羊呼吸系统微生物调查及主要疾病病原分析
发布时间：2021-01-09 00:47
呼吸系统疾病频发往往与呼吸道微生物的改变有着密切而直接的联系。呼吸道微生物与呼吸道疾病的相关性也越来越为人们所认可。探查呼吸道微生物分布,对于阐明疾病的发生发展、转化及相互作用的机制至关重要;同时为合理使用抗生素,疫苗预防等提供有价值的参考,也为呼吸道疾病的有效治疗提供新的思路。本研究以阿克苏地区卡拉库尔羊为研究对象,利用基因组测序技术,对绵羊呼吸系统微生物细、真菌群落结构进行研究。试验采集有明显病变的绵羊肺脏组织样品,并以健康绵羊作为对照;将完整呼吸系统细分为鼻腔、气管上端、气管下端以及肺脏四个部位,进行样本的分别采集;鼻腔取鼻拭子样品,其它部位则取呼吸道粘液样品,检测相应部位细、真菌群的分布状况。结果表明:从38份样品中,共检出细菌2界27门44纲98目178科462属;真菌则1界16门47纲114目264科494属。健康绵羊呼吸系统优势细菌种依次为Acinetobacter lwoffii、Psychrobacter faecalis（粪肠球菌）、Lacto bacillus iners（乳酸乳杆菌）、Moraxella ovis（羊莫拉菌）、Acinetobacter haem...
【文章来源】：塔里木大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：54 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
绵羊肺脏组织样品Fig.2-1Lungorganizationsamplesofsheeps
塔里木大学硕士学位论文第二章绵羊呼吸道微生物结构及相关疾病病原的探究162.2结果2.2.1基因组检测结果图利用细菌、真菌通用及特异性引物，分别对不同的样品基因组进行初步效果的检测；PCR扩增完成后，进行1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定，部分电泳结果展示如下（图2-2）。图2-2基因组DNA效果检测Fig.2-2EffectdetectionofgenomicDNA注：M：marker2000；1-24：基因组样品2.2.2OTUs注释结果分析2.2.2.1OTUs结果分析根据有效OTUs值，我们分析了不同分类水平下，呼吸系统四个部位（鼻腔、气管上端、气管下端以及肺脏）细菌、真菌分布情况。从8个鼻拭子样本、10个气管上端、10个下端以及10个肺脏样品中分别测得了细、真菌群的分布。结果表明：细菌为2界27门44纲98目178科462属；真菌则为1界16门47纲114目264科494属。2.2.2.2物种丰度柱形图由物种丰度柱形图可知，在门水平上，健康绵羊整个呼吸系统微生物相对丰度前15的共有优势细菌为：Proteobacteria（变形菌门）、Firmicutes（硬壁菌门）、Bacteroidetes（拟杆菌门）、Actinobacteria（放线菌门）、Fibrobacteres（纤维杆菌门）、Acidobacteria（酸杆菌门）、Gemmatimonadetes（芽单胞菌门）、Cyanobacteria（蓝藻细菌门）、Chloroflexi（绿弯菌门）、Verrucomicrobia（疣微菌门）、Fusobacteria（梭杆菌门）；另外，不同生理部位存在差异优势菌为Nitrospirae（硝化螺旋菌门，除肺脏）、Melainabacteria（除
塔里木大学硕士学位论文 第二章 绵羊呼吸道微生物结构及相关疾病病原的探究a（黑粉菌属，仅鼻腔和肺脏）、Byssochlamys（丝衣霉菌属，除上端）、Pseudogymnoascus（除上端）；与 K 组相比，Aspergillus（曲霉属）明显增多（图 2-4B）。A
本文编号：2965637
【文章来源】：塔里木大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：54 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
绵羊肺脏组织样品Fig.2-1Lungorganizationsamplesofsheeps
塔里木大学硕士学位论文第二章绵羊呼吸道微生物结构及相关疾病病原的探究162.2结果2.2.1基因组检测结果图利用细菌、真菌通用及特异性引物，分别对不同的样品基因组进行初步效果的检测；PCR扩增完成后，进行1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定，部分电泳结果展示如下（图2-2）。图2-2基因组DNA效果检测Fig.2-2EffectdetectionofgenomicDNA注：M：marker2000；1-24：基因组样品2.2.2OTUs注释结果分析2.2.2.1OTUs结果分析根据有效OTUs值，我们分析了不同分类水平下，呼吸系统四个部位（鼻腔、气管上端、气管下端以及肺脏）细菌、真菌分布情况。从8个鼻拭子样本、10个气管上端、10个下端以及10个肺脏样品中分别测得了细、真菌群的分布。结果表明：细菌为2界27门44纲98目178科462属；真菌则为1界16门47纲114目264科494属。2.2.2.2物种丰度柱形图由物种丰度柱形图可知，在门水平上，健康绵羊整个呼吸系统微生物相对丰度前15的共有优势细菌为：Proteobacteria（变形菌门）、Firmicutes（硬壁菌门）、Bacteroidetes（拟杆菌门）、Actinobacteria（放线菌门）、Fibrobacteres（纤维杆菌门）、Acidobacteria（酸杆菌门）、Gemmatimonadetes（芽单胞菌门）、Cyanobacteria（蓝藻细菌门）、Chloroflexi（绿弯菌门）、Verrucomicrobia（疣微菌门）、Fusobacteria（梭杆菌门）；另外，不同生理部位存在差异优势菌为Nitrospirae（硝化螺旋菌门，除肺脏）、Melainabacteria（除
塔里木大学硕士学位论文 第二章 绵羊呼吸道微生物结构及相关疾病病原的探究a（黑粉菌属，仅鼻腔和肺脏）、Byssochlamys（丝衣霉菌属，除上端）、Pseudogymnoascus（除上端）；与 K 组相比，Aspergillus（曲霉属）明显增多（图 2-4B）。A
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