新疆维吾尔族常染色体30个InDel位点遗传结构与群体遗传关系研究

发布时间：2017-12-12 00:10

  本文关键词：新疆维吾尔族常染色体30个InDel位点遗传结构与群体遗传关系研究

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【摘要】：目的:本研究拟对30个InDel位点(HLD6、HLD39、HLD40、HLD45、HLD48、HLD56、HLD58、HLD64、HLD67、HLD70、HLD77、HLD81、HLD83、HLD84、HLD88、HLD92、HLD93、HLD97、HLD99、HLD101、HLD111、HLD114、HLD118、HLD122、HLD124、HLD125、HLD128、HLD131、HLD133、HLD136)在新疆地区维吾尔族群体中遗传多样性进行分析,评估30个InDel基因座的法医学鉴别效能,并基于已发表的群体遗传学数据,对新疆维吾尔族和其他民族群体之间的遗传关系进行研究。方法:(1)采集新疆维吾尔族136个无关个体的样本,利用Chelex-100法提取基因组DNA后,利用PCR复合扩增和毛细管电泳对30个InDel位点进行基因分型。统计30个InDel位点的基因分型数据,并计算各基因座的等位基因频率和它们的法医学参数。(2)利用SNP Analyzer V2.0软件进行连锁不平衡分析;利用21个其他民族的30个InDel位点的分型数据,并结合本研究中新疆维吾尔族的分型数;利用ARLEQUIN软件对这些民族群体间相同的位点进行分子方差分析;利用DISPAN软件计算这些族群间的遗传距离DA;利用MEGA软件构建族群的系统发育树;利用软件MVSP进行族群的主成分分析,利用STRUCTURE软件进行族群的聚类分析。结果:(1)30个InDel基因座在新疆维吾尔族具有较高的多态性,累积个体识别力和累积非父排除率分别是0.999999999999399和0.99632。(2)对新疆维吾尔族和其他21个群体的遗传关系研究显示,新疆维吾尔族与乌鲁木齐维吾尔族和哈萨克族的具有统计学差异的位点最少;在系统发育树,主成分分析和人群聚类分析中表现出较近的遗传关系。新疆维吾尔族和6个墨西哥群体表现出较远的遗传关系。结论:30个常染色体InDel位点在新疆维吾尔族群体中法医学效能高可用于个体识别,与乌鲁木齐维族和哈萨克族遗传关系最近。
【学位授予单位】：新疆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：Q987

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本文编号：1280426