梭罗草AFLP多态性分析及指纹图谱构建

发布时间：2018-01-07 03:05

本文关键词：梭罗草AFLP多态性分析及指纹图谱构建　出处：《青海大学》2017年硕士论文　论文类型：学位论文

更多相关文章： 梭罗草 AFLP 指纹图谱 遗传多样性

【摘要】：本研究以青海高寒草原乡土植物梭罗草(Kengyilia thoroldiana)为主要研究材料,并与近缘物种大颖草(K.grandiglumis)、糙毛以礼草(K.hirsuta)、疏花以礼草(K.laxiflora)和硬杆以礼草(K.rigidula)进行对比,建立并优化梭罗草的扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)反应体系,通过AFLP分子标记技术分析梭罗草的居群间及个体间的多样化水平,构建梭罗草的AFLP指纹图谱。研究结果如下:利用梭罗草基因组DNA优化并建立的梭罗草AFLP反应体系为:预扩增反应体系(25μl):连接产物1μl;10×PCRBuffer2.5μl;dNTPs 0.375μl;Mg2+1μl;TaqDNA聚合酶0.5μl;EcoR I预扩引物1μl;Mse I预扩引物1.2μl;ddH2O加至25μl。选扩增反应体系(25μl):预扩产物(稀释20倍)2.0μl,10×PCRBuffer2.5μl;dNTPs 0.60μl;Mg2+2μl;TaqDNA聚合酶0.1μl;EcoR I选扩引物1.5μl;Mse I选扩引物2.5μl;ddH2O加至25μl。利用优化后的AFLP体系,用216对E/M组合的引物对梭罗草(8个居群)和大颖草、疏花以礼草各1个居群共10份供试材料进行了引物筛选,筛选出了38对具有多态性的引物,其中6对扩增条带清晰,鉴别效率高,用这6对引物构建了梭罗草的指纹图谱。引物组合E16C4和E4C10的扩增条带中均有梭罗草的特征条带,可用于梭罗草的种质鉴定和纯度鉴定。组合E16C4、E3C16扩增出的8个多态性条带可以将10份供试材料彼此区分。利用AFLP技术对12个梭罗草居群和4个近缘草种居群进行遗传多样性研究。用38对AFLP引物对16个居群进行遗传多样性分析,扩增出122个多态性位点。12个梭罗草居群间的遗传同一性变异范围为0.6837-0.8859,遗传距离变异范围为0.1212-0.3802,梭罗草居群间的遗传变异占总遗传变异的比例(Gst)为42.82%,大部分(57.18%)遗传变异存在于居群内部,海拔、生境及栽培条件都对梭罗草的遗传多样性和聚类关系产生影响。
[Abstract]:In this paper , we studied the genetic diversity of Thoreau grass ( 25渭l ) by AFLP molecular marker technique . The primers were used to amplify the amplified fragment length polymorphism ( AFLP ) reaction system of Thoreau grass . Most of ( 57.18 % ) genetic variation exists within the population , and the elevation , habitat and culture conditions have an impact on the genetic diversity and clustering relationship of Thoreau grass .

【学位授予单位】：青海大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：Q943.2

【相似文献】