云;朱国仁;;寄主植物对B型烟粉虱(Bemisia tabaci)遗传分化的影响[A];农业生物灾害预防与控制研究[C];2005年

中国博士学位论文全文数据库 前7条

1 齐宝瑛;盲蝽科部分昆虫分子系统学研究（半翅目：异翅亚目）[D];陕西师范大学;2003年

2 贺虹;中国麦红吸浆虫地理种群遗传变异及基因流研究[D];西北农林科技大学;2004年

3 张丽萍;外来入侵烟粉虱的种群动态、遗传分化及对噻虫嗪的抗性分子机理研究[D];中国农业大学;2005年

4 应斌武;法医昆虫种属鉴定的分子生物学方法研究[D];四川大学;2005年

5 蔡继峰;苍蝇群落演替及MtDNA分子标记的法医学研究[D];四川大学;2005年

6 顾沛雯;小麦蓝矮病植原体的鉴定及其免疫膜蛋白（Imp）基因分子特性研究[D];西北农林科技大学;2007年

7 王利华;烟粉虱对高效氯氰菊酯和阿维菌素抗性的生化和分子机理[D];南京农业大学;2007年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 胡祖庆;胞内共生菌对不同体色型麦长管蚜影响的研究[D];西北农林科技大学;2007年

2 王韶辉;利用微卫星标记对蚜虫种群遗传多样性的初步研究[D];陕西师范大学;2003年

3 蔡凤环;麦长管蚜地理种群的遗传变异研究[D];西北农林科技大学;2003年

4 文菊华;应用EST同工酶与RAPD对狼蛛科部分种属间的亲缘关系研究[D];湖南师范大学;2004年

5 刘晓丽;部分拟步甲线粒体16S rDNAT 18S rDNA基因序列与分子系统学研究[D];河北大学;2004年

6 陈磊;不同植物上桃蚜两种体色生物型的DNA多态性研究和线粒体COⅠ-Ⅱ部分序列分析[D];西北农林科技大学;2005年

7 冰梅;内蒙古苜蓿盲蝽属昆虫部分种类CYTB和COII基因片段序列分析[D];内蒙古师范大学;2005年

8 刘莹;两种人体蠕形螨超微结构和基因组提取的研究[D];山东大学;2005年

9 张琰;基于ISSR分子标记的角倍蚜种群遗传多态性[D];山西大学;2006年

10 娄蕴萍;寄主植物对B型烟粉虱种群遗传分化的影响[D];中国农业科学院;2006年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 徐广,郭予元,梁革梅,张杰;SDS-苯酚法提取高质量的棉铃虫DNA[J];昆虫知识;2000年03期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 王金合;王平;姜峰;韩林;王喜爱;吕玉民;;X射线致人外周血线粒体DNA 4977bp缺失的时效关系研究[J];辐射防护;2011年05期

2 ;[J];;年期

3 ;[J];;年期

4 ;[J];;年期

5 ;[J];;年期

6 ;[J];;年期

7 ;[J];;年期

8 ;[J];;年期

9 ;[J];;年期

10 ;[J];;年期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 王江峰;陈玉川;胡丙杰;闵建雄;李俊涛;李杰;;若干新技术在法医昆虫学中的应用[A];全国第六次法医学术交流会论文摘要集[C];2000年

2 王江峰;陈玉川;曾家乐;胡丙杰;闵建雄;李俊涛;李杰;陈兴武;涂朝晖;;若干新技术在法医昆虫学中的应用[A];中国法医学最新科研与实践（一）——全国第六次法医学术交流会论文精选[C];2000年

3 王江峰;陈玉川;竞花兰;程新志;叶永忠;梁敏捷;黄安海;苛桂枝;廖明庆;谢振铁;;法医昆虫学现场取样方法研究[A];中国法医学最新科研与实践（二）——全国第七次法医学术交流会论文精选[C];2004年

4 王江峰;陈玉川;竞花兰;李朝晖;刘小山;;法医昆虫学的发展及应用[A];广东省法医学会成立两周年暨学术交流会论文集（2）[C];2004年

5 李万水;陈松;刘冰;胡兰;徐秀兰;;中国人群线粒体DNA HVI区单倍型频率统计和法医学意义初探[A];第二届全国法医DNA检验技术研讨会论文专辑[C];2004年

6 方慧;杨庆恩;胡家伟;;线粒体DNA的PCR-RFLP分型法医学应用研究[A];全国第七次法医学术交流会论文摘要集[C];2004年

7 张纯斌;周静;宋慧娟;倪锦堂;李伯龄;;人类线粒体DNA多态区序列测定的研究[A];首届中国法医物证学术交流会论文汇编[C];1993年

8 张纯斌;周静;倪锦堂;李伯龄;;人类线粒体DNA多态区荧光标记序列分析的研究及其在法庭科学中的应用[A];第五次全国法医学术交流会论文集[C];1996年

9 郭景元;赵勇;;线粒体DNA测序分析及其法医学应用[A];第五次全国法医学术交流会论文集[C];1996年

10 孙宏钰;欧宁峰;陆惠玲;蔡贵庆;陈丽娴;伍新尧;;中国广东汉族群体mtDNA控制区的多态性[A];广东省法医学会成立两周年暨学术交流会论文集（1）[C];2004年

中国博士学位论文全文数据库 前6条

1 应斌武;法医昆虫种属鉴定的分子生物学方法研究[D];四川大学;2005年

2 郭亚东;常见嗜尸性麻蝇分子标记的检测及地区基因库的建立[D];中南大学;2012年

3 蔡继峰;苍蝇群落演替及MtDNA分子标记的法医学研究[D];四川大学;2005年

4 杜冰;常染色体三个miniSTR同步检测和mt-SNP的微测序检测研究[D];四川大学;2007年

5 法娜;中巴法医昆虫种类研究—侧重丽蝇及其分子鉴定[D];浙江大学;2009年

6 李凯;尸食性蝇类的分子鉴别及其发育生物化学特征用于死后间隔时间推断的基础研究[D];浙江大学;2006年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 刘莹;广西都安瑶族线粒体DNA控制区及Y-STR多态性研究[D];四川大学;2004年

2 荆玉婷;线粒体DNA单核苷酸多态性（SNPs）微测序检测方法的研究[D];山西医科大学;2007年

3 熊枫;应用细胞色素氧化酶亚基I鉴定蝇科常见嗜尸性蝇种[D];中南大学;2012年

4 王兴华;16SrDNA对中国常见嗜尸性丽蝇的种类鉴定及法医学意义[D];中南大学;2011年

5 方月琴;线粒体基因复合扩增进行种属鉴定的研究[D];四川大学;2006年

6 刘新云;脑CT示基底节钙化者的线粒体DNA突变研究[D];山东大学;2005年

7 刘超;不同条件下核酸样本制备的质量控制和参数建立[D];浙江大学;2007年

8 张艳;军事噪声性听力损失群体中mtDNA和GJB2基因变异研究[D];昆明医学院;2008年

9 张明阳;应用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析线粒体DNA多态性及其法医学应用的研究[D];中国医科大学;2009年

10 田力;线粒体DNA 16srRNA和ND4基因荧光标记复合扩增在法医学种属鉴定中的应用研究[D];四川大学;2006年

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本文编号：1276033