嗜盐真菌Aspergillus montevidensis ZYD4耐盐机理初步研究
发布时间:2020-12-17 17:22
嗜盐菌因其在高盐环境适应性进化中形成了特殊的遗传机制、生理结构和代谢类型,同时含有特殊的耐盐基因以及可以产生特殊的代谢产物,得到广泛关注。但目前关于嗜盐菌的耐盐机制研究主要集中在嗜盐细菌及嗜盐古菌等方面,对于嗜盐真菌研究较少。本研究以分离自陕北花马盐湖水泽沉积物的一株嗜盐真菌Aspergillus montevidensis ZYD4为研究对象,对其耐盐机理进行了初步探究,主要研究结果如下:1.通过对嗜盐真菌ZYD4生物学特性进行初步探究发现:嗜盐真菌ZYD4最适生长盐浓度为1.5 mol/L,以蔗糖为碳源、以蛋白胨为氮源时表现出最好的耐盐性,最佳碳氮比为10:1。在不同碳氮源的影响下,随着盐浓度的增加,嗜盐真菌ZYD4菌落整体由黄色逐渐转变为青灰色至黑色。同时嗜盐真菌ZYD4在无盐条件下,以发育闭囊壳结构进行有性生殖为主,而在高盐环境中会以主要发育分生孢子梗结构进行无性繁殖为主。结果表明,嗜盐真菌ZYD4通过色素沉着和改变繁殖方式来缓解盐胁迫带来的压力。2.通过对嗜盐真菌ZYD4转录组进行分析最终获得19,729个Unigenes。分别在5个数据库中比对注释:18,486(NR:93...
【文章来源】:陕西理工大学陕西省
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
实验技术路线
第3章嗜盐真菌AspergillusmontevidensisZYD4响应高盐诱导的转录组分析23可看出,碱基质量整体都在Q30以上,因此本次测序结果较为可信。图3-1单碱基测序质量分布图Fig.3-1Distributionmapofsinglebase为了检测测序数据是否存在AT、GC分离现象,对序列中四种碱基含量进行统计。由图3-2可以看出,由随意引物引起前几个碱基偏好性不同,导致序列前10bp出现杂乱异常峰值,其他位置的四种碱基所代表的四条线平行且相近,看出大部分序列的碱基出现的频率是接近的,反映出建库质量较好和测序样品未被污染。图3-2碱基含量分布图Fig.3-2Distributionofbasecontent对原始数据进行过滤后,样品测序产出数据质量结果整理如表3-2。5个平行对照组(AM.C)共得到35.51Gb干净序列,5个平行实验组(AM.S)共得到40.01Gb干净序列,共计75.52Gb;每个样本产生6.1Gb的干净序列,且对照组与实验组的所有样本
第3章嗜盐真菌AspergillusmontevidensisZYD4响应高盐诱导的转录组分析23可看出,碱基质量整体都在Q30以上,因此本次测序结果较为可信。图3-1单碱基测序质量分布图Fig.3-1Distributionmapofsinglebase为了检测测序数据是否存在AT、GC分离现象,对序列中四种碱基含量进行统计。由图3-2可以看出,由随意引物引起前几个碱基偏好性不同,导致序列前10bp出现杂乱异常峰值,其他位置的四种碱基所代表的四条线平行且相近,看出大部分序列的碱基出现的频率是接近的,反映出建库质量较好和测序样品未被污染。图3-2碱基含量分布图Fig.3-2Distributionofbasecontent对原始数据进行过滤后,样品测序产出数据质量结果整理如表3-2。5个平行对照组(AM.C)共得到35.51Gb干净序列,5个平行实验组(AM.S)共得到40.01Gb干净序列,共计75.52Gb;每个样本产生6.1Gb的干净序列,且对照组与实验组的所有样本
【参考文献】:
期刊论文
[1]青藏高原盐湖嗜盐微生物资源及应用前景[J]. 孔凡晶,王现洁. 科技导报. 2017(12)
[2]中度嗜盐菌Halobacillus Y5的生物学特性研究[J]. 王艳红,郑小亮,曹宁,贾桂燕,岳才军. 安徽农学通报. 2017(04)
[3]不同胁迫条件对鲁氏酵母胞内海藻糖积累的影响研究[J]. 胡梦蝶,陈雄,李欣,王志,代俊,黄珍,刘翠翠. 食品工业科技. 2016(11)
[4]基于高通量测序的陕西花马池和苟池微生物群落多样性分析[J]. 曹露芬,殷婷婷,袁振亚,严雨薇,谢凡凡,许心怡,徐方敏,温洪宇. 生物技术通讯. 2016(03)
[5]盐胁迫对枯草芽孢杆菌发酵代谢产物的影响[J]. 刘阳,邓静,吴华昌,张建军,龚加路,郑滨,陈建. 食品与发酵工业. 2015(07)
[6]海洋微生物产纤维素酶及其应用研究进展[J]. 韩笑,闫培生,史翠娟,杨树燕,李永鹏,邹雪平. 生物技术进展. 2015(03)
[7]嗜盐菌耐盐机制相关基因的研究进展[J]. 王伟伟,唐鸿志,许平. 微生物学通报. 2015(03)
[8]南海局部海洋沉积物中真菌多样性及产酶活性[J]. 曲佳,刘开辉,丁小维,邓百万,陈文强,郭庆兰,田新朋,张偲,李文均. 微生物学报. 2014(05)
[9]肺形侧耳高温后恢复期间海藻糖代谢途径研究[J]. 刘秀明,黄晨阳,陈强,邬向丽,张金霞. 中国农业科学. 2013(24)
[10]高效液相色谱检测青海湖嗜盐菌胞内积聚的相溶物质四氢嘧啶[J]. 李耀东,龙启福,李文军,芮豪辰,刘建,杨芳,朱德锐. 环境化学. 2013(09)
博士论文
[1]嗜盐微生物的多样性分析及其抗菌与抗肿瘤活性研究[D]. 陈雷.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2009
硕士论文
[1]胡杨响应盐胁迫的组织特异性转录组研究[D]. 于乐.兰州大学 2018
[2]基于转录组学和代谢组学研究大肠杆菌K12碳降解物阻遏作用[D]. 李宗瑾.深圳大学 2017
[3]华根霉脂肪酶液态发酵不同形态菌体的比较转录组学分析[D]. 范凯.江南大学 2017
[4]一株嗜盐真菌的分离鉴定与纤维素酶cbhⅡ基因的克隆与表达[D]. 杜剑晖.湖北大学 2017
[5]内蒙古鄂尔多斯一古盐湖真菌多样性及其功能酶的筛选[D]. 郭庆兰.陕西理工学院 2014
[6]嗜盐耐盐真菌的分类及分子系统学研究[D]. 王芳.山东农业大学 2013
[7]海洋耐(嗜)盐真菌及其次级代谢产物的初步研究[D]. 黄菁菁.厦门大学 2008
本文编号:2922396
【文章来源】:陕西理工大学陕西省
【文章页数】:79 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
实验技术路线
第3章嗜盐真菌AspergillusmontevidensisZYD4响应高盐诱导的转录组分析23可看出,碱基质量整体都在Q30以上,因此本次测序结果较为可信。图3-1单碱基测序质量分布图Fig.3-1Distributionmapofsinglebase为了检测测序数据是否存在AT、GC分离现象,对序列中四种碱基含量进行统计。由图3-2可以看出,由随意引物引起前几个碱基偏好性不同,导致序列前10bp出现杂乱异常峰值,其他位置的四种碱基所代表的四条线平行且相近,看出大部分序列的碱基出现的频率是接近的,反映出建库质量较好和测序样品未被污染。图3-2碱基含量分布图Fig.3-2Distributionofbasecontent对原始数据进行过滤后,样品测序产出数据质量结果整理如表3-2。5个平行对照组(AM.C)共得到35.51Gb干净序列,5个平行实验组(AM.S)共得到40.01Gb干净序列,共计75.52Gb;每个样本产生6.1Gb的干净序列,且对照组与实验组的所有样本
第3章嗜盐真菌AspergillusmontevidensisZYD4响应高盐诱导的转录组分析23可看出,碱基质量整体都在Q30以上,因此本次测序结果较为可信。图3-1单碱基测序质量分布图Fig.3-1Distributionmapofsinglebase为了检测测序数据是否存在AT、GC分离现象,对序列中四种碱基含量进行统计。由图3-2可以看出,由随意引物引起前几个碱基偏好性不同,导致序列前10bp出现杂乱异常峰值,其他位置的四种碱基所代表的四条线平行且相近,看出大部分序列的碱基出现的频率是接近的,反映出建库质量较好和测序样品未被污染。图3-2碱基含量分布图Fig.3-2Distributionofbasecontent对原始数据进行过滤后,样品测序产出数据质量结果整理如表3-2。5个平行对照组(AM.C)共得到35.51Gb干净序列,5个平行实验组(AM.S)共得到40.01Gb干净序列,共计75.52Gb;每个样本产生6.1Gb的干净序列,且对照组与实验组的所有样本
【参考文献】:
期刊论文
[1]青藏高原盐湖嗜盐微生物资源及应用前景[J]. 孔凡晶,王现洁. 科技导报. 2017(12)
[2]中度嗜盐菌Halobacillus Y5的生物学特性研究[J]. 王艳红,郑小亮,曹宁,贾桂燕,岳才军. 安徽农学通报. 2017(04)
[3]不同胁迫条件对鲁氏酵母胞内海藻糖积累的影响研究[J]. 胡梦蝶,陈雄,李欣,王志,代俊,黄珍,刘翠翠. 食品工业科技. 2016(11)
[4]基于高通量测序的陕西花马池和苟池微生物群落多样性分析[J]. 曹露芬,殷婷婷,袁振亚,严雨薇,谢凡凡,许心怡,徐方敏,温洪宇. 生物技术通讯. 2016(03)
[5]盐胁迫对枯草芽孢杆菌发酵代谢产物的影响[J]. 刘阳,邓静,吴华昌,张建军,龚加路,郑滨,陈建. 食品与发酵工业. 2015(07)
[6]海洋微生物产纤维素酶及其应用研究进展[J]. 韩笑,闫培生,史翠娟,杨树燕,李永鹏,邹雪平. 生物技术进展. 2015(03)
[7]嗜盐菌耐盐机制相关基因的研究进展[J]. 王伟伟,唐鸿志,许平. 微生物学通报. 2015(03)
[8]南海局部海洋沉积物中真菌多样性及产酶活性[J]. 曲佳,刘开辉,丁小维,邓百万,陈文强,郭庆兰,田新朋,张偲,李文均. 微生物学报. 2014(05)
[9]肺形侧耳高温后恢复期间海藻糖代谢途径研究[J]. 刘秀明,黄晨阳,陈强,邬向丽,张金霞. 中国农业科学. 2013(24)
[10]高效液相色谱检测青海湖嗜盐菌胞内积聚的相溶物质四氢嘧啶[J]. 李耀东,龙启福,李文军,芮豪辰,刘建,杨芳,朱德锐. 环境化学. 2013(09)
博士论文
[1]嗜盐微生物的多样性分析及其抗菌与抗肿瘤活性研究[D]. 陈雷.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2009
硕士论文
[1]胡杨响应盐胁迫的组织特异性转录组研究[D]. 于乐.兰州大学 2018
[2]基于转录组学和代谢组学研究大肠杆菌K12碳降解物阻遏作用[D]. 李宗瑾.深圳大学 2017
[3]华根霉脂肪酶液态发酵不同形态菌体的比较转录组学分析[D]. 范凯.江南大学 2017
[4]一株嗜盐真菌的分离鉴定与纤维素酶cbhⅡ基因的克隆与表达[D]. 杜剑晖.湖北大学 2017
[5]内蒙古鄂尔多斯一古盐湖真菌多样性及其功能酶的筛选[D]. 郭庆兰.陕西理工学院 2014
[6]嗜盐耐盐真菌的分类及分子系统学研究[D]. 王芳.山东农业大学 2013
[7]海洋耐(嗜)盐真菌及其次级代谢产物的初步研究[D]. 黄菁菁.厦门大学 2008
本文编号:2922396
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